Les lymphocytes T jouent un rôle important dans la lutte contre les infections et les cancers ; ils peuvent également être à l’origine de maladies auto-immunes. Aujourd’hui, des chercheurs de l’Institut d’immunologie de La Jolla (LJI) ont découvert de nouveaux gènes dans le sous-ensemble de cellules T « helper » CD4+ qui sont liés au risque de maladies auto-immunes.
Alors qu’ils s’efforcent de faire la lumière sur les fonctions exactes de ces sous-ensembles de cellules T CD4 +, les chercheurs ont découvert des différences majeures entre les donneurs en fonction de la génétique et du fonctionnement des cellules chez les hommes et les femmes.
Pour alimenter de nouvelles recherches sur l’immunité humaine, l’équipe LJI a créé une ressource en ligne gratuite pour d’autres immunologistes du monde entier qui souhaitent étudier les ensembles de données en temps réel, télécharger et utiliser leurs données. Ce partage de données fait partie de la base de données hébergée par LJI sur l’expression des gènes des cellules immunitaires, les locus de traits quantitatifs d’expression (eQTL) et l’épigénomique (DICE).
Cette enquête élargit notre ressource DICE pour aider les scientifiques à trouver des gènes cibles et des types de cellules liés au risque de maladies humaines. »
Pandurangan Vijayanand, MD, Ph.D., professeur LJI, responsable de l’étude, membre du Centre LJI pour l’auto-immunité et l’inflammation et du Centre d’immunothérapie contre le cancer
« Ces cellules sont essentielles à la protection de l’organisme, et nous avons découvert de nombreux nouveaux gènes liés au risque de maladies humaines », déclare le premier auteur de l’étude, Benjamin Schmiedel, Ph.D., instructeur au LJI.
La nouvelle étude de Sciences Immunologie donne à la communauté scientifique le regard le plus approfondi et le plus complet sur les différences d’expression génique entre les sous-ensembles de lymphocytes T CD4+. Les chercheurs ont utilisé une méthode appelée séquençage d’ARN unicellulaire pour comparer les différences d’expression génique dans plus d’un million de cellules T CD4 + provenant de 89 donneurs de sang sains.
Parce que les cellules T peuvent jouer de nombreux rôles dans le corps, tels que « se souvenir » des envahisseurs passés et alerter d’autres cellules immunitaires, les scientifiques du LJI s’attendaient à trouver de fortes différences entre les sous-ensembles de cellules. En fait, ils ont cherché à obtenir des informations sur huit sous-ensembles de lymphocytes T CD4+ prédéfinis qu’ils avaient étudiés lors d’une enquête en 2018. Cellule étude.
Dans des études précédentes, les chercheurs avaient étudié divers sous-ensembles de lymphocytes T isolés à partir d’échantillons de sang sans les stimuler. Pour cette nouvelle étude, l’équipe du LJI a activé les lymphocytes T avant séquençage et analyse. Cette étape a permis aux chercheurs d’imiter la façon dont les cellules réagiraient lorsqu’elles seraient appelées à remplir leur rôle et à protéger le corps contre les infections.
« Stimuler les cellules, c’est comme allumer la lumière ; tout à coup, vous pouvez mieux comprendre le fonctionnement de ces cellules », explique Schmiedel.
Cette enquête a mis en lumière des sous-ensembles cellulaires connus et a révélé des sous-ensembles supplémentaires peu compris. « Pourquoi ces cellules ont-elles des caractéristiques différentes ? » demande Schmiedel. « Il n’y a aucune information dans la littérature pour nous aider à comprendre ce que sont ces cellules, c’est donc quelque chose que nous voulons suivre. »
Déjà, les chercheurs en ont appris davantage sur ces lymphocytes T en effectuant des analyses de locus de traits quantitatifs d’expression unicellulaire (sc-eQTL). Cette technique leur a montré quels gènes sont affectés par la génétique et ont eu les effets les plus profonds sur les différents sous-types de lymphocytes T.
L’équipe a également repéré des différences majeures basées sur le sexe dans le fonctionnement des lymphocytes T. En comparant les cellules de personnes assignées à un homme ou à une femme à la naissance, les chercheurs ont trouvé des variations dans la façon dont les différents sous-ensembles de lymphocytes T CD4+ peuvent communiquer avec d’autres cellules immunitaires et comment ils produisent des cytokines qui combattent la maladie. Le sexe biologique s’est avéré être un facteur important dans la façon dont ces cellules font leur travail.
Ces différences pourraient aider à expliquer pourquoi les hommes sont plus sujets aux maladies infectieuses, comme le COVID-19, ou pourquoi les femmes sont plus vulnérables aux maladies auto-immunes.
« Si nous pouvons comprendre comment une cellule immunitaire d’une femme diffère d’une cellule immunitaire d’un homme, nous pourrions comprendre pourquoi certaines maladies affectent un sexe plus souvent qu’un autre », explique Schmiedel.
