Une nouvelle ressource génétique étendue de parasites du paludisme infectant les rats pourrait contribuer à faire progresser le développement de stratégies de prévention et de traitement du paludisme. Cette mine d’informations sur le génome et le phénome a été publiée1 par une équipe de chercheurs de KAUST, avec des collègues au Japon, et les ensembles de données ont été rendus publics pour les chercheurs sur le paludisme.
Les parasites du paludisme chez les rongeurs sont étroitement liés aux parasites humains mais sont plus faciles à étudier car ils peuvent être cultivés sur des souris de laboratoire.
Les enquêtes sur les parasites du paludisme chez les rongeurs ont joué un rôle clé en révélant de nombreux aspects d’une biologie fascinante à travers les étapes de leur cycle de vie. «
Arnab Pain, Bioscientifique, KAUST
Pain a dirigé l’effort de séquençage, en collaboration avec Richard Culleton de l’Institut de médecine tropicale de l’Université de Nagasaki.
La plupart des recherches sur ces parasites à ce jour ont impliqué trois espèces spécifiques, mais une quatrième, appelée Plasmodium vinckei, n’a pas reçu beaucoup d’attention.
Pain, Culleton et l’équipe ont généré une ressource génétique complète pour cette espèce et ont également séquencé les génomes de sept isolats appartenant à deux des autres espèces, P. yoelii et P. chabaudi.
Le séquençage des génomes de dix isolats de cinq sous-espèces de P. vinckei d’Afrique tropicale a révélé qu’ils ont largement divergé de leur ancêtre commun. Les pressions évolutives sur chacune des sous-espèces varient fortement selon les régions où elles se trouvent principalement.
Les efforts de séquençage ont clarifié les aspects de l’arbre évolutif des parasites du paludisme du rat et ont également conduit à la dénomination de trois nouvelles sous-espèces: P. yoelii cameronensis, P. chabaudi esekanensis et P. vinckei baforti.
La recherche décrit en détail les variations génétiques et phénotypiques entre les sous-espèces, ce qui est susceptible d’aider les études visant à comprendre les fonctions des gènes du parasite du paludisme.
Les scientifiques ont également pu modifier génétiquement une sous-espèce de P. vinckei pour qu’elle porte une protéine fluorescente. Cela démontre que des recherches sur la fonction d’un gène, qui impliquent la modification ou la suppression d’un gène cible, peuvent être menées dans cette sous-espèce.
«Nous espérons que notre ressource fournira à la communauté de recherche un ensemble diversifié de modèles de parasites avec lesquels jouer. Cette ressource peut être utilisée pour identifier les gènes qui influencent la virulence, la résistance aux médicaments et la transmissibilité du parasite du paludisme chez les moustiques», déclare Abhinay Ramaprasad, le premier auteur de cette étude, qu’il a menée pendant son doctorat. chez KAUST.
La ressource a été bien accueillie par la communauté de recherche: «Quel riche ensemble de ressources», a écrit2 Jane Carlton, directrice du Center for Genomics & Systems Biology de l’Université de New York. «Le développement d’un système modèle prenait autrefois des décennies, mais avec l’aide du séquençage de nouvelle génération … et des techniques améliorées de biologie moléculaire, Ramaprasad et al. Ont accéléré l’établissement de P. vinckei comme modèle expérimental supplémentaire utile pour paludisme. »
La source:
Université King Abdullah des sciences et de la technologie (KAUST)
Référence du journal:
Ramaprasad, A., et al. (2021) Plasmodium Vinckei les génomes fournissent un aperçu du pan-génome et de l’évolution des parasites du paludisme chez les rongeurs. Biologie BMC. est ce que je.
