Le cancer colorectal est unique pour avoir sa propre «empreinte digitale» microbienne – selon de nouvelles recherches de l'Université d'East Anglia.
Le cancer colorectal est le quatrième cancer le plus courant au Royaume-Uni et le deuxième plus meurtrier.
La recherche pourrait aider les médecins à mieux comprendre comment ce cancer se développe, à quel point il pourrait être agressif et même comment un patient pourrait réagir au traitement.
L'équipe a étudié les données de séquençage du génome entier (WGS) de plus de 9 000 patients atteints de cancer.
L'analyse, publiée aujourd'hui, remet également en question les affirmations scientifiques selon lesquelles tous les cancers sont associés à une empreinte microbienne unique.
Cette étude change la façon dont nous pensons au rôle des microbes dans le cancer. «
Dr Abraham Gihawi, chercheur principal de la Norwich School de l'UEA
Sommaire
Comment la recherche s'est produite
L'équipe de recherche a étudié les informations de séquence d'ADN de Genomics England à partir de 11 735 échantillons de cancer représentant 22 types de cancer différents.
« Lorsque vous collectez des séquences d'ADN contre le cancer, vous obtenez également des informations de l'ADN des microbes contenus dans les échantillons », a déclaré le Dr Gihawi.
« Nous voulions déterminer la composition précise de l'ADN des microbes présents dans chaque échantillon. Nous avons donc développé des programmes informatiques pour éliminer l'ADN humain et analyser l'ADN microbe restant.
«Nous avons ensuite corrélé ces informations avec les données cliniques des patients sur leur type de cancer et leurs résultats cliniques.
« Ce que nous avons trouvé remet en question les affirmations précédentes selon lesquelles chaque type de cancer a une signature microbiologique distincte ou une empreinte digitale.
« Mais surtout, à mesure que le séquençage du génome entier devient plus courant dans les hôpitaux, nous montrons que l'examen des microbes dans les échantillons de tumeurs pourrait devenir un outil puissant pour améliorer les soins contre le cancer à peu de coût supplémentaire.
Une percée pour les cancers colorectaux et oraux
«Nos résultats montrent que seules les tumeurs colorectales possèdent des communautés microbiennes nettement identifiables.
« Nous avons constaté que ces signatures microbiennes étaient si spécifiques qu'elles pouvaient distinguer avec précision les tumeurs colorectales des autres tumeurs. Nous espérons que cela pourrait aider les médecins à diagnostiquer la maladie plus précisément et les chercheurs à étudier les microbes trouvés dans le cancer colorectal. »
L'étude a également découvert des applications cliniques prometteuses.
Par exemple, dans les cancers oraux, l'étude a révélé que certains virus comme le VPH (papillomavirus humain) pouvaient être détectés avec précision par rapport aux tests médicaux actuels.
L'équipe a également trouvé des virus rares mais dangereux, tels que le virus 1 lymphotrope humain (HTLV-1), qui peut être des infections dormantes capables de provoquer un cancer.
De meilleurs taux de survie
« Nous avons constaté que certains types de bactéries étaient associés à de moins bons taux de survie dans certains cas de sarcome.
« L'une des choses les plus excitantes que nous ayons trouvées était que dans certains cas de sarcome, la présence de bactéries spécifiques était liée à de meilleurs taux de survie.
« Cela suggère que les microbes pourraient un jour aider les médecins à prédire dans quelle mesure un patient réagira au traitement et ouvrira de nouvelles approches du traitement », a-t-il ajouté.
Un outil indispensable
Le professeur Daniel Brewer, de la Norwich Medical School de l'UEA, a déclaré: « Cette étude met en évidence la valeur clinique croissante du séquençage du génome entier dans l'identification des organismes pathogènes tels que le HTLV-1 et le papillomavirus, qui pourraient autrement ne pas être détectés.
«En révélant ces infections cachées et en fournissant un aperçu du pronostic du cancer – en particulier dans les sarcomes – il montre comment l'analyse génomique devient un outil indispensable en médecine de précision.
« Les résultats suggèrent également que le cancer de la bouche, dans certains cas, peut être une considération diagnostique étroite, soulignant davantage l'importance d'un profilage génomique complet dans la prise de décision clinique. »
Cette recherche a été dirigée par l'UEA en collaboration avec l'Université de Leeds, le Quadram Institute, Oxford Nanopore Technologies, l'Institute of Cancer Research, London, Université de Manchester, Nihr Manchester Biomedical Research Center, l'Université de la Fondation Athènes (University College, University de l'Université de Southampton, Université de la North Carol Institut Earlham.
Ce travail a été financé par l'organisme de bienfaisance du cancer de Big C et le cancer de la prostate UK, avec un soutien supplémentaire du Bob Champion Cancer Trust, du groupe Alan Boswell, du successeur de la Fondation caritative maçonnique de l'organisme de bienfaisance, Movember, de la recherche sur le cancer de la prostate, de la famille King, de la Hargrave Foundation, du Nihr Manchester Biomedical Research Center et du Sarcoma UK.
« Indices microbiens dans le cancer: une nouvelle étude remet en question les anciennes hypothèses et révèle le potentiel clinique '' est publié dans la revue Médecine translationnelle scientifique.
