Une équipe de chercheurs de l'Université de Göttingen a développé un logiciel innovant pour la simulation de programmes d'élevage.
Le « Modular Breeding Program Simulator » (MoBPS) permet de simuler des programmes d'élevage très complexes en élevage d'animaux et de plantes et est conçu pour aider les éleveurs dans leurs décisions quotidiennes.
En outre, le programme est destiné à être la pierre angulaire de futures études en recherche sur la sélection à Göttingen. En plus de critères purement économiques dans l'élevage, l'équipe de recherche vise des objectifs tels que la durabilité, la conservation de la diversité génétique et l'amélioration du bien-être animal. Le logiciel a été présenté dans la revue G3 Genes, Genomes, Genetics.
En simulant des programmes de sélection, des conclusions peuvent être tirées sur les améliorations génétiques. En fait, des problèmes potentiellement problématiques tels que la consanguinité ou des effets néfastes sur la santé des animaux peuvent également être identifiés à un stade précoce. «
Torsten Pook, Center for Integrated Breeding Research, Université de Göttingen
Pook est le principal développeur de MoBPS. Le logiciel offre la possibilité de modéliser de manière réaliste les processus communs en sélection tels que la sélection, la reproduction et la collecte de données (par exemple, informations ADN, observations de traits). En même temps, il peut simuler des millions d'accouplements d'animaux avec certaines fonctionnalités en quelques minutes.
« De la simulation de simples programmes de sélection du maïs, à une prise en compte accrue de la stabilité osseuse dans l'élevage de chevaux, au développement simulé des populations de cerfs rouges dans le Bade-Wurtemberg au cours des 200 dernières années, tout a été fait », a déclaré Pook.
Le prochain objectif de l'équipe de recherche est de développer un module supplémentaire pour MoBPS qui peut automatiquement optimiser les programmes de sélection avec un grand nombre de variables et sous des contraintes données.
La source:
Référence de la revue:
Pook, T., et al. (2020) MoBPS – Simulateur de programme d'élevage modulaire. Gènes G3, génome, génétique.
