Une étude récente publiée sur medRxiv* Le serveur de préimpression a évalué l’impact d’une vaccination antérieure contre le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère sur la réponse immunitaire humaine contre l’infection par SARS-CoV-2 Omicron.
Diverses études ont rapporté une sensibilité plus faible de la variante SARS-CoV-2 Omicron (B.1.1.529) contre les anticorps neutralisants. Par conséquent, il est nécessaire de comprendre le potentiel des infections précédentes par le SRAS-CoV-2 à modifier la réponse immunitaire humaine contre la nouvelle variante d’Omicron.
Étude : La vaccination préalable permet une réponse immunitaire plus robuste à l’infection par Omicron. Crédit d’image : Christoph Burgstedt/Shutterstock
Sommaire
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont comparé les réponses en anticorps et les modifications du transcriptome immunitaire après une infection par le SRAS-CoV-2 Omicron chez des populations vaccinées et non vaccinées présentant des symptômes légers à modérés de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19).
Au total, 57 patients infectés par Omicron ont participé à l’étude, dont 34 personnes sans antécédent de vaccination contre le COVID-19 et 23 personnes qui ont été vaccinées avec deux à trois doses du vaccin Pfizer BioNTech (BNT162b2). Le consentement écrit et éclairé de ces participants a été obtenu. Le recrutement et le prélèvement sanguin ont été effectués entre décembre 2021 et mars 2022.
L’équipe a mesuré les titres terminaux d’anticorps d’immunoglobuline G (IgG) de liaison contre plusieurs antigènes dérivés du SRAS-CoV-2 via la plate-forme de découverte à l’échelle méso (MSD). De plus, les sous-domaines SARS-CoV-2 spike (S), nucleocapsid (N) ainsi que SARS-CoV-2 Alpha, Beta, Gamma, Delta et Omicron variant S ont été testés à l’aide d’échantillons sérologiques prélevés sur les participants. L’équipe a également détecté des anticorps liés dans les échantillons à l’aide d’anticorps IgG anti-humains.
L’inhibition de la liaison de l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2) a été évaluée à l’aide d’un dosage immuno-enzymatique (ELISA) pour quantifier les anticorps qui inhibent la liaison de l’ACE2 aux sous-domaines des protéines de pointe variantes du SRAS-CoV-2. L’équipe a également effectué l’extraction et la purification de l’acide ribonucléique (ARN) et évalué sa concentration et sa qualité.
Les auteurs ont exploré le transcriptome immunitaire pour examiner l’impact d’une vaccination antérieure contre le COVID-19 sur la réponse immunitaire du génome à l’infection par Omicron. Ceci a été réalisé en comparant l’impact des vaccins dans la population de référence qui n’avait aucun antécédent signalé de vaccination ou d’infection par le SRAS-CoV-2 à celui des patients précédemment infectés par la variante Alpha.
L’équipe a comparé les transcriptomes Omicron des cohortes non vaccinées et vaccinées à celui d’une cohorte témoin, composée de 30 individus sains appartenant à la même région géographique. Acide ribonucléique messager [ sequencing (mRNA-seq)] a également été réalisée en purifiant l’ARNm contenant du poly-A via une oligo-hybridation poly-T.
Des échantillons sérologiques obtenus des patients infectés par Omicron dans les deux jours et après 13 jours de diagnostic ont été utilisés pour la mesure des réponses d’anticorps circulants et pour l’évaluation de la capacité de neutralisation contre les protéines de type sauvage du SRAS-CoV-2 et de pointe d’Omicron. L’équipe a également analysé l’activation de l’expression génique chez les patients infectés par Omicron non vaccinés par rapport à celle des patients vaccinés.
Conception de l’étude et analyse des anticorps.une, Présentation schématique du flux de travail expérimental. Les 57 sujets de l’étude ont tous été infectés par la variante SARS-CoV-2 Omicron. Parmi eux, 23 avaient reçu deux ou trois doses de vaccins BNT162b2 et 34 n’étaient pas vaccinés (Tableau S1). Le sang a été prélevé sur les participants à l’étude à deux moments après le test PCR positif. bAnticorps plasma IgG liant le SARS-CoV-2 RBD (pointe) des souches ancestrales et Omicron chez les patients Omicron non vaccinés et vaccinés. c, Réponse des anticorps neutralisants à la protéine de pointe virale des variantes ancestrales et Omicron. La valeur p entre deux groupes provient du test t de rang de Wilcoxon unilatéral. *p < 0,05, **p < 0,01, ***p < 0, ****P < 0,0001. Ligne médiane.
Résultats
Les résultats de l’étude ont montré qu’un à deux jours après le diagnostic d’infection, les niveaux d’IgG anti-pointe étaient les plus bas chez les patients infectés par la souche de type sauvage du SRAS-CoV-2 et la variante Omicron sans antécédents de vaccination ou d’infection. Les taux d’IgG anti-S étaient au moins 10 fois plus élevés chez les patients précédemment vaccinés. Une augmentation substantielle des niveaux d’anticorps anti-Omicron S a été constatée dans le groupe vacciné dans les 13 jours suivant l’infection par Omicron, tandis que les niveaux d’anticorps anti-S de type sauvage n’ont pas montré une telle augmentation. De plus, les niveaux d’anticorps contre toute souche de SRAS-CoV-2 n’ont montré aucune amélioration dans le groupe naïf 13 jours après le diagnostic d’infection.
Réponse anticorps des patients Omicron.uneAnticorps plasma IgG liant le SARS-CoV-2 RBD (spike) de différentes souches chez les patients Omicron non vaccinés et vaccinés. b, Réponse des anticorps neutralisants à la protéine de pointe virale des variantes du SRAS-CoV-2. La valeur p entre deux groupes provient du test t de rang de Wilcoxon unilatéral. *p < 0,05, **p < 0,01, ***p < 0, ****P < 0,0001. Ligne médiane.
L’équipe a constaté une augmentation notable de l’activité neutralisante contre Omicron, en particulier dans la cohorte vaccinée. De même, une augmentation des niveaux d’anti-pointe a été observée contre d’autres variantes du SRAS-CoV-2. De plus, une induction significative de l’expression des gènes 489 et 732 a été trouvée dans le groupe naïf et le groupe vacciné, respectivement, tandis que l’expression génétique des gènes 146 et 246 a été diminuée en conséquence. Notamment, une augmentation de l’expression génique a été observée dans la population infectée par Omicron non vaccinée, qui s’est en outre avérée élevée chez les patients infectés par Alpha.
L’analyse de l’enrichissement de l’ensemble de gènes (GSEA) a associé l’induction de l’expression génique à des réponses immunitaires innées, y compris la signalisation des cytokines et les réponses à l’interféron. Un enrichissement significatif des gènes immunitaires innés a été observé chez les patients hospitalisés infectés par Alpha.
Conclusion
Les résultats de l’étude ont montré qu’une réponse transcriptionnelle marquée a été trouvée chez les individus non vaccinés ; cependant, cette réponse n’a pas été suffisamment exprimée par rapport aux individus vaccinés. Les chercheurs pensent qu’une vaccination antérieure contre le COVID-19 a remarquablement modifié l’expression du transcriptome chez les patients infectés par Omicron avec des réponses anticorps plus puissantes contre le virus. Cependant, les différences entre les cohortes étaient quantitatives plutôt que qualitatives.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
