Cette interview se penche sur les capacités et les services du nouveau laboratoire de génomique d'Oxford d'Azenta Life Sciences, discutant de son rôle dans l'avancement de la recherche en génomique au Royaume-Uni, du processus de configuration unique et des futurs plans d'expansion.
Sommaire
Pouvez-vous nous donner un aperçu des solutions multiomiques et de synthèse GENEWIZ d'Azenta Life Sciences et du nouveau laboratoire de génomique d'Oxford, ainsi que des services et technologies qu'il propose ?
David: GENEWIZ d'Azenta Life Sciences est bien plus qu'un simple fournisseur de services de séquençage. Avec une présence mondiale et de nombreux laboratoires, nous proposons une gamme de solutions génomiques comprenant le séquençage de nouvelle génération, la synthèse génétique, le séquençage Sanger, la génétique moléculaire et le clonage. Nous nous adressons aux chercheurs qui ont besoin d'un soutien minimal ainsi qu'à ceux qui souhaitent travailler de manière plus collaborative et nous utiliser comme une extension de leur laboratoire. Bien que tous les sites ne proposent pas tous les services, GENEWIZ dans son ensemble fournit un vaste portefeuille de services génomiques et analytiques à nos clients.
Le laboratoire de génomique d'Oxford se consacre exclusivement au séquençage de nouvelle génération (NGS). Dans un premier temps, nous nous concentrons sur le séquençage du génome entier, le séquençage de l'ARN et les services d'exécution uniquement, plutôt que de proposer l'intégralité de notre portefeuille dès le départ. Cette approche progressive évite la surcharge opérationnelle et garantit une prestation de services de qualité.
La demande de services d'exécution uniquement est particulièrement élevée. Cela est probablement dû au fait que les dernières technologies de séquençage sont extrêmement coûteuses pour les laboratoires de recherche traditionnels ou de petite taille. L'externalisation de ces services à GENEWIZ d'Azenta les rend accessibles et abordables pour ces laboratoires.
Avec une installation de séquençage Sanger déjà opérationnelle au Royaume-Uni, pourquoi était-il important pour Azenta Life Sciences d'ouvrir une installation distincte pour le séquençage de nouvelle génération au Royaume-Uni ?
David:La principale raison de l'expansion vers le séquençage de nouvelle génération (NGS) était la demande croissante pour ce service. Notre laboratoire Sanger est très efficace et sert de plate-forme logistique. Nous proposons le NGS à nos clients depuis un certain temps, mais cela nécessitait l'expédition de matériel du Royaume-Uni à Leipzig. Après le Brexit, ce processus est devenu un défi logistique.
Azenta a eu une excellente opportunité lorsque l'Oxford Genomics Centre (OGC) a fermé ses portes. Le laboratoire disposait d'une large clientèle habituée à travailler avec une équipe talentueuse que j'avais constituée au cours de 14 ans. Bien que le laboratoire de l'OGC lui-même ait fermé ses portes, l'ancienne équipe de l'OGC et ses clients souhaitaient toujours continuer à fournir des services exceptionnels.
Certains pourraient penser que regrouper toutes les activités sur un seul site aurait été plus rentable. Cependant, nous aurions perdu les solides relations avec les clients de la région d’Oxford. En tant qu’ancien directeur de l’OGC, j’ai pu intégrer cinq membres clés de mon équipe de direction dans cette nouvelle aventure chez Azenta, ce qui a rendu la transition à la fois passionnante et enrichissante.
Ce contexte met en évidence pourquoi le laboratoire d'Azenta à Oxford se concentre exclusivement sur le NGS, garantissant ainsi que nous maintenons le niveau de service élevé que nos clients attendent tout en surmontant les défis logistiques posés par le Brexit.
Quelle était la particularité du processus de création de ce laboratoire ?
David:Des laboratoires sont régulièrement créés dans le monde entier, mais ce qui a rendu notre organisation unique, c'est l'expertise des personnes que nous avons embauchées : mon ancienne équipe du Oxford Genomics Centre (OGC). Leur vaste expérience dans le domaine a été inestimable.
