Dans une étude récente publiée dans le PLOS ONE journal, des chercheurs de la Rutgers New Jersey Medical School ont exploré la persistance du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) dans la salive humaine.
Un diagnostic précis et rapide de l’infection par le SRAS-CoV-2 s’est avéré essentiel dans la gestion de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). Les prélèvements salivaires et nasaux sont des méthodes non invasives couramment utilisées pour tester l’infection avec une supervision minimale ou nulle, permettant ainsi l’activité généralisée des tests COVID-19. Plusieurs études réalisées sur des échantillons nasaux et pharyngés ont noté une réduction de l’excrétion virale ainsi qu’une diminution du virus cultivable au cours de la première semaine des symptômes du COVID-19. Cependant, seules quelques études ont évalué la durée pendant laquelle le SRAS-CoV-2 est détecté dans les échantillons salivaires par rapport aux prélèvements nasaux après la première semaine de symptômes.
Étude : Persistance du SRAS-CoV-2 dans la salive : Implications pour le diagnostic de stade avancé et la durée infectieuse. Crédit d’image : Shotmedia / Shutterstock
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont examiné si les tests salivaires détectaient la présence prolongée du SRAS-CoV-2 et l’infectiosité potentielle associée.
L’équipe a comparé la dynamique de la charge virale associée aux échantillons salivaires et nasaux en effectuant une sous-étude dans une étude de groupe observationnelle des techniques thérapeutiques et diagnostiques chez les patients COVID-19. Les participants éligibles étaient des patients inscrits à l’hôpital universitaire du New Jersey. Ces participants étaient âgés de 18 ans ou plus et ont été testés positifs pour le SRAS-CoV-2 par un prélèvement nasopharyngé (NP) et ont consenti à fournir des échantillons nasaux et de salive.
Les participants qui devaient être traités pour COVID-19 au cours de leur hospitalisation ont été surveillés. La sous-étude a impliqué tous les participants de l’étude mère qui ont fourni une durée connue depuis l’apparition des symptômes et un échantillon nasal ainsi qu’un échantillon de salive pendant au moins un point temporel de l’étude. Tous les participants éligibles ont fait partie de l’évaluation globale, qui impliquait une analyse par écouvillonnage salive-nasale appariée référencée au moment de l’apparition des symptômes de la COVID-19. L’étude a recueilli des échantillons tels que de la salive auto-collectée, des écouvillons nasaux antérieurs et des écouvillons NP.
Résultats
De juin 2020 à août 2021, un total de 140 participants ont été recrutés dans l’étude, parmi lesquels 44 personnes ont été exclues. Parmi les 96 patients restants, environ 147 écouvillons nasaux et salivaires ont été évalués en tant qu’observations appariées dans l’ensemble de l’étude. Sur ces 96 participants du groupe d’analyse global, 28 participants ayant plus d’une collecte ponctuelle étaient éligibles pour l’analyse longitudinale.
Parmi les 96 participants du groupe d’analyse global, l’âge moyen des patients était de 54,7 ans, dont 53 % d’hommes et 55 % d’hispaniques. La collecte d’échantillons de référence moyenne a eu lieu sept jours après l’apparition des symptômes. La majorité des participants ont signalé au moins une comorbidité, telle que l’obésité ou l’hypertension, ont été exposés à une autre personne présentant des symptômes du SRAS-CoV-2 ou ont eu besoin d’oxygène supplémentaire pendant leur séjour à l’hôpital.
Les intervalles de temps importants dans l’étude étaient de plus de cinq jours, ce qui représente la période d’isolement la moins recommandée pour le SRAS-CoV-2, et de plus de neuf jours lorsque les patients n’étaient plus considérés comme infectieux par le SRAS-CoV-2 en raison d’un manque de virus cultivable dans spécimens nasaux ou NP. L’équipe a noté que la dyspnée était plus fréquente parmi les cohortes d’intervalle de cinq à neuf jours et de 10 à 14 jours, tandis que tous les autres symptômes étaient comparables entre les cohortes. Les patients étaient plus susceptibles d’avoir besoin d’un soutien en oxygène au cours des périodes ultérieures que les patients au cours des périodes antérieures. De plus, les participants recrutés moins de cinq jours après l’apparition des symptômes étaient plus susceptibles d’être noirs, fumeurs et avaient une incidence plus élevée de maladie rénale chronique.
L’évaluation globale a révélé que les tests de salive ont détecté remarquablement plus d’infections par le SRAS-CoV-2 dans les cinq jours, au-delà de cinq jours, au-delà de neuf jours et au-delà de 14 jours de symptômes du SRAS-CoV-2. De plus, les valeurs médianes globales du Ct cible N2 se sont avérées plus précoces pour les échantillons salivaires que pour les échantillons nasaux. De plus, les valeurs de Ct étaient plus précoces pour les échantillons salivaires que pour les échantillons nasaux pour toutes les périodes, y compris celles après 14 jours de symptômes.
Les taux de positivité du SRAS-CoV-2 cinq jours après l’apparition des symptômes étaient comparables entre les échantillons salivaires et les écouvillons NP. En outre, les valeurs globales de Ct ne variaient pas remarquablement entre les écouvillons de milieu de transport viral (VTM) NP et les échantillons de salive directe. De plus, aucune variation des valeurs médianes de Ct ou du nombre de tests ayant donné des valeurs de Ct inférieures à 30 n’a été notée entre les échantillons de salive et les écouvillons NP pour toutes les périodes évaluées.
Conclusion
Les résultats de l’étude ont mis en évidence les preuves de la détection de la présence prolongée du SRAS-CoV-2 dans les échantillons salivaires par rapport aux échantillons nasaux après la première semaine d’apparition des symptômes, y compris la propagation du virus. Les chercheurs pensent que ces résultats ont soutenu l’inclusion de tests salivaires dans les dernières périodes de l’évolution de la maladie pour améliorer le rendement du diagnostic du SRAS-CoV-2 et le potentiel d’une durée infectieuse orale prolongée en permettant la détection d’une évaluation basée sur la salive dans personnes avec un diagnostic de COVID-19.
