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Un nouveau cluster de recherche vise à utiliser la spectrométrie de masse pour fournir des informations sur la médecine des systèmes

par Ma Clinique
29 février 2020
dans Actualités médicales
Temps de lecture : 3 min

Le Centre médical de l'Université de Mayence et l'Université Johannes Gutenberg de Mayence (JGU) mettent en place le cluster de recherche interdisciplinaire (« Forschungskern ») intitulé « Médecine des systèmes basée sur l'acquisition indépendante des données (DIASyM): Spectrométrie de masse pour le phénotypage profond à haut débit du syndrome d'insuffisance cardiaque » « . Faisant partie de la stratégie de haute technologie 2025 du gouvernement allemand, le cluster vise à utiliser la spectrométrie de masse de pointe pour fournir de nouvelles perspectives en médecine des systèmes. Le ministère fédéral allemand de l'éducation et de la recherche (BMBF) financera DIASyM au cours de la première phase du projet de trois ans avec 6,8 millions d'euros.

Dirigée par le professeur Stefan Tenzer, professeur de protéomique quantitative, et le professeur Philipp Wild, professeur d'épidémiologie clinique et de médecine des systèmes au centre médical de l'Université de Mayence, l'équipe basée à Mayence développera des méthodes innovantes et des outils analytiques pour fournir une base pour la poursuite des progrès dans recherche médicale et sanitaire. À l'aide de la spectrométrie de masse, il est possible d'étudier les interactions des composants cellulaires pertinents pour la maladie. Les données biologiques moléculaires ainsi acquises seront analysées à des fins de médecine systémique afin de mieux comprendre les processus physiologiques et pathologiques complexes dans le corps dans son ensemble. Les chercheurs ont l'intention d'utiliser leurs découvertes pour faciliter les diagnostics précoces et promouvoir le développement de traitements plus précis avec moins d'effets secondaires, favorisant ainsi l'avancée de la médecine personnalisée.

Les chercheurs impliqués prévoient que l'utilisation de technologies de pointe fournira des découvertes révolutionnaires, à la fois techniques et scientifiques. « Jusqu'à présent, la spectrométrie de masse n'a joué qu'un rôle mineur dans le diagnostic médical et est loin d'atteindre son potentiel », a déclaré le professeur Stefan Tenzer, qui coordonne la plate-forme technologique de spectrométrie de masse et la recherche sur les méthodes du nouveau cluster de recherche DIASyM. Cela est principalement dû à la fois à l’absence de protocoles standardisés pour les techniques à haute résolution et à la nature des dispositifs existants, qui ne sont souvent pas adaptés à l’analyse d’un grand nombre d’échantillons. Les chercheurs de Mayence se concentrent particulièrement sur l'amélioration des techniques de spectrométrie de masse utilisées pour étudier les composants protéiques, les produits métaboliques et les lipides dans le sang.

Au cours des premières années du programme de recherche, les chercheurs se concentreront sur une question en particulier: quels sont les mécanismes qui influencent l'évolution des différentes formes d'insuffisance cardiaque? Trouver la réponse à cette question est crucial, car 15 millions de personnes en Europe souffrent d'insuffisance cardiaque. C'est la cause d'hospitalisation la plus courante chez les personnes de plus de 65 ans et les chances de survie à long terme ne sont pas particulièrement bonnes. Il existe également différents types d'insuffisance cardiaque, certains patients répondant mal ou pas du tout à certains traitements. Ainsi, la maladie fait peser une charge considérable sur le système de santé.

L'équipe DIASyM de Mayence adoptera une approche méthodologique: Premièrement, elle enregistrera une large gamme de paramètres sanguins chez les patients souffrant d'insuffisance cardiaque en utilisant la spectrométrie de masse. Ces données seront obtenues dans une étude observationnelle à grande échelle et seront évaluées de manière comparative avec des données similaires obtenues auprès d'individus en bonne santé. Ensuite, les chercheurs analyseront l'énorme volume de données résultant en utilisant une approche de médecine des systèmes.

Une approche systémique nous permettra de mieux comprendre et expliquer les interactions entre processus biologiques. À cette fin, nous intégrerons plusieurs niveaux de données dans nos analyses et inclurons, par exemple, les facteurs génétiques et les profils des protéines et des métabolites dans le sang. Nous intégrerons également des données enregistrées par des dispositifs médicaux et des informations sur l'état de santé clinique des patients. Ensemble, tous ces éléments nous fourniront une base pour développer de nouvelles approches de diagnostic, de thérapie et de prévention de la maladie. « 

Professeur Philipp Wild, qui est le coordinateur de la médecine des systèmes de DIASyM

Le cluster de recherche DIASyM rassemble des biologistes, des informaticiens, des bioinformaticiens, des épidémiologistes et des médecins du Centre médical de l'Université de Mayence et de l'Université Johannes Gutenberg de Mayence, qui emploieront et développeront des techniques de pointe à partir de l'intelligence artificielle telle que la machine. l'apprentissage et, en particulier, l'apprentissage en profondeur. Les scientifiques utiliseront ces techniques pour identifier des substances spécifiques appelées biomarqueurs. Ceux-ci peuvent fournir des indices quant à savoir si un patient développe une insuffisance cardiaque et, dans l'affirmative, quel type d'insuffisance cardiaque est impliqué. En conséquence, ils devraient être en mesure de développer des approches de traitement spécifiques, voire même individualisées, qui pourraient être lancées à un stade relativement précoce au cours de la maladie.

Le cluster de recherche DIASyM est l'une des premières collaborations de recherche interdisciplinaire à Mayence combinant des groupes de recherche en sciences médicales (Dr Laura Bindila, Professeur Stefan Tenzer, Professeur Philipp Wild), biologie (Professeur Miguel Andrade) et informatique (Professeur Andreas Hildebrandt, professeur Stefan Kramer). Pour poursuivre ses objectifs de grande envergure, le cluster de recherche DIASyM recrutera de nouveaux membres du personnel académique et établira probablement deux groupes de recherche juniors et des chaires associées. Outre le consortium de Mayence, le ministère fédéral allemand de l'Éducation et de la Recherche soutient trois autres pôles de recherche allemands en spectrométrie de masse, à Berlin, Heidelberg et Munich, avec un financement total de 25,6 millions d'euros dans la première phase de financement.

La source:

Johannes Gutenberg Universitaet Mainz

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