Un autre aspect remarquable de cette installation a été le processus de transformation. Même si nous n'en avons pleinement pris conscience qu'une fois le projet terminé, il n'a fallu que 10 semaines pour transformer une salle de sport haut de gamme en une installation de séquençage de nouvelle génération.
Pouvez-vous nous parler du rôle du nouveau laboratoire d’Azenta dans l’avancement de la recherche en génomique au Royaume-Uni ?
David:L'aspect le plus important de notre installation est notre technologie de pointe, notamment des plateformes de séquençage et d'automatisation avancées. Nous disposons également de systèmes LIMS internes sophistiqués et d'une riche expérience. Notre équipe comprend des chefs de projet de niveau doctorat qui interagissent directement avec nos clients à chaque étape de leur projet, leur fournissant une compréhension et des conseils scientifiques approfondis.
Il est essentiel de disposer de cette installation au Royaume-Uni. En tant que scientifique ayant déjà travaillé avec des prestataires de services comme GENEWIZ, je sais combien il est important de pouvoir communiquer directement avec les scientifiques qui gèrent votre travail et de veiller à ce que vos échantillons soient traités localement. Cela permet non seulement de conserver vos échantillons au Royaume-Uni, mais également de garantir que vos données restent sécurisées et proches de chez vous.
Comment vois-tu Les services NGS, comme ceux offerts à le nouveau laboratoire de génomique d'Oxford, contribuant à surmonter certaines des limitations ou des défis actuels rencontrés dans le domaine médical ?
John:La génomique est absolument essentielle aux initiatives du gouvernement en matière de sciences de la vie. Elle joue un rôle essentiel pour permettre au NHS d'évoluer vers la médecine moléculaire et la prévention des maladies. Au cœur de cette évolution se trouve le séquençage de l'ADN.
Les avancées en génomique sont nombreuses et permettent à des études majeures, comme UK Biobank et Our Future Health, d’avancer rapidement et d’obtenir toutes sortes d’informations sur la santé humaine et la prévention des maladies.
Quelles mesures sont mises en place pour garantir la fiabilité et la haute précision des données produites par le laboratoire ?
David:Notre engagement à valider l'efficacité de tout ce que nous faisons est primordial. Nous avons mis en place des contrôles rigoureux pour garantir le bon fonctionnement de nos processus. L'automatisation est essentielle dans un environnement à haut débit, et nous nous efforçons d'automatiser autant de processus que possible pour garantir la fiabilité et la reproductibilité.
Nous utilisons des technologies de pointe, comme le dernier système MagPip Star V de Hamilton Robotics, qui représente une automatisation de pointe. Pour maintenir nos normes élevées, nous embauchons uniquement des personnes qui comprennent la science derrière nos opérations. Même dans ce cas, ils doivent suivre un processus de formation rigoureux pour s'assurer qu'ils répondent à nos normes rigoureuses.
Quel impact prévoyez-vous que le nouveau laboratoire de génomique d’Oxford d’Azenta Life Sciences aura sur la communauté scientifique locale ?
John:L'écosystème d'Oxford est l'un des leaders en matière de santé humaine et de prévention des maladies au Royaume-Uni et dans le monde. Le fait d'avoir à notre porte une installation de séquençage exceptionnelle comme celle-ci nous permet de travailler plus rapidement, avec plus de précision et d'obtenir davantage à moindre coût. Cela peut considérablement améliorer les découvertes dans la recherche médicale, ce qui profite en fin de compte aux patients.
Quels retours avez-vous reçus de la communauté scientifique à propos du laboratoire d’Oxford ?
David:Lorsque l'installation de l'OGC a fermé, j'ai dû informer ses clients de la fermeture de l'installation, ce qui a laissé une vague importante de mécontentement car ils dépendaient fortement des services offerts par l'OGC.
