Réseau de mosaïcisme somatique à travers les tissus humains (SMaHT) du Fonds commun des NIH
Les National Institutes of Health lancent un nouveau programme, le réseau SMaHT (Somatic Mosaicism Across Human Tissues) du Fonds commun, qui vise à transformer nos connaissances sur l’ampleur de la variation génétique dans les cellules et les tissus de notre corps. Le mosaïcisme somatique est un type de variation génétique qui survient lorsque nos cellules somatiques (non reproductrices) sont génétiquement différentes les unes des autres. Cette variation génétique somatique se produit lorsque certaines de nos cellules accumulent des changements d’ADN au fil du temps. Le mosaïcisme somatique peut modifier le fonctionnement des cellules et peut influencer le développement humain, la maladie, le vieillissement et d’autres mesures physiologiques tout au long de la vie. Le réseau SMaHT, avec des prix totalisant 140 millions de dollars sur cinq ans, en attendant la disponibilité des fonds, cherche à découvrir et à cataloguer l’étendue du mosaïcisme somatique dans les tissus humains.
« Comme le mosaïcisme somatique peut survenir dans n’importe quel type de cellule de notre corps, il pourrait avoir des impacts considérables sur notre santé. L’étendue de la portée du mosaïcisme le rend difficile à gérer pour un seul institut ou centre des NIH« , a déclaré Robert Eisinger, Ph.D, directeur par intérim de la Division de la coordination des programmes, de la planification et des initiatives stratégiques des NIH, qui fournit un soutien financier et une direction conjointe du réseau via le Fonds commun des NIH. « Cela fait de l’étude du mosaïcisme somatique un bon choix pour un programme du Fonds commun des NIH, puisqu’il a été créé pour catalyser la recherche dans le cadre de la vaste mission des NIH.. »
Bien que le mosaïcisme somatique puisse se produire dans tous les tissus, soit un contributeur majeur au cancer et puisse être causé à la fois par des expositions extérieures et par les processus biologiques internes d’une personne, son impact total sur la santé humaine et la maladie est inconnu. En cataloguant le mosaïcisme somatique dans les tissus humains normaux, le réseau SMaHT fournira des connaissances fondamentales qui permettront la recherche sur le rôle que la variation génétique somatique joue dans le développement et le vieillissement humains, ainsi que sur un large éventail de maladies et de troubles, y compris les maladies et troubles non diagnostiqués. du cerveau, des muscles, de la peau et du système immunitaire. De plus, étant donné la contribution des mutations des cellules somatiques au cancer, cet effort a le potentiel de soutenir l’objectif du président Biden de mettre fin au cancer tel que nous le connaissons dans le cadre du Cancer Moonshot.
Le réseau SMaHT s’appuie sur d’autres projets phares, comme le projet du génome humain et le programme d’épigénomique du Fonds commun, en surmontant les défis liés à l’étude de parties de notre ADN qui ont longtemps contrecarré les outils traditionnels de séquençage de l’ADN. Par exemple, des modifications génétiques spécifiques aux cellules et aux tissus se produisent souvent dans de rares populations de cellules et peuvent exister dans des régions d’ADN répétitives difficiles à caractériser de manière fiable. En outre, l’étendue du mosaïcisme somatique chez l’homme peut être influencée par le moment relatif du changement génétique. Le réseau SMaHT développera des technologies de pointe pour mieux détecter le mosaïcisme somatique dans différents types de cellules et tissus et à travers les étapes de la vie humaine.
Walter Koroshetz, MD, directeur de l’Institut national des troubles neurologiques et des accidents vasculaires cérébraux (NINDS) des NIH, a noté que « les technologies avancées pour identifier les mutations somatiques, y compris celles dues au mouvement d’éléments transposables ou de soi-disant » gènes sauteurs « , au fil du temps, conduire à une nouvelle compréhension des troubles liés à l’âge. »
Le NIH a décerné 22 prix pour établir le réseau SMaHT, les composants comprennent :
- Centre d’approvisionnement pour collecter un ensemble commun de 10 à 15 tissus provenant de 150 donneurs humains post-mortem
- Des centres de caractérisation du génome pour identifier et décrire la diversité des variations génétiques somatiques dans les tissus
- Centre d’analyse de données pour créer un catalogue de cette variation génétique somatique et un atelier de données pour visualiser et analyser la variation qui s’intégrera aux outils et bases de données génétiques existants
- Projets de développement d’outils pour créer de nouvelles technologies de séquençage et d’analyse de l’ADN qui relèvent les défis de la détection de changements génétiques rares qui se produisent dans des régions de séquences d’ADN répétitives et dans de petites populations de cellules
- Centre organisationnel pour coordonner les activités du Réseau et distribuer les ressources du Réseau à la communauté de recherche.
Pour assurer une représentation diversifiée, le réseau SMaHT prélèvera des échantillons de tissus à partir d’un groupe de donneurs humains qui comprennent diverses ascendances et différentes étapes de la vie. L’ensemble commun de tissus à prélever sur chaque donneur représentera différents types de tissus dans tout le corps et comprendra probablement des échantillons provenant du cerveau, du sang, de la peau, des muscles, du côlon, de la rate, de l’utérus, du canal déférent, des ovaires et des testicules.
Le réseau SMaHT est un effort à l’échelle du NIH géré en collaboration par le NIH Common Fund, le National Human Genome Research Institute, le National Institute on Drug Abuse, le National Institute of Environmental Health Sciences, le National Institute of Mental Health et le NINDS.
