Les chercheurs ont pu identifier et suivre l'échange de gènes entre les bactéries qui leur permettent de devenir résistants aux médicaments, selon une nouvelle étude publiée aujourd'hui dans eLife.
Les résultats ajoutent à notre compréhension de la façon dont cet échange de matériel génétique, également connu sous le nom de transfert horizontal de gènes, se produit dans les bactéries qui causent des infections dans les hôpitaux. Ils soulignent également que si ce transfert est susceptible de se produire fréquemment, il s'agit d'un processus complexe et difficile à étudier avec les méthodes actuelles.
Le transfert horizontal de gènes d'éléments génétiques mobiles permet à des bactéries autrement inoffensives de transmettre des gènes qui résistent aux antibiotiques, les transformant en «superbactéries» résistantes aux médicaments. Cela a conduit à des problèmes importants dans les hôpitaux en particulier, où les bactéries ont exploité la puissance du transfert horizontal de gènes pour devenir résistantes aux antibiotiques et aux désinfectants, leur permettant de provoquer des infections graves chez les patients.
La question de savoir comment empêcher les bactéries d'échanger des gènes de résistance aux médicaments pose un défi aux chercheurs en maladies infectieuses depuis des décennies. Pour relever ce défi, nous devons savoir où et comment ces gènes sont partagés dans les hôpitaux. «
Daniel Evans, premier auteur, spécialiste de la recherche à la Division des maladies infectieuses, Université de Pittsburgh School of Medicine, Pittsburgh, États-Unis
Pour enquêter sur cela, Evans et son équipe ont examiné les génomes de plus de 2 000 isolats bactériens cliniques recueillis dans un seul hôpital pendant 18 mois. Les isolats ont été collectés dans le cadre du projet Enhanced Detection System for Hospital-Acquired Transmission à l'Université de Pittsburgh.
Une fois que l'équipe a identifié des éléments génétiques mobiles possibles dans la bactérie, elle a recherché dans les données de soins aux patients associées aux bactéries qui avaient des éléments d'intérêt pour voir si un transfert horizontal aurait pu se produire à l'hôpital.
Leurs résultats ont déterminé que bon nombre des éléments mobiles trouvés dans l'étude étaient probablement partagés par des bactéries hospitalières. Dans un cas, l'équipe a identifié un plasmide – un morceau d'ADN circulaire trouvé dans des cellules bactériennes – qui codait pour la résistance multidrogue et semblait avoir été transféré horizontalement entre des bactéries infectant deux patients distincts.
« Notre travail montre comment les données de séquence bactérienne du génome entier, qui sont de plus en plus générées en milieu clinique, nous donnent l'occasion d'étudier le transfert horizontal de gènes entre des bactéries résistantes aux médicaments dans les hôpitaux », conclut Daria Van Tyne, auteure principale, professeure adjointe de médecine à la Division des maladies infectieuses, École de médecine de l'Université de Pittsburgh. « Nous espérons que ces résultats, ainsi que de futures études, seront utiles pour la conception de nouvelles stratégies pour prévenir et contrôler les infections bactériennes multirésistantes chez les patients. »
La source:
Référence de la revue:
Evans, D.R., et al. (2020) Détection systématique du transfert horizontal de gènes entre les genres parmi les bactéries multirésistantes dans un seul hôpital. eLife. doi.org/10.7554/eLife.53886.
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