Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont évalué l’effet de la vaccination contre le coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère aux États-Unis.
Sommaire
Arrière plan
Avant le 1er aoûtSt 2022, la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) avait été responsable de près de 90 millions d’infections par le SRAS-CoV-2 et d’un million de décès aux États-Unis. Les vaccinations contre le SRAS-CoV-2 sont un élément crucial de la réponse à la pandémie américaine depuis décembre 2020. Cependant, les effets de la vaccination sont difficiles à mesurer.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont calculé le nombre de cas de COVID-19, d’hospitalisations et de décès évités par la vaccination contre le SRAS-CoV-2 au cours des six premiers mois après la mise à disposition du vaccin à l’aide d’un modèle dynamique de métapopulation à l’échelle du comté.
L’équipe a combiné une technique d’assimilation de données avec un modèle de métapopulation couplé à une structure Susceptible-Exposed-Infected-Recovered (SEIR). Ici, la propagation du SRAS-CoV-2 dans et parmi les 3142 comtés américains a été simulée. Le nombre de cas signalés pour chaque comté américain depuis le moment où les premiers cas de COVID-19 y ont été découverts en février 2020 jusqu’à la date de la première vaccination autorisée contre le SRAS-CoV-2 le 14 décembree2020, ont été évalués à l’aide du système d’inférence de modèle.
L’équipe a comparé le scénario de vaccination de base à trois scénarios contrefactuels de non-vaccination qui ont été simulés sur la même période pour mesurer le fardeau évité par la vaccination. Pour simuler divers niveaux de réponse d’intervention non pharmaceutique (NPI) en l’absence de vaccination, tous les scénarios contrefactuels supposaient qu’il n’y avait pas de vaccination mais avaient une transmissibilité variable :
- Scénario contrefactuel 1 : un scénario dans lequel il n’y a pas eu de changement de transmission ni de vaccination, et le nombre de reproductions variant dans le temps de chaque lieu (Rt) et les séries chronologiques quotidiennes étaient telles qu’implicites par le scénario de référence ;
- Scénario contrefactuel 2 : Un scénario dans lequel il n’y a pas de vaccination et Rt pour chaque lieu-jour est supérieur de 10 % à celui du scénario de référence ; et
- Scénario Contrefactuel 3 : Une absence de vaccination, avec une réduction de 10% de Rt pour chaque lieu-jour par rapport au scénario de référence.
L’étude a supposé que les cas excédentaires auraient persisté et entraîné des hospitalisations et des décès au même taux global que celui observé dans chaque État américain à l’été et à l’automne 2020 avant que le vaccin ne soit disponible. Cette hypothèse a permis d’estimer les hospitalisations et les décès dans les scénarios contrefactuels. Le nombre total de cas évités de chaque scénario a été multiplié par un taux de létalité pré-vaccinal (CFR) et un taux d’hospitalisation (CHR) spécifiques à l’État.
L’équipe a utilisé les données de la base de données américaine Premier Healthcare COVID-19 pour multiplier la distribution des hospitalisations estimées liées au COVID-19 évitées par la distribution des dépenses par épisode d’hospitalisation.
Résultats
Le 14 décembree, 2020, début de la période de simulation, il a été prédit que 74,1% de la population américaine était sensible, tandis que 0,8% avaient été exposés, 0,8% étaient devenus infectieux et 24,3% s’étaient rétablis. La proportion de la population qui n’avait pas encore contracté le COVID-19 depuis le début de la pandémie, connue sous le nom de fraction sensible estimée médiane, variait entre 58 % dans le Dakota du Nord et 94 % dans le Vermont. Dans les États situés dans le nord-ouest et le nord-est, la fraction sensible était la plus élevée. Au Minnesota, le nombre médian de reproduction dépendant du temps était de 0,8, tandis qu’au Tennessee, il était de 2,0.
Avant la vaccination, le CFR variait entre 0,5 % en Alaska et 2,3 % dans le Rhode Island. Le CHR se situait entre 3,8 % en Alaska et 20,7 % au Kentucky au cours de la même période. Malgré une légère diminution du CHR au niveau national entre la période de pré-vaccination et la période d’analyse, l’équipe n’a trouvé aucun changement cohérent au niveau de la population dans le CFR au niveau national ou dans le CFR et le CHR au niveau de l’État.
Le modèle de base prévoyait un total de 16,1 millions de cas de COVID-19, 1,4 million d’hospitalisations liées et plus de 246 000 décès entre le 14 décembree et le 3 juinrd, 2021. Près de 51% des Américains avaient reçu au moins une dose de vaccin COVID-19 au 4 juine, 2021. Les taux de vaccination spécifiques à un lieu variaient considérablement, de 35 % dans le Mississippi à 74 % dans le Vermont. Le nombre de vaccinations reçues par les individus chaque semaine a augmenté au fil du temps, commençant à moins de cinq millions par semaine et culminant à 14 millions en avril lorsque la vaccination a été mise à la disposition de tous les adultes âgés de 16 ans et plus.
La majorité des cas évités ont été enregistrés entre avril et juin 2021 dans les trois scénarios contrefactuels. Les estimations médianes des cas évités pour chaque État allaient de 1 000 à 6 400 cas pour 100 000 habitants. Les hospitalisations évitées variaient de 74 à 752 médianes cumulatives pour 100 000, tandis que les décès évités variaient de 16 à 128 médians cumulativement pour 100 000. Au début de la campagne de vaccination, un taux de vaccination et une sensibilité de la population plus élevés étaient associés à un plus grand nombre de cas évités.
Conclusion
De façon générale, les découvertes d’étude ont démontré que la vaccination COVID-19 a diminué le fardeau de la maladie. La vaccination COVID-19 a été liée à plus de 8 millions de cas confirmés en moins, à plus de 120 000 décès en moins et à 700 000 hospitalisations en moins au cours des six premiers mois de la campagne, selon les statistiques de base sur les cas. En conséquence, les vaccins COVID-19 étaient un élément essentiel de la réponse de santé publique des États-Unis à l’épidémie de COVID-19.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
