Une nouvelle étude dans Biologie et évolution du génome, Publié par Oxford University Press, constate que le virus africain de la fièvre porcine, qui circule actuellement en Europe, n'est pas le résultat d'une introduction récente. Au lieu de cela, le virus est présent dans la région depuis 2007. Sa propagation dramatique actuelle semble être motivée en grande partie par des personnes en Europe parcourant de plus longues distances.
Le virus de la fièvre porcine africaine est un virus d'ADN très virulent qui provoque une maladie hémorragique grave du même nom affectant à la fois les porcs domestiques et les sangliers. La maladie se caractérise par des taux de mortalité élevés, entraînant des pertes économiques importantes dans l'industrie du porc. Selon les estimations de l'Organisation des aliments et de l'agriculture, le virus a entraîné environ 2,1 milliards de dollars de pertes économiques directes au cours des 17 dernières années. De plus, l'épidémie a détruit de nombreuses petites et moyennes fermes, contribuant aux transformations structurelles sur les marchés agricoles, notamment en Chine. Actuellement, il n'y a pas de vaccin contre le virus disponible largement.
Initialement limité à la région d'Afrique subsaharienne, le virus (en particulier le génotype II) s'est propagé à l'échelle mondiale et est désormais une préoccupation majeure en Afrique, en Europe, en Asie, au Pacifique et, plus récemment, aux Caraïbes. En 2024, l'Organisation mondiale de la santé animale a signalé des épidémies de virus africains de la fièvre porcine dans sept pays européens, avec plus d'un million de porcs perdus depuis 2022.
Les chercheurs ont analysé dix échantillons de porcs domestiques et de sangliers, recueillis entre le 26 juillet 2016 et le 23 août 2019, dans le cadre des activités de surveillance de l'État et vétérinaire de la République de Lituanie en Lituanie. À partir de ces échantillons, ils ont généré des séquences de génome complètes du virus de la fièvre porcine africaine. Les chercheurs ont utilisé ces nouvelles séquences pour étendre l'ensemble de données existant du génome du virus de la fièvre porcine africaine Genotype II et l'étude de la propagation du virus à travers le continent européen.
L'analyse montre que le génotype II du virus de la fièvre porcine africaine circule désormais en Europe partage un seul ancêtre commun avec ceux qui circulent en Afrique, sans aucune preuve d'échanges viraux récents entre les deux continents. Les séquences d'Europe sont étroitement liées les unes aux autres et certains pays, en particulier la Pologne, la Lituanie, l'Ukraine et l'Allemagne, semblent avoir joué un rôle important dans la propagation régionale du virus à travers le continent.
Le virus africain de la fièvre porcine continue de menacer les populations domestiques de porcs et de sangliers en Europe. Chaque génome viral que nous séquences aide à approfondir notre compréhension de la dynamique de circulation du virus. «
Christopher Netherton, auteur principal de Paper
