Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de prétirage, les chercheurs ont exploré la cinétique et les variations des variantes préoccupantes/d’intérêt (VOC/VOI) du coronavirus 2 (SARS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère chez les patients non hospitalisés atteints de coronavirus aigu 2019 (COVID-19).
Sommaire
Arrière plan
Les recommandations de prévention de la COVID-19 sont basées sur des données limitées sur la durée de transmissibilité du SRAS-CoV-2 et sa corrélation avec la symptomatologie et les tests de diagnostic de la COVID-19. Des techniques de diagnostic efficaces sont essentielles pour la détection virale, la réduction de la transmission du SRAS-CoV-2 et l’information des fabricants de poly pour une meilleure santé publique mondiale.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont évalué la durée de transmissibilité du SRAS-CoV-2, la corrélation avec les symptômes de l’infection par le SRAS-CoV-2 et les tests du SRAS-CoV-2 chez les patients COVID-19 non hospitalisés.
Des patients adultes ambulatoires atteints d’infections aiguës par le SRAS-CoV-2 ne nécessitant pas d’hospitalisation ont été inscrits à l’étude, et des mesures en série des symptômes du COVID-19 ont été effectuées. Le diagnostic de COVID-19 a été confirmé par une analyse par transcription inverse-réaction en chaîne par polymérase (RT-PCR) d’échantillons d’écouvillonnage nasopharyngé (NP) dans la semaine suivant l’inscription. Les participants ont été invités à remplir des questionnaires complets pour obtenir des données sur l’apparition et la durée des symptômes de la COVID-9.
Des évaluations de suivi ont été effectuées à cinq moments différents, et à chaque visite de suivi, des écouvillons nasaux antérieurs (AN), des écouvillons NP et des échantillons de sérum ont été obtenus des participants. Les écouvillons NP ont été soumis à une analyse RT-PCR pour la détermination de la charge virale. La durée moyenne entre l’apparition des symptômes et le rapport de test initial SARS-CoV-2-négatif a été déterminée, et les risques de transmissibilité ont été estimés sur la base de cultures virales positives.
Seuls les individus sans antécédents de COVID-19 et ceux qui n’ont pas reçu de vaccins contre le COVID-19 ont été inclus dans l’analyse. L’équipe a exclu les personnes en âge de procréer, souffrant de troubles médicaux immunosuppresseurs [e.g., human immunodeficiency virus (HIV) acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), diabetes mellitus type 1, rheumatoid arthritis, multiple sclerosis, and lupus), or were on immunomodulators or glucocorticoid medications, or participated in interventional SARS-CoV-2 infection clinical trials.
Swabs from the anterior nasal (AN) regions were analyzed for the presence of SARS-CoV-2 ribonucleic acid (RNA), spike (S), and nucleocapsid (N) proteins using electrochemiluminescence immunoassays. Serum samples obtained from the participants were assessed for total [immunoglobulin M (IgM), IgA, IgG] titres anti-SARS-CoV-2 S et titres anti-SARS-CoV-2 S IgG par immunoessais chimiluminescents. Des expériences de culture cellulaire ont été réalisées à l’aide de cellules Vero E6 qui exprimaient la sérine protéase transmembranaire 2 et l’enzyme de conversion de l’angiotensine humaine 2 (hACE2) pour l’évaluation de la croissance du SARS-CoV-2.
Les cellules inoculées au SRAS-CoV-2 ont été examinées au microscope pour la mort cellulaire et/ou la formation de syncytia sur 10 jours. Les isolats de culture ont été soumis à une analyse de séquençage du génome entier (WGS) en utilisant la souche SARS-CoV-2 Wuhan-Hu-1 comme référence. Des estimations du risque relatif (RR) pour la positivité de la culture ont été obtenues, avec des ajustements de données pour le sexe, l’âge, la variante et les comorbidités.
Résultats
Un total de 95 adultes ont été analysés, parmi lesquels, les valeurs médianes de la durée entre le symptôme et le premier rapport de test SARS-CoV-2 négatif étaient de neuf jours, 13 jours, 11 jours et> 19 jours pour le S viral, N, la croissance de la culture et l’ARN du SRAS-CoV-2, respectivement. L’étude comprenait principalement des individus jeunes (âge médian de 29 ans), et 43 % d’entre eux étaient des femmes. Au-delà de 15 jours, les cultures et les titres SARS-CoV-2 N étaient rarement positifs, alors que l’ARN du SARS-CoV-2 par RT-PCR restait au-dessus des niveaux détectables chez 26 (sur 51) participants testés après 21 jours à 30 jours de COVID- 19 apparition des symptômes.
Six à 10 jours après l’apparition des symptômes, le SARS-CoV-2 N a montré une forte association avec les cultures (RR 7,6). Quatorze jours après l’apparition des symptômes, la présence de SARS-CoV-2 N (RR ajusté 7,7) restait fortement associée à des cultures positives pour le SARS-CoV-2, quels que soient les symptômes. Neuf, 22 et un patient ont été infectés respectivement par les virus Alpha VOC, Epsilon VOI et Gamma VOC, tandis que 28 patients ont été infectés par un virus non VOC/VOI. La présence de SARS-CoV-2 N était fortement associée à un risque plus élevé de transmissibilité (aRR = 7,7).
La plupart des échantillons (80 %) ont montré une positivité au SRAS-CoV-2 dans les tests de positivité RT-PCR, de culture et de SARS-CoV-2 N dans les cinq premiers jours suivant l’apparition des symptômes. Entre six et dix jours après l’apparition des symptômes, 96 % des échantillons étaient positifs à la RT-PCR, 79 % des patients présentaient une positivité N et 41 % des échantillons présentaient une positivité à la culture. Entre 11 et 15 jours après l’apparition des symptômes, 85 % (n = 82) étaient positifs à la RT-PCR et négatifs à la culture, dont 39 % présentaient une positivité à l’antigène. Parmi tous les participants, les symptômes tels que la fièvre, les symptômes pulmonaires et la perte d’odorat/goût n’étaient pas associés de manière significative à la transmissibilité du SRAS-CoV-2 au cours des deux premières semaines suivant l’apparition des symptômes de la COVID-19.
Conclusion
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont montré que la plupart des patients COVID-19 non hospitalisés avaient le SARS-CoV-2 compétent pour la réplication, ce qui indique une transmissibilité virale pendant 10 à 14 jours après l’apparition des symptômes, ce que les tests SARS-CoV-2 N pourraient estimer efficacement . Ainsi, le test SARS-CoV-2 N 14 jours après l’apparition des symptômes doit être utilisé pour l’arrêt sûr de l’isolement.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
