Dans une étude récente publiée dans Les maladies infectieuses du Lancetles chercheurs ont mesuré les titres neutralisants d’échantillons de plasma contre la nouvelle variante préoccupante du coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère (VOC) les sous-variantes BA.4 et BA.5 d’Omicron avec des mutations de l’arginine (Arg)346.
Sommaire
Arrière plan
La région du domaine de liaison au récepteur (RBD) de la glycoprotéine de pointe (S) du SRAS-CoV-2 dans les sous-variantes d’Omicron BA.4 et BA.5 acquiert des mutations en continu. Plusieurs pays ont été témoins de la montée des sous-variantes BA.4/BA.5 avec des mutations Arg346 S, à savoir BA.4.6, BA.5.2.6, BA.4.1.9, BF.7 et BE.1.2. Alors que ces sous-variants mutés d’Omicron ont la mutation Arg346Thréonine (Thr), d’autres, tels que BA.4.7, BF.13 et BA.5.9 hébergent respectivement les mutations Arg346Serine (Ser) et Arg346Isoleucine (Ile).
Notamment, certaines de ces sous-variantes d’Omicron, en particulier BA.4.6, ont ainsi acquis un avantage de croissance par rapport à d’autres, y compris les souches prédécesseurs BA.4 et BA.5. De nombreuses études ont montré que l’Arg346 était un résidu d’acide aminé immunogène important qui confère au SRAS-CoV-2 le potentiel d’échapper aux anticorps neutralisants. Ainsi, il est urgent d’évaluer les médicaments et les vaccins contre les sous-variants Omicron BA.4 et BA.5. Dans ce contexte, il convient également de noter que, contrairement à la mutation Arg en lysine (Lys) dans BA.1.1, les mutations de Arg en Thr, Ser ou Ile ont entraîné un changement de reconnaissance des anticorps plus sévère.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont obtenu des échantillons de plasma d’individus qui avaient reçu trois doses de CoronaVac suite à une percée d’infection par Omicron BA.1, BA.2 ou BA.5 ou sans infection par le SARS-CoV-2. Ils ont collecté des échantillons de plasma trois à cinq semaines après des infections percées confirmées par la réaction en chaîne de transcription inverse-polymérase (RT-PCR).
En outre, l’équipe a utilisé des pseudovirus basés sur le virus de la stomatite vésiculeuse (VSV) dans les essais de neutralisation. À l’aide de ces tests, l’équipe a déterminé les activités de neutralisation des pseudovirus de 11 anticorps monoclonaux et de quatre anticorps cocktails contre les sous-lignées BA.4 et BA.5 mutées par Arg346.
Résultats de l’étude
Les personnes non infectées par le SRAS-CoV-2 qui avaient reçu un schéma thérapeutique à trois doses de CoronaVac ont présenté une diminution de 50 % des titres de neutralisation (NT50) compris entre 1,5 et 1,7. La diminution du nombre de plis était plus prononcée pour les sous-lignées BA.5.9, BA.4.6 et BA.4.7 que BA.4 ou BA.5 puisque la première avait des mutations Arg346Ile, Arg346Thr et Arg346Ser. Les sous-lignées BA.4/BA.5 avec ces mutations pourraient également échapper à la neutralisation par le plasma des cas d’infection percée BA.5. De plus, ils présentaient une diminution de 2,4 à 2,6 fois du NT50. À l’inverse, BA.1.1 avait également un potentiel d’évasion immunitaire car il hébergeait une mutation Arg346Lys similaire à BA.1.
Les chercheurs ont noté des réductions de titre de neutralisation presque identiques pour les convalescents se remettant d’infections BA.1/BA.2. En outre, ils ont découvert que le plasma convalescent BA.5 présentait des titres de neutralisation plus élevés contre BA.5 que BA.1.1 et BA.1. Cependant, le plasma convalescent des cas d’infection percée BA.1, BA.2 et BA.5 était plus efficace contre la souche SARS-CoV-2 ancestrale hébergeant la mutation Asp614Gly. Selon les auteurs, des phénomènes d’empreinte immunitaire ou de péché antigénique originel seraient probablement responsables de ces observations.
Le cilgavimab n’a pas pu neutraliser les sous-lignées BA.4 et BA.5 avec les mutations Arg346Ile, Arg346Thr ou Arg346Ser. Ainsi, le cocktail d’anticorps Evusheld, une combinaison de tixagevimab et de cilgavimab, est resté inefficace contre les sous-lignées BA.4.6, BA.4.7, BA.5.2.6 et BA.5.9. De même, le cocktail REGEN-COV, une combinaison de casirivimab et d’imdevimab, a montré une réactivité réduite contre les sous-lignées mutées par Arg346. Notamment, le bebtélovimab est resté très puissant contre les sous-lignées présentant ces mutations.
conclusion
L’étude actuelle a montré une capacité accrue d’évasion de l’immunité humorale des sous-lignées BA.4 et BA.5 avec des mutations Arg346. Cette observation a deux implications importantes. Premièrement, les sous-lignées Omicron BA.4.6, BA.4.7, BA.5.9, BF.7, BA.5.2.6, BA.4.1.9, BE.1.2 et BF.13 pourraient obtenir un avantage de transmission pendant le COVID-19 en cours. 19 pandémie. Deuxièmement, cette évasion immunitaire pourrait conduire à l’émergence et à la dissémination rapide de plusieurs sous-lignées BA.4 et BA.5 mutées par Arg346.
En plus de cela, il existe une possibilité de réinfections potentielles par BA.4.6 après la guérison d’une infection par BA.4 ou BA.5. De plus, les individus présentant des immunodéficiences ou des comorbidités sont plus à risque de réinfections par les sous-variants d’Omicron. Plus important encore, les auteurs ont mis l’accent sur l’évaluation des vaccins ciblant les sous-variantes BA.4 et BA.5.
