Les virus ont la réputation menaçante de provoquer des maladies, mais certains qui ciblent les bactéries pourraient en fait être bénéfiques pour la santé humaine.
Ceux-ci sont appelés bactériophages, et un groupe d’entre eux nommé d’après le village de Norfolk de Colney pourrait aider à combattre C. difficile infections.
Clostridioides difficile, aussi connu sous le nom C. diff, est une espèce de bactérie qui infecte l’intestin humain. Cela peut devenir un problème majeur lorsque nos microbes intestinaux normaux sont altérés, le plus souvent au cours d’un traitement antibiotique. Cela conduit à une prolifération de C. difficile, avec des toxines qu’il produit, provoquant une diarrhée et une inflammation sévère.
Le traitement implique d’autres cures d’antibiotiques, mais les rechutes et les infections récurrentes sont fréquentes. Les souches deviennent de plus en plus résistantes aux antibiotiques et plus capables de provoquer des maladies graves, il existe donc un besoin évident d’autres traitements.
Cela a conduit les chercheurs de Norwich à rechercher l’ennemi naturel de la bactérie, les bactériophages. Ils ont projeté 27 différents C. diff souches pour tous les bactériophages, en trouvant un, qu’ils ont appelé ΦCD27 (phiCD27). Le séquençage du génome a confirmé que ce phage n’avait pas été découvert auparavant. En fait, les membres du Comité international de taxonomie des virus (ICTV) ont décidé qu’il était suffisamment distinct sur le plan génétique pour former un nouveau groupe ou genre de phages.
L’ICTV a décidé de nommer le nouveau genre Colneyvirus, après l’adresse sur Colney Lane de l’Institute of Food Research (IFR) sur le Norwich Research Park, où il a été découvert pour la première fois. IFR est depuis devenu l’Institut Quadram et a déménagé dans un nouveau bâtiment, également dans la paroisse civile de Colney. Bien que la paroisse de Colney ne compte qu’environ 120 habitants, elle « abrite » toujours quatre instituts de recherche de renommée mondiale, l’un des plus grands hôpitaux universitaires du Royaume-Uni, ainsi qu’une équipe de football de Premier League.
Quatre autres espèces de colneyvirus ont depuis été identifiées et en juin l’ICTV a annoncé la création officielle du virus Colney genre.
Mais quoi C. diff armes éclatantes le premier colneyvirus a-t-il dans son arsenal ?
Les phages existent et se reproduisent en injectant leur matériel génétique dans des bactéries et en utilisant la propre machinerie de l’hôte pour construire de nouveaux virus à l’intérieur de la cellule. Ils libèrent ensuite des enzymes appelées endolysines qui détruisent la paroi cellulaire bactérienne, libérant les nouveaux virus.
Les chercheurs ont trouvé le gène de l’endolysine de ΦCD27 dans la séquence du génome et l’ont mis dans une autre bactérie, E. coli afin qu’ils puissent produire et purifier l’endolysine. Ils ont découvert qu’il était actif contre 30 différents C. diff souches, y compris les souches hypervirulentes à l’origine de l’épidémie actuelle. Il est important de noter que l’endolysine n’a pas affecté les autres espèces bactériennes qui composent généralement le microbiome intestinal humain.
« Ce phage et l’endolysine codée par son génome peuvent fournir une approche ciblée pour lutter contre les infections à C. diff, contrairement à l’utilisation d’antibiotiques à large spectre qui causent des dommages collatéraux en inhibant d’autres membres de la population bactérienne intestinale », a déclaré le professeur Arjan Narbad. , chef de groupe à l’Institut Quadram.
Cependant, pour être efficaces, les endolysines doivent être administrées dans l’intestin, de sorte que l’équipe a également placé le gène dans une souche de bactéries lactiques qui a déjà été utilisée pour administrer des protéines et des vaccins à l’intestin.
L’équipe de recherche pense que cela fournit une plate-forme pour de futurs nouveaux traitements pour lutter contre C. diff. Il reste encore beaucoup à faire pour affiner le système, mais dans la lutte contre cette pandémie bactérienne, le colneyvirus pourrait être un allié vital.
Le Dr Evelien Adriaenssens, présidente du sous-comité sur les virus bactériens, a proposé le nom colneyvirus avec d’autres membres de l’ICTV. Elle n’a pas été impliquée dans la découverte initiale des phages du virus colney, mais a ensuite déplacé ses recherches vers Colney lui-même, créant son groupe de recherche au Quadram Institute.
En tant que taxonomistes des bactériophages, chargés de classer et de nommer les nouveaux taxons, nous cherchons toujours à honorer les personnes, les lieux ou les instituts impliqués dans la première description d’un nouveau groupe de phages. Dans ce cas, j’ai eu l’opportunité d’aider à créer et à nommer un nouveau genre de phages basé sur une découverte de mes propres collègues, faite bien avant de rejoindre l’Institut Quadram. Il semble approprié de nommer le genre d’après Colney, où tant d’excellentes sciences sont effectuées. »
Dr Evelien Adriaenssens, présidente du sous-comité des virus bactériens, Institut Quadram
