Dans une étude récente publiée dans Zoonoses, les chercheurs évaluent la prévalence, la virulence, la résistance aux antimicrobiens et les caractéristiques moléculaires des bactéries résistantes à la méthicilline. Staphylococcus aureus (SARM) provenant de produits alimentaires prêts à consommer (PAM).
Étude: Résistance aux antimicrobiens, virulence et caractérisation génétique du Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline récupéré à partir d’aliments prêts à manger (PAM) en Chine : un nouveau défi pour la sécurité alimentaire. Crédit d’image : thebigland/Shutterstock.com
Sommaire
Le risque d’intoxication alimentaire lié aux produits PAM
S. aureus, que l’on trouve sur la peau et dans les voies respiratoires supérieures, peut provoquer des maladies graves, voire mortelles. Les souches toxigènes synthétisent des facteurs de virulence, tels que la leucocidine Panton-valentine, les entérotoxines staphylococciques (SE) et la toxine 1 du syndrome de choc toxique. Les SE sont la principale cause d’intoxication alimentaire staphylococcique (SFP).
Bien qu’elle soit spontanément limitative et qu’elle mette rarement la vie en danger, la SFP entraîne un inconfort et un fardeau financier importants. Les épidémies de SFP présentent des défis pour l’industrie alimentaire, la santé publique et les entreprises de restauration. De plus, des souches multirésistantes (MDR), notamment le SARM, sont de plus en plus détectées dans les produits alimentaires, ce qui peut provoquer des infections et limiter l’efficacité des traitements actuels.
Bien que les aliments PAM soient populaires, ils présentent un risque accru de contamination microbienne lors de l’emballage, du transport, du stockage et de la vente. En conséquence, une intoxication alimentaire peut facilement survenir en raison d’une contamination par des agents pathogènes d’origine alimentaire.
En 2015, S. aureus une contamination a été signalée dans plus de 4 % des aliments vendus au détail en Chine. Ici, les produits alimentaires PAM ont été les plus contaminés, ce qui a soulevé des inquiétudes en matière de santé publique.
À propos de l’étude
Des aliments PAM ont été échantillonnés dans des dépanneurs, des restaurants, des détaillants, des supermarchés et des marchés de produits agricoles dans 25 provinces chinoises en 2018.
S. aureus a été isolé à partir d’échantillons. Tous les isolats ont été dépistés pour le SARM et testés pour leur sensibilité à 13 agents antimicrobiens, notamment la pénicilline, l’érythromycine, la céfoxitine, l’oxacilline, la clindamycine, la tétracycline, le chloramphénicol, la ciprofloxacine, le triméthoprime-sulfaméthoxazole, la gentamicine, la daptomycine, la vancomycine et le linézolide.
L’ADN génomique des isolats de SARM a été extrait et criblé pour les gènes de virulence. Les lignées de SARM ont été identifiées sur la base du typage de séquences multi-locus (MLST), de la protéine A staphylococcique (spa) typage et cassette de chromosomes staphylococciques mec (CSCmec) en tapant. Les types de séquences et les allèles ont été attribués et les complexes clonaux ont été annotés.
Résultats de l’étude
Un total de 276 isolats de S. aureus ont été cultivés à partir d’aliments PAM, notamment des produits céréaliers, des salades, des sushis, de la viande en sauce, des collations, des glaces et des sashimis. Parmi eux, 30 isolats étaient des SARM. Plus de 90 % des isolats présentaient une résistance à au moins un agent antimicrobien, tandis que les isolats restants étaient sensibles ou présentaient une sensibilité intermédiaire à tous les antimicrobiens.
La résistance la plus élevée a été observée pour la pénicilline et l’érythromycine, respectivement à 87,3 % et 38,4 %. Tous les isolats étaient sensibles à la daptomycine, à la vancomycine et au linézolide.
Soixante-treize isolats étaient résistants à au moins trois antimicrobiens. Seize isolats présentaient une résistance à quatre classes d’antimicrobiens, tandis que 13 étaient résistants à au moins cinq antimicrobiens.
Tous les isolats de SARM étaient résistants à la pénicilline, 22 étaient MDR et 12 profils de résistance ont été observés. Neuf gènes de virulence ont été détectés dans 18 isolats de SARM, dont la plupart possédaient trois gènes de virulence ou plus. Le gène de virulence le plus courant était SE B (Seb), dans lequel quatre profils génétiques de virulence ont été observés.
MLST a révélé 13 types de séquences, ST59, ST398 et ST1 étant les plus répandus. Les types de séquence appartenaient à huit complexes clonaux, CC88 et CC398 étant les plus répandus.
De même, 13 spa et quatre SCCmec types ont été détectés. Notamment, t011, t114 et t437 étaient les plus répandus. spa types détectés dans sept, cinq et sept isolats et étaient associés respectivement aux complexes clonaux CC398, CC1 et CC59.
CSCmecIV était l’élément le plus répandu détecté dans 18 isolats. Dix-sept lignées de SARM ont été identifiées sur la base de MLST, spaet CSCmec analyses de typage.
CC59-t437-SCCmecIV/V, CC398-t011-SCCmecV et CC1-t114-SCCmecIV étaient les lignées les plus répandues. L’électrophorèse sur gel en champ pulsé des isolats de SARM a révélé 18 modèles de 23 isolats regroupés en six groupes avec plus de 76 % de similarité génétique.
Conclusions
Au total, 250 isolats résistants à au moins un agent antimicrobien ont été identifiés, la résistance à la pénicilline étant la plus fréquemment observée. La prévalence de la MDR était de 26,1 %, ce qui était inférieur aux estimations précédentes.
Trente isolats de SARM ont été identifiés et 18 possédaient neuf gènes de virulence. Plus de 50 % des isolats de SARM possédaient plusieurs gènes de virulence. Les isolats de SARM présentant une diversité génotypique similaire présentaient des profils de virulence et des profils de résistance aux antimicrobiens similaires.
Les résultats de l’étude indiquent que la surveillance des génotypes de SARM dans les produits alimentaires PAM permettra aux chercheurs de retracer les futurs problèmes de contamination et d’évaluer la résistance aux antimicrobiens et le risque SFP, ce qui peut conduire à de meilleures mesures de sécurité alimentaire.
