Dans une étude récente publiée dans eBioMedicine, des chercheurs ont mené une surveillance entomologique, des eaux usées et des cas du virus Zika (ZIKV) à Singapour.
Étude: Rapport de cas : surveillance du Zika complétée par des tests sur les eaux usées et les moustiques. Crédit d’image : Tacio Philip Sansonovski/Shutterstock.com
Sommaire
Arrière-plan
Le ZIKV est un virus transmis par les moustiques Flaviviridés famille. Les cas et épidémies de ZIKV ont augmenté au cours des deux dernières décennies dans les Amériques, dans le Pacifique, en Asie et en Afrique.
L’Organisation mondiale de la santé (OMS) a déclaré une urgence de santé publique de portée internationale en 2016, lorsque plus d’un million de cas de ZIKV ont été signalés au Brésil et dans les Amériques.
De plus, les infections étaient associées à de graves complications neurologiques et au syndrome congénital de Zika.
Les personnes infectées sont souvent asymptomatiques ; s’ils sont présents, les symptômes comprennent de la fièvre, des éruptions cutanées, des douleurs articulaires et musculaires et une conjonctivite. Singapour a enregistré une épidémie de ZIKV en 2016-2017, et des infections sporadiques ont depuis été signalées.
La faible immunité de la population et la présence de vecteurs compétents à Singapour soulignent le risque d’épidémies de ZIKV, justifiant des mesures complètes de surveillance et de contrôle des vecteurs.
Alors que la surveillance des cas se limite à ceux qui présentent des symptômes, la surveillance des eaux usées et la surveillance entomologique peuvent fournir une surveillance complète et non intrusive.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont mené une surveillance entomologique, des cas et des eaux usées du ZIKV. Un cas définitif de ZIKV a été défini sur la base de la détection de l’ARN viral dans le sang total, le sérum, l’urine ou le sperme.
Les hôpitaux et les cliniques de soins de santé primaires avaient accès à des services de test et tous les cas devaient être notifiés au ministère de la Santé de Singapour.
Les données épidémiologiques comprenaient le nombre hebdomadaire d’infections à ZIKV et les zones présentant des foyers d’infection/cas.
La surveillance des moustiques a été entreprise sur les sites où des cas de Zika ont été signalés, y compris la zone préoccupante (AOC), ses environs et le voisinage des cas sporadiques. Les populations de moustiques ont été surveillées à l’aide du système national de surveillance Gravitrap.
Des pièges Biogents (BG)-Sentinel ou Gravitraps supplémentaires ont été installés au niveau de l’AOC. Des spécimens de moustiques ont été collectés et traités.
Femelle adulte Aedes les moustiques ont été identifiés au niveau de l’espèce. L’ARN a été extrait des échantillons et soumis à une réaction en chaîne par polymérase à transcription inverse (RT-qPCR) en temps réel.
Par ailleurs, des échantillonneurs automatiques d’eaux usées ont été déployés au niveau de l’AOC et de ses environs. Les échantillons d’eaux usées ont été concentrés par ultrafiltration ; L’ARN a été extrait et une RT-qPCR a été réalisée.
Le gène de l’enveloppe (E) du ZIKV a été séquencé. Un arbre phylogénétique a été construit sur la base de sa séquence. La corrélation de Spearman entre les signaux des eaux usées ZIKV et les nouveaux cas hebdomadaires de Zika a été analysée.
Résultats
Une zone résidentielle du nord-est de Singapour a enregistré deux cas de Zika en mai 2023. Les infections sont passées à 15, avec cinq cas sporadiques dans d’autres zones à la mi-juin 2023.
Les chercheurs ont examiné 590 Aedes piscines à moustiques pour ZIKV. Ces échantillons comprenaient 43 pools du système national de surveillance Gravitrap de l’AOC, 128 de ses environs et 419 de zones présentant des cas sporadiques.
Quatre-vingt-dix moustiques ont été capturés à l’aide de pièges BG-Sentinel ou de Gravitraps installés en plus dans l’AOC et ses environs. Des moustiques porteurs du virus ont été détectés uniquement dans les échantillons provenant de l’AOC.
Trois pools contenant huit moustiques et trois moustiques dépistés individuellement étaient positifs pour l’ARN viral. Les signaux des eaux usées étaient positifs pour l’ARN viral entre le 15 et le 25 mai 2023 dans le secteur préoccupant et ses environs.
Une zone (A) présentait une fréquence plus élevée d’échantillons équivoques (20,2 %) et positifs (6 %) que les autres zones (B et C).
Notamment, la période de détection des eaux usées a coïncidé avec le nombre maximal de cas signalés dans l’AOC et avec un pic de détection de moustiques positifs. Les signaux d’ARN du ZIKV dans les eaux usées étaient positivement corrélés aux nouvelles infections hebdomadaires.
Les échantillons rétrospectifs et prospectifs d’eaux usées provenant d’autres zones n’étaient pas positifs pour le ZIKV.
Les analyses phylogénétiques ont révélé que les séquences du ZIKV étaient génétiquement distinctes des souches identifiées en 2016 à Singapour et appartenaient au génotype asiatique. De plus, les séquences étaient étroitement liées à celles détectées en 2012 et 2016 aux Philippines.
Conclusions
En résumé, cette analyse de surveillance a montré que le pic de l’épidémie de ZIKV à Singapour s’est produit au cours de la semaine épidémiologique du 14 mai 2023 et a diminué à la mi-juin 2023.
L’absence d’ARN viral dans les échantillons provenant de régions non vicinales de l’AOC et de celles présentant des cas sporadiques met en évidence la transmission limitée et la faible incidence des infections à ZIKV dans le pays.
Il convient de noter que tous les échantillons de moustiques n’ont pas pu être identifiés au niveau de l’espèce. De plus, l’équipe n’a pas pu déterminer si le ZIKV présent dans les eaux usées provenait de nouvelles infections ou de celles en cours de guérison.
Dans l’ensemble, l’étude a démontré l’applicabilité émergente de la surveillance des eaux usées pour le ZIKV, suggérant qu’une surveillance régulière des eaux usées pourrait fournir des alertes précoces et faciliter des mesures rapides.
