Certaines personnes atteintes de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) développent des symptômes, tandis que d’autres ne le font pas. Dans les populations à haut risque, comme les personnes âgées et celles ayant des problèmes de santé sous-jacents, peuvent éprouver des symptômes plus graves.
Une nouvelle étude menée par des chercheurs de l’Université de Lyon, en France, a noté que certains symptômes du COVID-19 tels que les arythmies cardiaques, la perte d’odorat, les problèmes gastro-intestinaux et la diminution de la consommation d’oxygène peuvent être expliqués par une interférence potentielle de l’ORF7b, qui est une protéine accessoire. trouvé dans le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2), le virus qui cause le COVID-19.
L’étude, publiée dans le journal pré-imprimé medRxiv *, met en évidence les causes potentielles de certains symptômes du COVID-19. Au début de la pandémie, les symptômes caractéristiques du COVID-19 comprennent la toux, la fièvre et l’essoufflement. Au fur et à mesure que la pandémie évoluait, de plus en plus de symptômes sont apparus, tels que la perte d’odorat et de goût, des maux de tête, des problèmes intestinaux et des douleurs abdominales.
Structure du SRAS-CoV-2
Le SARS-CoV-2 contient une protéine de pointe (S) qui se lie au récepteur de l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2) de la cellule hôte, qui agit comme passerelle cellulaire du virus pour infecter la cellule.
Les Coronaviridae sont des virus à ARN monocaténaires enveloppés qui infectent les oiseaux et les mammifères, y compris les humains. La pandémie actuelle est l’une des plus importantes épidémies de l’histoire, infectant plus de 106,61 millions de personnes dans le monde et causant 2,33 millions de morts.
La réplication du coronavirus est facilitée par de nombreuses protéines virales hautement conservées. Les virus codent également pour des gènes accessoires, un groupe censé jouer un rôle central dans la réplication et la pathogenèse du virus.
Le SRAS-CoV-2 a des protéines accessoires, qui sont nécessaires à la réplication virale et peuvent médier la réponse de l’hôte au virus, affectant la pathogénicité et la virulence.
L’ORF7b est une protéine accessoire du SARS-CoV-2, présentant une homologie de séquence de plus de 93% avec une protéine 7b du virus de la chauve-souris. Cette protéine est une protéine accessoire virale putative codée sur l’ARN sous-génomique 7. Des études antérieures ont montré que l’ORF7b n’est pas seulement une protéine accessoire mais un composant structurel du virus SARS-CoV-2.
L’étude
Dans l’étude actuelle, les chercheurs ont utilisé l’ORF7b synthétisé sans cellule et ont révélé que l’ORF7b s’assemble en multimères stables. De plus, la séquence ORF7b montre un segment transmembranaire. Par conséquent, l’équipe pense que cette protéine accessoire a le potentiel d’interférer avec des processus cellulaires importants qui impliquent la formation de leucine-zipper.
Les fermetures à glissière Leucine agissent en régulant le rythme cardiaque via la multimérisation du phospholamban dans les cardiomyocytes. Ensuite, l’adhésion épithéliale cellule-cellule repose sur les E-cadhérines.
L’équipe a noté que les symptômes les plus courants de l’infection par le SRAS-CoV-2, comme les arythmies cardiaques, la perte d’odorat, les problèmes intestinaux et la diminution de la consommation d’oxygène, peuvent être expliqués par une éventuelle interférence de l’ORF7b.
ORF7b a le potentiel d’interférer avec les fonctions cellulaires. a) Dans le muscle cardiaque, SERCA catalyse le transport du Ca2 + à travers la membrane. Le PLN est un inhibiteur de SERCA et régule ainsi le transport du Ca2 +, et finalement la contraction du muscle cardiaque et le rythme cardiaque. PLN se lie à SERCA en tant que monomère, qui est formé d’une manière dépendante de la phosphorylation. ORF7b a le potentiel d’interagir, via sa fermeture éclair à leucine, avec des monomères PLN. b) Les neurones olfactifs présentent des cils dans le mucus. Ils sont soutenus par des cellules sustentaculaires dans l’épithélium. Seules ces cellules de support peuvent être pénétrées par le virus. L’adhésion cellule-cellule entre les mêmes types de cellules et différents types de cellules est médiée par la E-cadhérine. Pour que la E-cadhérine soit adhésive, elle doit se dimériser, notamment via le domaine transmembranaire de la fermeture éclair à leucine. ORF7b a le potentiel d’interférer avec l’adhérence par interaction de sa fermeture éclair à leucine avec celle du domaine transmembranaire de la E-cadhérine. Caricature d’endothélium olfactif adapté de (56).
L’équipe a ajouté que ORF7b forme des multimères robustes, qui sont stabilisés par une fermeture à glissière à leucine. Ils pensent que la forte relation entre l’ORF7b et la fermeture à glissière à leucine fait interagir la protéine virale avec les protéines à glissière à leucine transmembranaires, faisant de l’ORF7b un suspect majeur ou un coupable d’interférence avec les fonctions cellulaires couramment observées dans l’infection par le SRAS-CoV-2.
Plus précisément, nous proposons que l’ORF7b soit un suspect en tant qu’agent causal de l’arythmie cardiaque et de la perte d’odorat, et avance d’éventuelles bases moléculaires », conclut l’équipe.
Les médicaments qui agissent sur ORF7b en contrôlant ses auto-interactions avec les protéines cellulaires peuvent devenir un outil ou une arme important dans la lutte contre le COVID-19.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas examinés par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique / les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
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