Dans une étude récente publiée dans Frontières en médecine, les chercheurs ont étudié les signatures d’expression génique et l’implication des cellules immunitaires dans l’endométrite chronique (CE) pour des marqueurs de diagnostic potentiels et des informations sur sa physiopathologie.
Étude: Signatures d’expression génique associées à l’endométrite chronique révélées par séquençage d’ARN. Crédit image : Peakstock/Shutterstock.com
Sommaire
Arrière-plan
CE est une affection inflammatoire de l’endomètre utérin généralement causée par des infections intra-utérines. Bien qu’asymptomatique, la CE est liée à un échec d’implantation et à une fausse couche, nécessitant un diagnostic et un traitement précis pour améliorer les taux de grossesse dans les traitements de fertilité.
Le CE est histologiquement caractérisé par une infiltration de plasmocytes dans le stroma endométrial. Un test clinique fiable, la coloration immunohistochimique des clusters de différenciation 138 (CD138), est utilisé en plus de l’examen histologique régulier pour le diagnostic.
Cependant, les critères de diagnostic pour les cellules CD138-positives manquent d’uniformité, conduisant à des résultats incohérents. Le rôle de CD138 en tant que marqueur de l’inflammation induite par l’infection dans l’endomètre reste débattu.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, 190 patients ont été inscrits, tous jugés en bonne santé entre juillet 2020 et avril 2021. Les patients qui avaient pris des antibiotiques au cours des trois mois précédents ont été exclus de l’étude pour garantir l’exactitude des données. Le diagnostic de CE a été établi en utilisant la coloration immunohistochimique CD138.
Pour l’analyse de séquençage de l’acide ribonucléique (ARN), les chercheurs ont sélectionné au hasard un sous-ensemble de patients des groupes CE et non CE. Ils se sont assurés qu’au moins 30 patients étaient dans chaque groupe pour une meilleure analyse statistique.
Pour obtenir des données de transcriptome à partir des tissus de l’endomètre, l’ARN total a été extrait à l’aide d’un protocole standardisé. Les bibliothèques de séquençage d’ARN ont été préparées et les échantillons ont été séquencés à l’aide de la plateforme HiSeq X. Les lectures de séquence résultantes ont ensuite été alignées sur un ensemble fasta de transcription Homosapien, et les niveaux d’expression génique ont été analysés.
Les chercheurs ont effectué des analyses statistiques pour comparer les informations cliniques entre les groupes CE et non CE, fournissant des informations précieuses sur les caractéristiques et les différences des patients atteints de CE.
En outre, la réaction quantitative en chaîne par polymérase de transcription inverse (PCR) a été utilisée pour valider l’expression d’un gène spécifique, la protéine vésiculaire du réseau trans-Golgi 23 (TVP23A), qui peut avoir des implications potentielles dans la CE.
Les chercheurs ont également effectué une analyse des cellules immunitaires sur les tissus de l’endomètre. En utilisant l’algorithme CIBERSORT (Cell-type Identification by Estimating Relative Subsets of RNA Transcripts), ils ont estimé les proportions de 22 types différents de cellules immunitaires dans les tissus endométriaux CE et non CE.
Résultats de l’étude
Les résultats ont montré que, sur 123 patients, 67 ont été exclus en raison d’une antibiothérapie ou d’une hormonothérapie récente, laissant 57 patients. L’EC a été diagnostiquée à l’aide de la coloration immunohistochimique du CD138, avec 24 patients classés comme EC (nombre de CD138 ≥ 5) et 33 comme non EC (nombre de CD138 < 5).
L’analyse de séquençage de l’ARN effectuée sur les tissus endométriaux de 33 patientes CE et 24 patientes non CE a donné 20 millions de paires de lecture. L’analyse différentielle de l’expression génique a identifié 20 gènes régulés positivement dans le groupe CE, principalement liés aux immunoglobulines, et un gène constamment élevé, TVP23A, dans les échantillons CE.
Les chercheurs ont analysé des échantillons prélevés au cours des phases prolifératives et sécrétoires. Treize gènes ont été régulés positivement dans le groupe CE au cours de la phase proliférative, y compris les gènes d’immunoglobuline, le domaine enroulé enroulé contenant 13 (CCDC13) et la zone marginale B1 (MZB1).
Dans la phase de sécrétion, huit gènes ont été régulés positivement dans le groupe CE et les gènes non immunoglobulines.
L’analyse CIBERSORTx a montré que les plasmocytes étaient plus abondants dans les échantillons CE, tandis que les grappes de lymphocytes T mémoire de différenciation 4 (CD4) (au repos) étaient moins abondantes dans les échantillons CE par rapport aux modèles non CE.
Discussion
L’étude a identifié des gènes régulés positivement dans l’endomètre CE par rapport à l’endomètre non CE, y compris 12 gènes non immunoglobulines et 13 gènes d’immunoglobuline. Fait intéressant, la proportion de gènes liés à l’immunoglobuline parmi les gènes différentiellement exprimés (DEG) variait entre les phases proliférative et sécrétoire, suggérant des signatures d’expression génique spécifiques à la phase potentielles associées à la CE.
Les résultats ont également signalé l’identification du gène TVP23A en tant que nouveau marqueur spécifique CE. Contrairement à d’autres gènes identifiés, TVP23A était systématiquement régulé positivement dans la plupart des cas de CE, quel que soit le nombre de cellules CD138-positives. Le rôle potentiel de ce gène dans la physiopathologie de l’EC et sa spécificité en font un candidat prometteur pour les marqueurs diagnostiques.
De plus, l’analyse des populations de cellules immunitaires dans l’endomètre CE a révélé une abondance accrue de plasmocytes et une diminution de l’abondance des lymphocytes T mémoire CD4 par rapport à l’endomètre non CE.
Les populations de cellules immunitaires altérées peuvent être attribuées à une inflammation chronique des tissus CE, entraînant des réponses de lymphocytes T à mémoire compromises.
conclusion
Pour résumer, l’étude a identifié 12 gènes non-immunoglobulines et 13 gènes d’immunoglobuline avec une expression élevée dans la CE, principalement attribuée à la présence de plasmocytes.
Cependant, le gène TVP23A a montré une régulation à la hausse constante dans la plupart des cas de CE, ce qui en fait un nouveau marqueur diagnostique potentiel pour la CE. Le séquençage de l’ARN a fourni des informations précieuses sur la physiologie moléculaire de la CE et son rôle potentiel dans l’échec de la reproduction.
