Étude : Prévalence et répartition des génotypes de la maladie à Orthohantavirus humain aux États-Unis, 2008-2020 : une étude observationnelle rétrospective. Crédit photo : CI Photos / Shutterstock
Des scientifiques des Centres pour le contrôle et la prévention des maladies (CDC) des États-Unis ont mené une étude pour déterminer la prévalence et la distribution des génotypes de la maladie humaine à Orthohantavirus aux États-Unis.
L'étude est publiée dans Santé régionale de The Lancet.
Sommaire
Arrière-plan
Les hantavirus sont des virus multisegments à polarité négative qui infectent généralement les rongeurs. Cependant, une infection par hantavirus peut se propager chez l'homme après exposition aux excréments de rongeurs infectés ou à la suite de morsures de rongeurs. La transmission interhumaine n'a été documentée que pour une seule espèce virale, à savoir : Orthohantavirus andésenseen Amérique du Sud.
Les hantavirus de l'Ancien Monde circulent principalement en Europe et en Asie et sont connus pour provoquer une fièvre hémorragique à hantavirus avec syndrome rénal. En revanche, les hantavirus du Nouveau Monde circulent principalement en Amérique du Nord et du Sud et sont connus pour provoquer un syndrome cardiopulmonaire à hantavirus.
Actuellement, l'infection par le hantavirus est une maladie nationale aux États-Unis. Les services de santé de divers coins du pays signalent les cas d'infection aiguë par le hantavirus au registre national de surveillance du hantavirus du CDC. Cependant, l'étude a mis en évidence un défi important : le manque de tests sérologiques ou PCR standardisés aux États-Unis, ce qui a conduit à des résultats discordants entre les tests développés par le CDC et les tests de diagnostic commerciaux.
Les critères de déclaration des cas positifs sont basés sur les symptômes cliniques et les résultats de diagnostic en laboratoire, notamment l'immunoglobuline M (IgM) positive, l'IgG positive avec des titres en hausse, l'immunohistochimie positive ou la réaction en chaîne par polymérase (PCR) positive.
Les tests de référence du CDC ont révélé que des résultats faussement positifs aux IgM ont été observés à partir de tests de diagnostic commerciaux. Cela suggère que certains cas aigus d'hantavirus peuvent être surestimés dans les États qui ne confirment pas les résultats positifs avec des tests de référence.
Dans cette étude observationnelle, les scientifiques ont déterminé la prévalence et la distribution des génotypes de la maladie à hantavirus humain aux États-Unis de 2008 à 2020.
Conception de l'étude
Les scientifiques ont analysé plusieurs ensembles de données, notamment les cas aigus d'hantavirus signalés par les services de santé de 1993 à 2020 et de 2008 à 2020, ainsi que les tests de diagnostic aigus et convalescents d'hantavirus effectués au CDC de 2008 à 2020.
Des échantillons suspects d'hantavirus soumis au CDC ont été testés pour le Nouveau Monde Orthohantavirus- et l'Ancien Monde (OW) Orthohantavirus-anticorps IgM réactifs (échantillons aigus) et IgG (échantillons convalescents). Un aspect essentiel de l'étude a été le séquençage des échantillons positifs à l'hantavirus pour identifier les variantes virales spécifiques et leur distribution géographique.
Les échantillons positifs au hantavirus ont été analysés à l'aide d'un séquençage de nouvelle génération, et les ensembles de données épidémiologiques et génétiques disponibles ont été liés pour mener une étude épidémiologique génomique de la maladie à hantavirus aux États-Unis.
Observations importantes
Entre 1993 et 2020, 833 cas d'hantavirus humain ont été détectés aux États-Unis, et 335 cas ont été détectés entre 2008 et 2020. Parmi ceux-ci, le CDC a identifié 115 échantillons positifs à l'hantavirus du Nouveau Monde, ce qui représente 29,2 % du total des cas détectés.
Parmi ces cas, 98 ont été signalés par les services de santé des États, des tribus, des collectivités locales et des territoires. Cela représente 29 % du total des cas confirmés de maladie aiguë signalés par les services de santé.
Parmi les cas d'hantavirus du Nouveau Monde identifiés par le CDC, environ 85 % ont été détectés au cours de la phase aiguë de la maladie. Cependant, certains cas de convalescence ont été détectés dans le Connecticut, le Missouri, le New Jersey, la Pennsylvanie, le Tennessee et le Vermont. Ces régions n'étaient généralement pas associées à des infections à hantavirus.
Parmi les cas d'hantavirus détectés aux États-Unis entre 1993 et 2020, environ 95 % ont été identifiés dans l'ouest du Mississippi et 45 % dans la région des Four Corners. Certains cas ont également été identifiés dans les régions du Midwest supérieur, du centre de l'Atlantique et du Nord-Est. En revanche, seuls quelques cas ont été identifiés dans les régions du Sud-Est.
Parmi les cas d’hantavirus du Nouveau Monde détectés entre 2008 et 2020, environ 68 % sont survenus entre mars et août.
L'étude a également identifié des variantes virales spécifiques associées à des régions géographiques distinctes. La répartition géographique de Orthohantavirus sans nom L'espèce a été déterminée par séquençage des cas positifs à la PCR. Cela a conduit à la détection du virus Sin Nombre principalement à l'ouest des fleuves Mississippi et Ohio, du virus Monongahela dans les régions du nord-est et du centre de l'Atlantique, et du virus New York à Long Island. Cependant, il y avait une lacune importante dans les données de séquence virale du nord-ouest et du centre des États-Unis. Un seul cas d'infection par le virus Sin Nombre a été identifié dans l'Indiana.
Importance de l'étude
L’étude fournit une vue actualisée de la répartition spatiale et temporelle des cas humains d’hantavirus aux États-Unis.
Près de 95 % des cas ont été identifiés à l’ouest du Mississippi entre mars et août. En revanche, seuls 45 % ont été identifiés dans la région des Four Corners du Sud-Ouest, traditionnellement associée aux infections à hantavirus.
L'étude souligne la nécessité de disposer d'algorithmes de tests de diagnostic plus standardisés aux États-Unis afin de réduire les discordances entre les différentes méthodes de test. Une faible prévalence de la maladie à hantavirus a été observée dans le sud-est et le centre-atlantique inférieur des États-Unis. Cela pourrait être dû à un manque de cas humains de débordement ou à une sous-déclaration ou à un sous-test des cas humains en raison d'infections bénignes ou asymptomatiques.
Étant donné que ces régions se trouvent dans le territoire d’origine des rongeurs vecteurs connus du virus Hantavirus, une surveillance rigoureuse des cas humains transmissibles est nécessaire pour prévenir les menaces potentielles pour la santé publique. L’étude souligne la nécessité de disposer d’algorithmes de tests de diagnostic plus standardisés aux États-Unis pour réduire les discordances entre les différentes méthodes de test.
