IntelliGenes, un logiciel unique en son genre créé chez Rutgers Health, combine des approches d’intelligence artificielle (IA) et d’apprentissage automatique pour mesurer l’importance de biomarqueurs génomiques spécifiques afin d’aider à prédire les maladies chez les individus, selon ses développeurs.
Une étude publiée dans Bioinformatique explique comment IntelliGenes peut être utilisé par un large éventail d’utilisateurs pour analyser des données multigénomiques et cliniques.
Zeeshan Ahmed, auteur principal de l’étude et membre du corps professoral de l’Institut Rutgers pour la santé, les politiques de soins de santé et la recherche sur le vieillissement (IFH), a déclaré qu’il n’existe actuellement aucun outil d’IA ou d’apprentissage automatique disponible pour étudier et interpréter le génome humain complet, en particulier pour les non-experts. Ahmed et les membres de son laboratoire Rutgers ont conçu IntelliGenes Ainsi, tout le monde peut utiliser la plateforme, y compris les étudiants ou ceux qui n’ont pas de solides connaissances en techniques bioinformatiques ou n’ont pas accès à des ordinateurs très performants.
Le logiciel combine des méthodes statistiques conventionnelles avec des algorithmes d’apprentissage automatique de pointe pour produire des prédictions personnalisées pour les patients et une représentation visuelle des biomarqueurs importants pour la prédiction des maladies.
Dans une autre étude, publiée dans Rapports scientifiquesles chercheurs ont appliqué IntelliGenes pour découvrir de nouveaux biomarqueurs et prédire les maladies cardiovasculaires avec une grande précision.
Il existe un énorme potentiel dans la convergence des ensembles de données et dans les développements stupéfiants de l’intelligence artificielle et de l’apprentissage automatique. »
Zeeshan Ahmed, auteur principal de l’étude, professeur adjoint de médecine, Robert Wood Johnson Medical School
« IntelliGenes peut prendre en charge une détection précoce personnalisée des maladies courantes et rares chez les individus, ainsi qu’ouvrir des voies pour une recherche plus large conduisant finalement à de nouvelles interventions et traitements.
Les chercheurs ont testé le logiciel à l’aide d’Amarel, le cluster de calcul haute performance géré par le Rutgers Office of Advanced Research Computing. Le bureau fournit un environnement informatique et de données de recherche aux chercheurs de Rutgers engagés dans des projets informatiques complexes et gourmands en données.
Les coauteurs de l’étude comprennent William DeGroat, Dinesh Mendhe, Atharva Bhusari et Habiba Abdelhalim de l’IFH et Saman Zeeshan du Rutgers Cancer Institute du New Jersey.