Les bactéries résistantes aux antibiotiques reçoivent des nutriments supplémentaires et se développent lorsque les médicaments tuent les « bonnes » bactéries dans l’intestin.
C’est ce que révèle une nouvelle recherche menée par des scientifiques de l’Imperial College de Londres, qui pourrait conduire à une meilleure évaluation des risques pour les patients et à des traitements « thérapeutiques du microbiome » pour aider à combattre les bactéries résistantes aux antibiotiques.
Certains antibiotiques ciblent des bactéries spécifiques, mais d’autres sont à « large spectre », ce qui signifie qu’ils peuvent tuer un large éventail de bactéries, y compris à la fois les « mauvaises » bactéries pathogènes qui provoquent des infections et les « bonnes » bactéries qui vivent dans nos intestins et facilitent la digestion et d’autres processus. .
Les carbapénèmes sont des antibiotiques à large spectre puissants mais souvent utilisés en dernier recours, en raison de leurs effets négatifs sur les bactéries bénéfiques. Quelques bactéries pathogènes dans la classe Entérobactéries cependant, ils sont même résistants aux carbapénèmes, y compris aux souches de E. coli. Ces bactéries pathogènes colonisent l’intestin mais peuvent se propager à d’autres sites du corps, provoquant des infections difficiles à traiter telles que des infections du sang ou des infections récurrentes des voies urinaires.
Aujourd’hui, une nouvelle étude montre comment ces bactéries résistantes se développent après l’utilisation d’antibiotiques, leur permettant de se multiplier dans l’intestin, formant ainsi un « réservoir » de bactéries pathogènes. Les résultats sont publiés dans Communications naturelles.
Plus de nutriments, moins de déficiences
Pour déterminer l’effet des antibiotiques, l’équipe les a testés en laboratoire sur des échantillons de selles humaines, parallèlement à des expériences sur des souris et à des tests en laboratoire de produits résistants aux carbapénèmes. Entérobactéries (CRE).
Les bactéries présentes dans l’intestin, qu’elles soient « bonnes » ou « mauvaises », ont besoin de nutriments pour croître et se reproduire. Les expériences ont montré que lorsque les antibiotiques détruisaient les bactéries bénéfiques, les bactéries pathogènes étaient capables de profiter des nutriments supplémentaires disponibles en raison d’une moindre concurrence.
L’équipe a également montré que tuer les bactéries bénéfiques réduisait le niveau de métabolites – des déchets qui empêchent les bactéries pathogènes de se développer davantage. Cela a aidé les bactéries pathogènes à se développer.
Comprendre comment les antibiotiques provoquent une résistance aux carbapénèmes Entérobactéries se développer dans l’intestin signifie que nous pouvons développer de nouveaux traitements pour limiter leur croissance dans l’intestin, ce qui entraînera une réduction de ces infections résistantes aux antibiotiques.
Alexander Yip, premier auteur, Centre de biologie de la résistance bactérienne, Département des sciences de la vie à l’Imperial
Thérapie du microbiome
L’équipe travaille actuellement sur les moyens d’interférer avec ce processus. Premièrement, ils veulent identifier quelles bactéries bénéfiques peuvent « supplanter » les bactéries pathogènes en l’absence d’antibiotiques : quelles bonnes bactéries sont capables de mieux utiliser les mêmes nutriments et de produire des métabolites qui limitent la croissance bactérienne pathogène.
Avec ces informations, ils espèrent créer des « thérapies pour le microbiome ». La chercheuse principale, le Dr Julie McDonald, du Département des sciences de la vie de l’Imperial, a expliqué : « Lorsqu’un patient prend des antibiotiques, nous pourrions lui donner des métabolites inhibiteurs pour limiter la croissance de bactéries résistantes. Après qu’un patient ait arrêté de prendre des antibiotiques, nous pourrions lui donner un mélange de bactéries intestinales bénéfiques pour aider leur microbiome intestinal à se rétablir, à restaurer l’épuisement des nutriments et à restaurer la production de métabolites inhibiteurs.
« Ces traitements du microbiome pourraient réduire le risque que les patients développent des infections invasives résistantes aux antibiotiques, réduire la récidive des infections invasives à CRE chez les patients chroniquement colonisés et réduire la propagation de la CRE aux patients sensibles. »
À court terme, les chercheurs affirment que leurs résultats pourraient être utilisés pour contribuer à réduire le risque que les patients hébergent des réservoirs de CRE dans leurs intestins. Par exemple, les cliniciens pourraient éviter de prescrire des antibiotiques qui augmentent certains nutriments et épuisent certains métabolites. Les médecins pourraient également analyser les échantillons fécaux des patients à la recherche de ces nutriments et métabolites, afin d’identifier ceux présentant un risque accru de colonisation par CRE.
