La surveillance des spores fongiques dans l'air extérieur peut prédire des surtensions de la grippe et des infections Covid-19, en particulier pendant l'automne, selon une nouvelle étude. L'étude est présentée à l'ASM Microbe 2025 à Los Angeles, la réunion annuelle de l'American Society for Microbiology.
« En surveillant l'air que nous respirons, nous pouvons être en mesure de mieux prévoir et nous préparer à des épidémies saisonnières d'infections virales respiratoires », a déclaré l'auteur d'étude présentant Félix E. Rivera-Mariari, Ph.D., professeur agrégé de biochimie et de sujets spéciaux en biologie à l'Université de Lynn à Boca Raton, en Floride, et fondateur principal à l'institut Riplrt.
Les chercheurs voulaient comprendre le rôle à court terme des expositions environnementales spécifiquement des spores fongiques et un pollen déclenchant ou amplifiant l'incidence des infections virales respiratoires telles que le Covid-19 et la grippe. L'écologie de Porto Rico offre un laboratoire naturel unique en raison de sa présence cohérente et endémique toute l'année de champignons et de pollen aéroportés. Malgré les liens connus entre ces expositions et l'asthme ou les allergies, leur rôle dans les tendances de l'infection virale n'a pas été étudié en profondeur.
Dans la nouvelle étude, les chercheurs ont examiné les données quotidiennes, de 2022 à 2024, dans 2 grandes régions de santé à Porto Rico-San Juan et Caguas. Les données comprenaient l'incidence quotidienne des personnes diagnostiquées avec Covid-19 et la grippe, ainsi que les concentrations de spores fongiques en suspension dans l'air et du pollen enregistrées les mêmes jours. Les scientifiques ont ensuite mis en œuvre des modèles statistiques et d'apprentissage automatique pour voir si des niveaux élevés de ces expositions environnementales pourraient prédire les pics de grippe et les cas Covid-19 au cours de la même semaine ou de la semaine suivante (appelée effectif lag).
Ils ont découvert que les concentrations aéroportées de spores fongiques, mais pas le pollen, sont fortement liées à l'augmentation de la grippe et des cas Covid-19. Lorsque les concentrations aéroportées de spores fongiques ont augmenté, les scientifiques ont souvent vu un saut dans les infections en quelques jours. Les modèles ont pu prédire la grippe et les surtensions Covid-19 avec une grande précision, en particulier à l'automne, à la fois à San Juan et à Caguas. Le pollen n'a pas montré la même connexion ni la même prédiction.
Les résultats de notre étude suggèrent que la surveillance des niveaux de spores fongiques aéroportés pourrait aider à prédire les épidémies à court terme (pointes) de la grippe et du Covid-19, donnant aux systèmes de santé publique un signal d'alerte précoce. Nos résultats mettent également en évidence le rôle potentiel des facteurs environnementaux, pas la propagation de la personne à la personne contribuant à l'incidence des infections virales respiratoires. Cela pourrait ouvrir de nouvelles portes pour des alertes de santé publique ciblées, en particulier dans les zones à champignons aéroportés extérieurs élevés. «
Félix E. Rivera-Mariari, Ph.D., professeur agrégé de biochimie et sujets spéciaux en biologie, Lynn University
Les chercheurs de l'étude affirment que Porto Rico était un cadre idéal pour l'étude, non seulement en raison de ses niveaux d'exposition environnementale élevés, mais aussi parce qu'il dispose de stations de surveillance fongiques et de pollen actives au centre-ville de Caguas et à San Juan à l'Université de Porto Rico, le campus des sciences médicales. « Ces résultats peuvent aider à éclairer les alertes de risque environnemental, en particulier pour les populations vulnérables comme les personnes âgées ou celles souffrant d'asthme et de rhinite allergique », a déclaré Rivera-Mariani.
Pour suivre les nouvelles conclusions, Rivera-Mariari et ses collègues aimeraient déterminer si ces expositions environnementales sont également en corrélation avec des résultats graves tels que les hospitalisations ou les décès, et s'il existe des modèles similaires dans d'autres régions au-delà de Porto Rico. « Nous espérons également collaborer avec les agences de santé locales pour explorer la constitution de la surveillance fongique dans les systèmes de prévision des épidémies existants », a déclaré Rivera-Mariani.