Aujourd'hui, ces clients sont ravis de pouvoir à nouveau accéder localement aux capacités de génomique grâce à l'ouverture du laboratoire d'Azenta à Oxford. Ils peuvent continuer à travailler avec la même équipe à laquelle ils font confiance depuis 14 ans. Pouvoir nous rendre visite localement et discuter des projets en personne est un argument de vente majeur. Ils apprécient de savoir que leurs échantillons et leurs données resteront au Royaume-Uni et qu'ils peuvent consulter des experts hautement qualifiés sur leurs projets.
Comment Azenta Life Sciences prévoit-elle d'étendre ou de faire évoluer ses services à l'avenir pour le Royaume-Uni ?
David:Le plus important est de fournir les services que nos clients souhaitent et dont ils ont besoin. Il est essentiel d'être le plus rapide, le plus rentable et le plus compétent, mais ce n'est pas parce que vous construisez quelque chose que le client l'utilisera nécessairement. Par conséquent, lors de l'expansion d'une activité, il est essentiel de prendre en compte les souhaits de la clientèle.
Jusqu'à présent, nous avons commencé à proposer des services de séquençage du génome entier, de séquençage de l'ARN et de séquençage en exécution uniquement au laboratoire d'Oxford. Nous prévoyons également d'ajouter un service d'extraction local dans un avenir proche.
En ce qui concerne la prochaine étape pour le laboratoire de génomique d’Oxford, les idées sont nombreuses. Nous avons de nombreux fournisseurs qui souhaitent que nous ajoutions leur technologie à notre portefeuille de séquençage. Même si j’aimerais intégrer toutes ces technologies, notre expansion doit être réaliste et motivée par la demande des clients.
Qu’est-ce qui vous enthousiasme le plus dans les possibilités futures offertes par le nouveau laboratoire de génomique d’Oxford d’Azenta Life Sciences ?
David:Nous sommes passionnés par la génomique à haut débit et soutenons l'incroyable recherche scientifique menée à Oxford, dans tout le Royaume-Uni et dans le monde entier. En tant qu'équipe expérimentée comprenant des experts de niveau doctorat, notre objectif est de faire progresser la science en générant des données plus rapidement que quiconque à l'échelle mondiale.
En plus de la génération de données, nous offrons un support analytique sur demande. Nos services répondent à divers besoins, en fournissant plusieurs niveaux de support, notamment des consultations, des mises à jour en temps réel et une assistance après la livraison.
Les clients qui préfèrent une approche non interventionniste peuvent simplement se connecter en ligne, passer une commande, envoyer leurs échantillons et collecter les données sans aucune interaction supplémentaire. D'autre part, nous proposons également un support analytique complet à ceux qui en ont besoin. Notre objectif est de répondre aux besoins de nos clients à tous les niveaux.
À propos de David Buck
David Buck, Ph.D., est le directeur des opérations chez Azenta Life Sciences au Royaume-Uni. Il a plus de trois décennies d'expérience en biologie moléculaire, excellant dans la restructuration complexe, l'expansion mondiale et la technologie pionnière du séquençage de l'ADN pour améliorer les performances scientifiques et la productivité.
À propos de John Todd 
John Todd, Ph.D., est professeur de médecine de précision à l'Université d'Oxford et directeur du Wellcome Centre for Human Genetics. Il est connu pour avoir été le pionnier des études génétiques à l'échelle du génome et pour ses recherches sur la génétique du diabète de type 1 et les mécanismes de la maladie afin de développer des interventions cliniques. Actuellement, ses recherches portent sur les doses ultra-faibles d'interleukine-2 et sur le rôle du microbiome dans le diabète de type 1.
À propos de GENEWIZ d'Azenta Life Sciences 
GENEWIZ Multiomics & Synthesis Solutions d'Azenta Life Sciences est une société mondiale de services de génomique de premier plan et un fournisseur de confiance pour le séquençage Sanger, le séquençage de nouvelle génération, la synthèse de gènes, la biologie moléculaire, la bioinformatique et les services réglementaires BPL.
Facilement accessible dans le monde entier, GENEWIZ est le partenaire privilégié des principales institutions universitaires, pharmaceutiques, biotechnologiques, agricoles, gouvernementales et cliniques.
