MGI Tech Co., Ltd. (« MGI »), une société dédiée au développement d'outils et de technologies de base qui stimulent l'innovation dans les sciences de la vie, s'est associée au National Omics Center (NOC) sous l'égide de l'Agence nationale de développement scientifique et technologique (NSTDA) pour tirer parti de la technologie avancée de séquençage pour la recherche sur la conservation des mangroves. Les efforts conjoints visent à relever les défis environnementaux auxquels sont confrontées les mangroves, qui jouent un rôle crucial dans la défense côtière et les moyens de subsistance des communautés locales.
(Cliquez sur l'image ci-dessous pour regarder le film)
Pendant des siècles, les mangroves ont servi de gardiennes de la nature côtière, agissant comme des barrières protectrices et vitales contre l'érosion et les ondes de tempête tout en offrant un refuge aux espèces marines. Ces écosystèmes sont essentiels à l'industrie de la pêche, qui contribue de manière significative à l'économie nationale. Cependant, au cours des 50 dernières années, plus de 60 % des mangroves thaïlandaises ont disparu à cause de la déforestation et du développement urbain. Leur disparition s’accompagne d’une vulnérabilité accrue aux changements environnementaux, ce qui rend les efforts de conservation encore plus urgents.
« Les mangroves nous ont soutenus », a déclaré un pêcheur local. « Ils nous protègent des vagues et donnent aux jeunes poissons et aux crabes un endroit où grandir. Sans eux, notre mode de vie serait en danger. »
Une lentille génétique sur la conservation des mangroves
Comprendre la diversité génétique des mangroves est essentiel pour développer des stratégies de conservation efficaces. Les données génétiques révèlent comment les espèces s'adaptent à des défis tels que l'élévation du niveau de la mer, les changements de salinité et la perte d'habitat. Le séquenceur MGI DNBSEQ-G400RS permet pour la première fois d’évaluer précisément une telle diversité, permettant aux chercheurs d’approfondir cette complexité génétique avec une précision sans précédent, marquant un progrès significatif dans les stratégies de conservation.
Dr Jeremy Shearman, Chercheur senior au CNOa souligné l’intérêt de cette approche. « Les mangroves sont essentielles pour les régions côtières et les estuaires. Ils offrent une protection contre l’érosion contre les vagues et les tempêtes, créant ainsi des pépinières pour les jeunes animaux marins qui reconstituent les stocks océaniques. Comprendre la diversité génétique nous aide à préserver ces précieux écosystèmes.
Il a en outre expliqué : « Le but principal de la recherche était la conservation. Nous voulions identifier les espèces présentes, séquencer leurs génomes pour créer des bases de données de référence et utiliser le séquençage des enzymes de restriction pour mesurer la variation génétique entre les populations de mangroves de toute la Thaïlande.
Comment MGI Tech renforce l’initiative
Au cœur de cette initiative se trouve la technologie de pointe de MGI. La technologie de séquençage DNBSEQ™ exclusive de MGI prend en charge le séquençage de l'ADN associé aux sites de restriction (RAD-seq), qui joue un rôle essentiel dans la création d'une base de données génomique de référence complète et dans l'évaluation de la diversité génétique de ces écosystèmes critiques. La méthode RAD-seq identifie efficacement les marqueurs génétiques, cruciaux pour construire des génomes de référence et comprendre la diversité génétique des populations de mangroves. Cette connaissance est fondamentale pour formuler des stratégies de conservation efficaces ciblant ces écosystèmes vitaux.
Dr Wirulda Pootakham, directrice du CNOa fait remarquer : « La création d'une base de données génomique de référence pour 15 espèces de mangroves en Thaïlande nous permet d'évaluer plus précisément la diversité génétique à l'aide de données ADN. C’est essentiel pour donner la priorité aux efforts de conservation.
La précision de la technologie de séquençage de MGI est transformatrice. « La plateforme de MGI fournit des données de haute qualité qui réduisent les incertitudes dans nos recherches et nous permettent de nous concentrer sur l'obtention de résultats ayant un impact sur la biodiversité », a déclaré Mme Sonicha U-thoomporn, Assistant de recherche au CNO.
« Notre processus de séquençage innovant offre une précision et une efficacité inégalées, essentielles à la recherche, à l'analyse et à la conservation de la biodiversité », a ajouté M. Nitinai Sising, directeur des ventes de MGI, Thaïlande.
Au-delà de RAD-seq, le séquençage de l'ARN permis par MGI améliore encore cette recherche en révélant l'expression des gènes et les mécanismes d'adaptation des mangroves aux environnements riches en sodium. Ensemble, ces techniques offrent une vision intégrée de la biodiversité, de la résilience et de l’adaptabilité des mangroves.
Une vision pour l'avenir
Les contributions de MGI à la conservation des mangroves font déjà des vagues. Cette recherche met non seulement en évidence les nuances génétiques des espèces de mangroves, mais soutient également des initiatives de conservation plus larges en Asie du Sud-Est. Les connaissances génétiques recueillies grâce à cette initiative éclairent les politiques et les pratiques visant à protéger et restaurer les forêts de mangrove, garantissant que ces écosystèmes continuent de bénéficier aux communautés côtières et à l'économie nationale.
Ce travail s’inscrit également dans une vision plus large. L'engagement de MGI en faveur du développement durable s'étend à d'autres projets, illustrés par sa collaboration avec l'Agence nationale indonésienne de recherche et d'innovation sur la biodiversité des algues. Ces partenariats mettent en évidence la manière dont la génomique peut relever les défis écologiques en Asie du Sud-Est et au-delà.
Alors que les mangroves thaïlandaises racontent une histoire de résilience et de rétablissement, le partenariat entre le NOC et MGI fournit un exemple convaincant de la manière dont la science et la technologie peuvent sauvegarder les trésors de la nature. Cette étude de cas souligne le rôle central de MGI dans la promotion des efforts de conservation des mangroves en Thaïlande, en fournissant un modèle d'utilisation de l'innovation génomique pour préserver la biodiversité et soutenir la résilience des écosystèmes pour les générations futures.
« Nous sommes fiers de soutenir d'importantes initiatives scientifiques en Thaïlande qui renforcent les efforts de conservation des écosystèmes locaux et améliorent la vie des membres de la communauté. Notre engagement réside dans l’exploitation d’outils de pointe en sciences de la vie pour faire progresser les initiatives mondiales de développement durable et de protection de l’environnement. En relevant les défis urgents, nous visons à fournir des solutions innovantes et viables qui profitent à la fois à l’humanité et à l’écosystème », a fait remarquer Duncan Yu, président de MGI.
