Une étude américaine menée dans la région de la capitale nationale a récemment comparé les charges de virus infectieux chez les individus vaccinés et non vaccinés infectés par la variante delta du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2).
L’étude met en évidence que par rapport à la variante alpha qui circulait auparavant, la variante delta est associée à une charge virale infectieuse plus élevée et à un niveau inférieur d’immunité humorale dans les voies respiratoires supérieures. L’étude est actuellement disponible sur le medRxiv* serveur de préimpression avant l’examen par les pairs.
Sommaire
Fond
Avec la progression de la pandémie de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), l’évolution du génome du SRAS-CoV-2 a entraîné l’émergence de variantes virales préoccupantes (COV) qui ont considérablement augmenté la transmissibilité, l’infectiosité et la virulence. L’un de ces COV est la variante delta qui a été détectée pour la première fois en Inde lors de la deuxième vague pandémique. Peu de temps après l’émergence, la variante delta s’est rapidement propagée à l’échelle mondiale et a remplacé la variante alpha qui dominait auparavant.
D’après la littérature disponible, le variant delta est capable d’induire des infections de pointe chez les individus complètement vaccinés, et les infections delta sont associées à des charges virales élevées.
L’étude
Dans la présente étude, les scientifiques ont estimé la prévalence des variantes du SRAS-CoV-2 dans la région de la capitale nationale en analysant le séquençage complet du génome de 2 785 isolats cliniques. De plus, ils ont analysé des cas d’infections delta et alpha pour étudier la gravité de la maladie, la charge virale, la présence de virus infectieux et les niveaux d’infections anti-SRAS-CoV-2 spécifiques aux IgG dans les voies respiratoires supérieures.
Remarques importantes
Au cours de la période d’étude de 6 mois, le séquençage de 2 785 génomes a révélé que la variante delta a progressivement remplacé la variante alpha dans la région de la capitale nationale. Par rapport à la variante alpha, la variante delta a provoqué une induction significative d’infections vaccinales percées. Cependant, la plupart de ces cas révolutionnaires étaient associés à une durée significativement plus longue entre la vaccination et l’infection.
Valeurs de seuil de cycle (Ct) des variantes Alpha, Delta et de contrôle. A) Valeurs Ct des variantes B.1.2 (N = 254), Alpha (N = 562) et Delta (N = 98) de tous les échantillons avec des valeurs Ct disponibles. B et C) Corrélation des valeurs Ct et des plages de jours après le début des symptômes B) 0 à 5 jours, C) > 5 jours. Pour cette analyse, les échantillons de patients asymptomatiques n’ont pas été inclus (N : B.1.2 = 214, Alpha = 511, Delta = 75). D) Valeurs Ct des variants Alpha et Delta ventilées par statut vaccinal. Alpha (non vacciné, N = 442, complètement vacciné N = 42), Delta (non vacciné, N = 47, complètement vacciné N = 23). Pour cette analyse, les échantillons de patients partiellement vaccinés n’ont pas été inclus. E et F) Corrélation des valeurs Ct et des plages de jours après l’apparition des symptômes des variantes Alpha et Delta divisées par le statut vaccinal. E) 0 à 5 jours, F) > 5 jours. ANOVA à un facteur * p < 0,05, ** p < 0,001, ***, p < 0,0001.
Conséquences cliniques
Les variantes alpha et delta étaient associées à des conséquences cliniques comparables en termes d’hospitalisation et de mortalité. Par rapport à une variante du SRAS-CoV-2 circulant auparavant (lignée B.1.2), la variante alpha présentait un nombre significativement plus élevé d’infections symptomatiques, d’hospitalisations et d’admissions en unité de soins intensifs (USI). Cependant, la mortalité liée au COVID-19 est restée similaire pour ces variantes.
Infections chez les personnes vaccinées et non vaccinées
Une fréquence significativement plus élevée d’infections symptomatiques a été observée dans les cas de percée vaccinale avec la variante delta par rapport à celle des cas de percée liée à l’alpha. Cependant, la durée entre la vaccination et la percée de l’infection était considérablement plus élevée pour le variant delta que pour le variant alpha.
Aucune différence significative d’hospitalisation n’a été observée entre les infections alpha et delta chez les individus vaccinés et non vaccinés. Cependant, contrairement aux infections à percée delta, les infections à percée vaccinale avec la variante alpha étaient associées à de multiples comorbidités, notamment l’hypertension, les maladies rénales, l’insuffisance cardiaque et la maladie coronarienne.
Charge virale dans les voies respiratoires supérieures
Parmi les cas de percée vaccinale, les infections delta étaient associées à des charges virales significativement plus élevées que les infections alpha. Cependant, au sein de chaque variante, aucune différence significative de charge virale n’a été observée entre les individus vaccinés et non vaccinés.
De même, plus de virus infectieux ont été détectés chez les individus avec une infection delta par rapport aux cas d’infection alpha. Les individus vaccinés avec des infections à percée alpha ont montré une quantité significativement plus faible de virus contagieux que les individus non vaccinés. En revanche, une quantité équivalente de virus infectieux a été détectée chez des individus vaccinés et non vaccinés atteints d’infections delta.
Immunité humorale dans les voies respiratoires supérieures
Parmi les cas d’infection alpha, des niveaux significativement plus élevés d’anticorps anti-SRAS-CoV-2 spécifiques aux IgG ont été observés chez les individus vaccinés par rapport à ceux des individus non vaccinés.
Dans le cas de l’infection delta, le nombre d’individus avec des niveaux d’anticorps détectables était plus élevé dans le groupe vacciné par rapport au groupe non vacciné. Cependant, aucune différence significative dans le niveau d’anticorps n’a été observée entre les deux groupes.
Il est important de noter que pour les infections à percée alpha et delta, un niveau d’anticorps inférieur dans les voies respiratoires supérieures était associé à une quantité plus élevée de virus infectieux.
Importance de l’étude
Les résultats de l’étude indiquent que la variante delta du SRAS-CoV-2 est capable d’induire une infection symptomatique même chez les individus vaccinés. De plus, les infections Delta sont associées à des charges virales infectieuses plus élevées que les infections alpha. Il est important de noter qu’aucun impact de la vaccination sur la charge virale infectieuse n’a été observé chez les personnes atteintes d’infections delta.
De plus, l’étude met en évidence que le risque de contracter des infections à percée delta augmente avec une augmentation de l’intervalle depuis la dernière vaccination.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.
