Un virus de la grippe BAT nouvellement identifié, H18N12, porte des mutations qui peuvent améliorer sa capacité à sauter entre les espèces, soulignant la nécessité d'une surveillance vigilante pour empêcher de futures épidémies.
Étude: Génomique de la nouvelle grippe A Virus (H18N12) dans les chauves-souris, Caribe Colombia. Crédit d'image: Shutterstock AI Générateur / Shutterstock.com
Dans une étude récente publiée dans Rapports scientifiquesles scientifiques ont déterminé les caractéristiques phylogénétiques, évolutives et antigéniques d'un nouveau virus de la grippe A (IAV) identifiée dans les chauves-souris de pêche dans les Caraïbes colombiennes.
Sommaire
Chauves-souris: réservoirs naturels pour les virus émergents
Les chauves-souris servent de réservoir clé pour un large éventail de virus, dont certains comprennent des coronavirus, des paramyxovirus, des filovirus, une encéphalite équine vénézuélienne, et le virus de la dengue.
Les chauves-souris ne sont pas considérées comme un réservoir pour les virus de la grippe; Cependant, plusieurs sous-types IAV ont récemment été détectés en eux. Il s'agit notamment du sous-type H17N10 identifié dans les chauves-souris fruitières au Guatemala et H18N11 isolées des chauves-souris au Pérou, en Bolivie et au Brésil. Un virus similaire aux souches Avian IAV a également été détecté dans les chauves-souris égyptiennes.
Comment les IAV aviaires infectent-ils les chauves-souris?
Les IAV BAT proviennent probablement d'un ancêtre commun partagé avec les sous-types Avian IAV. Les preuves existantes suggèrent que la séparation géographique et plusieurs événements de transmission précoce ont divisé ces virus en deux branches ou des mutations significatives leur ont permis de s'adapter spécifiquement aux chauves-souris.
L'hémagglutinine (H) et la neuraminidase (NA) sont des glycoprotéines présentes à la surface des IAV. Ils sont impliqués dans l'attachement viral aux récepteurs d'entrée des cellules hôtes, y compris la classe II du complexe d'histocompatibilité majeur (MHC-II). La cristallographie aux rayons X de ces protéines a confirmé les similitudes structurelles entre les IAV BAT et les IAV aviaires; Cependant, les IAV BAT présentent des modifications moléculaires spécifiques qui peuvent être responsables de leur adaptation aux chauves-souris.
Par exemple, la protéine NA des IAV BAT ne présente aucune activité catalytique, ce qui conduit les chercheurs à émettre l'hypothèse que cette glycoprotéine peut induire de faibles molécules du CMH-II par un mécanisme différent. Cependant, des recherches supplémentaires sont nécessaires pour bien comprendre les mécanismes par lesquels les IAV infectent les chauves-souris pour assurer l'efficacité des stratégies de contrôle de la grippe.
Résultats de l'étude
Au total, 159 échantillons rectaux ont été prélevés au hasard dans les chauves-souris des Caraïbes colombiens et analysées en utilisant le séquençage d'acide ribonucléique (ARN SEQ). Ces espèces de chauves-souris appartenaient au Phylostomidae, Molossidae, Noctilionidae, et Emballonuridae Familles. Notamment, seulement quatre Noctilio albiventris Les échantillons contenaient un génome viral associé au Orthomyxoviridae famille.
Trois segments de ce génome viral présentaient 90% de similitude avec H18N11. Comparativement, 93% de l'échantillon de génome viral A / BAT / Colombie 23 étaient structurellement similaires à la séquence H18N11 isolé au Pérou; Cependant, le gène NA de cet échantillon a montré une plus grande divergence de ce génome de référence.
L'analyse phylogénétique a indiqué que l'isolat viral A / BAT / Colombie 23 est lié aux IAV spécifiques de BAT et qu'il différait considérablement des IAV aviaires. Par exemple, le segment du gène H était structurellement similaire au segment H18 isolé au Pérou, au Brésil et en Bolivie, tandis que les segments PB2, PA et M partagent probablement un ancêtre commun avec ces gnomes de référence. Comparativement, le segment des gènes A / BAT / Colombie 23 NA était le plus éloigné phylogénétiquement de celui des isolats de l'IAV récents et est lié phylogénétiquement à un segment NA précédent isolé il y a plus de 50 ans.
Ces résultats suggèrent que les événements de réassortiment génétique avec les segments HA et NA contribuent à leur diversité génétique et à l'adaptabilité de ces virus mutés pour infecter de nouveaux hôtes. Une moyenne d'un événement de réassortiment pour tous les 31 ans dans les segments HA et NA a été observée, qui est considérée comme un faible taux de réassortiment qui peut être due aux différences de compatibilité génétique entre les segments, les restrictions écologiques qui empêchent les co-infections ou les altérations de Le système immunitaire de la chauve-souris qui a conduit à l'évolution virale.
Sur la base de ces données expérimentales, les chercheurs ont utilisé la modélisation informatique pour prédire la divergence et les similitudes entre la structure virale isolée et les génomes de référence H18N11. Par exemple, la poche de site active hypothétique de la protéine A / BAT / Colombie / 23 NA semble être plus étroite que celle de la protéine du Pérou H18N11, ce qui est probablement dû à une plus grande plasticité de la boucle 150 et de la mutation K363R qui a modifié la stabilité de la stabilité de cette structure. De plus, cinq mutations dans Ser361, AR363 et Lys242 semblent augmenter la force et la spécificité de la liaison entre les protéines BAT et les protéines virales.
Ces résultats ont un impact significatif sur notre compréhension des interactions des protéines virales et pourraient potentiellement éclairer les recherches futures et le développement de médicaments, en particulier dans la conception de médicaments antiviraux ciblant la protéine NA. »
Étude de signification
La présente étude a identifié une nouvelle IAV dans les chauves-souris de pêche dans les Caraïbes colombiennes. Le gène H de ce virus était le seul segment lié aux 16 sous-types aviaires connus, tandis que les segments PB1, PA, M et NA proviennent probablement d'un événement de réarrangement entre les souches virales existantes circulant dans les chauves-souris.
La divergence moléculaire du segment NA… suggère un nouveau sous-type appelé H18N12. »
Des études existantes ont rapporté que H18N11 ne peut pas infecter efficacement les hôtes non batts. Bien que le gène H de A / BAT / Colombie / 23 soit identique à celui du sous-type H18, les mutations identifiées dans le gène NA peuvent améliorer la capacité de ce virus à infecter et à être transmise entre de nouvelles espèces. Ainsi, il est impératif de surveiller l'émergence de nouvelles souches IAV et de déterminer de manière préventive leur potentiel pour provoquer des épidémies épidémiologiques avant qu'elles ne se produisent.
