Une étude récente publiée sur medRxiv* Le serveur de préimpression a évalué l’efficacité des vaccins contre les variantes Omicron et Delta du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère-2 (SRAS-CoV-2).
Étude : Schéma complet comparatif et efficacité de rappel des vaccins COVID-19 dans la prévention des infections par le SRAS-CoV-2 avec les variantes SARS-CoV-2 Omicron (BA.1) et Delta (B.1.617.2). Crédit d’image : Studio romantique/Shutterstock
Depuis l’émergence de la variante SARS-CoV-2 Omicron en novembre 2021, les infections mondiales à coronavirus 2019 (COVID-19) ont fortement augmenté à un rythme sans précédent. Cette nouvelle variante, classée comme variante préoccupante (VOC) par l’Organisation mondiale de la santé (OMS), contient plus de 30 mutations qui confèrent une transmissibilité accrue et des traits d’évasion immunitaire.
Des cas de percée du vaccin Omicron et des réinfections ont été observés dans de nombreux pays, ce qui soulève des inquiétudes quant à l’efficacité des vaccins et des traitements disponibles contre la nouvelle variante. Des études ont rapporté une efficacité réduite des vaccins BNT162b2, ARNm-1273 et ChAdOx1 contre la variante Omicron ; cependant, la stimulation des réponses immunitaires avec une dose de vaccin supplémentaire a augmenté la neutralisation.
Sommaire
L’étude
Dans la présente étude, les auteurs ont mesuré l’efficacité des vaccinations primaires et de rappel contre les COV SARS-CoV-2 Omicron et Delta et ont comparé les valeurs du seuil de cycle (Ct) pour les deux variantes chez les cas infectés en fonction du statut vaccinal.
L’étude a été menée au Portugal entre le 6 et le 26 décembre 2021, lorsque le Delta VOC était prédominant en circulation et a été progressivement remplacé par le Omicron VOC. La population étudiée comprenait des résidents portugais âgés de 12 ans ou plus sans antécédents d’infection au COVID-19. Les personnes de plus de 50 ans ont été incluses pour évaluer l’effet des rappels car la population plus jeune n’était pas éligible aux rappels.
La variante Omicron est détectée sur la base d’un signal d’échec cible du gène S (SGTF) dans les tests de transcription inverse-réaction en chaîne par polymérase (RT-PCR) en raison de la suppression Δ69-70 dans sa protéine de pointe qui la différencie du Delta VOC. Les auteurs ont identifié des infections à Omicron par séquençage du génome entier (WGS) et/ou par SGTF, et tous les échantillons SGTF-positifs ont été considérés comme des variants Delta.
Au Portugal, les vaccins à deux doses comme le BNT162b2, l’ARNm-1273, le ChAdOx1 et le vaccin à dose unique de Janssen sont utilisés pour la primovaccination, et les vaccins BNT162b2 et l’ARNm-1273 sont utilisés pour les doses de rappel. Le statut vaccinal des cas infectés a été stratifié comme 1) non vacciné, 2) primo-vaccination partielle où le diagnostic de COVID-19 (infection percée par le vaccin) a été confirmé dans les 14 jours suivant la fin du traitement vaccinal (deux doses ou dose unique) , 3) vaccination primaire complète avec diagnostic de COVID-19 après 14 jours de vaccination, 4) rappel partiel lorsque les personnes vaccinées ont été infectées par le COVID-19 en moins de 14 jours, et 5) rappel complet lorsque le COVID-19 l’infection a été diagnostiquée après 14 jours d’administration du rappel.
Un test du chi carré a été utilisé pour comparer les caractéristiques des patients infectés par Omicron et Delta et une analyse de régression logistique a été utilisée pour mesurer les probabilités ajustées de confusion d’une vaccination complète/de rappel. Le rapport de cotes (OR) a été calculé et une valeur OR de 1 n’indiquait aucune différence dans les probabilités de vaccination, un OR < 1 signifiait une efficacité vaccinale comparativement plus élevée contre le VOC Omicron que le Delta VOC, et une valeur OR > 1 indique une plus faible l’efficacité de la vaccination contre le variant Omicron par rapport au variant Delta.
Résultats
Au total, 13 134 des 15 001 échantillons collectés ont été examinés, les boîtiers Omicron représentant 37,3 % des échantillons. Les auteurs ont observé une valeur OR de 2,1 pour les vaccins à ARNm et à vecteur viral dans la population étudiée, indiquant une efficacité vaccinale plus faible contre la variante Omicron. Environ 3 737 des participants avaient reçu des injections de rappel et une valeur OR plus élevée de 5,2 a été observée pour les individus boostés infectés par la variante Omicron, suggérant une efficacité moindre des injections de rappel contre Omicron par rapport à la variante Delta.
Les chercheurs ont estimé l’efficacité des vaccins contre l’infection à Omicron à 28,1 % pour la primovaccination et à 68,8 % pour la dose de rappel. La valeur moyenne du Ct pour les cas d’Omicron variait de 18,3 à 18,6 pour différents vaccins alors qu’elle se situait entre 17,8 et 19,5 pour les infections Delta, et ces différences observées n’étaient pas statistiquement significatives.
conclusion
Sur la base des observations ci-dessus, les auteurs ont conclu que la primo-vaccination offrait une protection moindre contre la variante Omicron, mais que l’efficacité du vaccin contre le COV Omicron augmentait après une injection de rappel. On ne sait pas si l’immunité offerte par un rappel pourrait diminuer avec le temps, comme cela a été observé pour la primo-vaccination, et des recherches supplémentaires sont nécessaires pour surveiller les réponses immunitaires après la dose de rappel. Les différences notées pour les valeurs de Ct entre les cas Delta et Omicron n’étaient pas significatives, ce qui suggère que la base moléculaire de la transmission élevée d’Omicron était due à son schéma mutationnel plutôt qu’à une charge virale plus élevée.
Pour résumer, les résultats de l’étude ont révélé que la protection par primo-vaccination ou rappel était plus faible contre la variante Omicron par rapport à la variante Delta ; néanmoins, les doses de rappel offraient une meilleure protection que la primo-vaccination seule. Par conséquent, dans les régions où les cas d’Omicron sont dominants, les doses de vaccin de rappel pourraient aider à réduire le nombre d’infections au COVID-19 et à réduire la gravité clinique de la maladie.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies
