Une nouvelle étude a démontré une détection sur site rapide et sensible de l’ARN du SRAS-CoV-2 à partir de surfaces environnementales à l’aide d’un appareil de laboratoire portable. L’étude a été publiée dans Spectre de microbiologie, une revue de la Société américaine de microbiologie.
Nos résultats ont des implications prometteuses pour les scénarios dans lesquels l’accès aux laboratoires d’essais est difficile, comme sur les navires de croisière, les voyages internationaux, les îles isolées et les destinations touristiques. Nos méthodes développées pourraient être utilisées pour les tests sur le lieu d’intervention et les applications exigeantes en sensibilité telles que l’évaluation des risques. Dans la perspective d’une seule santé, il est essentiel de garantir l’hygiène alimentaire dans les secteurs de la foresterie, de l’agriculture, de l’aquaculture et de l’élevage jusqu’à la distribution. Cependant, ces industries opèrent souvent loin des laboratoires d’essais commerciaux, soulignant l’importance d’établir des méthodes de détection sur site. »
Kouichi Kitamura, Ph.D., auteur principal de l’étude, Institut national des maladies infectieuses, Tokyo, Japon
Les chercheurs ont mené cette étude pour développer une méthode de détection de virus sur site, principalement pour le SRAS-CoV-2, pour les surfaces environnementales, afin de surveiller les agents pathogènes à l’aide d’appareils portables sans accès aux paramètres de laboratoire. Bien que des méthodes de détection rapide telles que les tests antigéniques et le test d’amplification isotherme à médiation en boucle (LAMP) soient disponibles comme solutions de test au point d’intervention, la PCR est souvent considérée comme la référence en matière de détection d’agents pathogènes avec une sensibilité et une spécificité élevées. « Les appareils PCR portables nous permettent d’exploiter les conditions PCR établies pour détecter divers agents pathogènes, ce qui les rend très précieux », a déclaré Kitamura.
Les chercheurs ont envisagé de détecter les virus présents sur les surfaces fréquemment touchées comme les poignées de porte et les dessus de table. Ils ont mené des expériences en laissant tomber des particules virales non infectieuses, sans s’y limiter au SRAS-CoV-2, sur plusieurs matériaux tels que le plastique et l’acier inoxydable, puis en les laissant sécher et en collectant les particules des surfaces avec des tampons. Ils ont ensuite exploré des méthodes permettant de détecter les virus en utilisant uniquement des équipements portables.
À l’aide de kits d’écouvillonnage disponibles dans le commerce et d’un appareil PCR portable, les chercheurs ont démontré la faisabilité d’une détection rapide du virus sur place. De plus, ils ont développé une méthode pour extraire l’ARN viral à l’aide d’un autre dispositif expérimental portable (une centrifugeuse compacte), permettant une détection sur site très sensible, même pour de très petites quantités de virus.
« Cette étude présente une méthode de détection de virus sur site de bout en bout, allant de la collecte d’échantillons aux tests PCR », a déclaré Kitamura. « Nous encourageons l’adoption de l’approche de test démontrée dans cette recherche, en particulier dans les situations nécessitant des diagnostics rapides à haute sensibilité dans des contextes où l’accès aux laboratoires de tests est limité. »
