Des cellules aux solutions : L'Atlas des cellules humaines est le pionnier d'un effort mondial visant à cartographier la biologie humaine et à combler les inégalités en matière de santé grâce à la génomique de pointe.
Perspective : L'engagement de l'atlas des cellules humaines envers l'humanité. Crédit d’image : Photographe Sinhyu/Shutterstock
Dans un récent article de perspective publié dans la revue Communications naturellesplus de 30 scientifiques du monde entier ont discuté des plans d'action et des principes de l'initiative scientifique mondiale conçue pour créer des cartes de référence détaillées des cellules humaines, connue sous le nom d'Atlas des cellules humaines (HCA), afin d'établir l'engagement du projet HCA en faveur de l'équité et veiller à ce que l’atlas soit accessible et bénéfique à tous.
Vision et objectif du HCA
Le HCA vise à cartographier les cellules, les éléments fondamentaux de la vie. Il cherche à révolutionner la compréhension de la biologie humaine en cataloguant la diversité des cellules, leurs fonctions et leurs interactions dans les tissus sains. L'objectif du projet est d'utiliser ces connaissances pour améliorer le diagnostic, le traitement et la prévention des maladies au sein de diverses populations.
En outre, le HCA entend combler les lacunes de la biologie cellulaire en abordant les questions de variation des types de cellules entre individus ayant des antécédents génétiques, des expositions environnementales et des expériences de vie différentes. Le projet utilise des techniques de pointe, telles que la génomique unicellulaire et spatiale, pour cartographier les cellules humaines. Ces technologies, auparavant indisponibles à cette échelle, permettent d’obtenir des informations sans précédent sur les comportements unicellulaires et l’organisation des tissus.
Comprendre la diversité cellulaire peut éclairer les mécanismes sous-jacents des maladies et des problèmes de santé, et le HCA a déjà été utilisé pour identifier des types de cellules rares associés à des maladies spécifiques telles que la colite ulcéreuse. Par exemple, les données de l'atlas unicellulaire ont permis l'identification de cellules épithéliales de type M, un type de cellule rare développé dans le côlon enflammé des individus atteints de colite ulcéreuse.
En outre, l'initiative HCA implique un large éventail de scientifiques, notamment des biologistes, des ingénieurs, des cliniciens et des éthiciens, favorisant une approche multidisciplinaire. De plus, en incluant des échantillons provenant d’individus issus de milieux démographiques et géographiques variés, le HCA garantit que les données générées sont représentatives de l’humanité.
Équité et diversité dans la recherche HCA
L'article discutait du profond engagement du HCA envers les pratiques de recherche éthiques, en mettant l'accent sur l'équité, la diversité et l'inclusivité. Historiquement, la recherche biomédicale a été critiquée pour ses préjugés et sa sous-représentation, auxquels le HCA cherche à remédier grâce à des stratégies proactives.
En outre, le projet investit également dans l’autonomisation des communautés locales et des scientifiques. Le HCA implique activement les scientifiques et les communautés locales, garantissant une représentation culturelle, historique et biologique dans ses recherches. L'adhésion est ouverte dans le monde entier aux personnes de plus de 16 ans qui adhèrent aux normes éthiques de HCA.
Il compte actuellement plus de 3 200 membres issus de 99 pays. Le HCA soutient les scientifiques locaux par le biais de formations, de financements de plaidoyer et d'opportunités de leadership tout en relevant des défis tels que le financement limité, les contraintes de ressources et les approbations éthiques. Les efforts notables incluent plus d'une douzaine d'ateliers de formation dans des régions telles que l'Afrique, l'Amérique latine et l'Asie, auxquels ont participé plus de 2 000 chercheurs depuis 2019. Les réseaux régionaux, tels que HCA Asia et HCA Africa, favorisent également la collaboration et l'engagement par le biais d'ateliers de formation réguliers.
En outre, le HCA garantit une collecte d’échantillons éthique grâce à l’engagement communautaire dans les langues autochtones et au consentement éclairé. Les volontaires sont informés des risques, des avantages et de l'utilisation des données. De plus, les échantillons sont anonymisés grâce au codage et collectés en fonction des objectifs du projet. Les échantillons peuvent inclure des tissus provenant de restes chirurgicaux, de dons d’organes ou d’échantillons post-mortem, ainsi que des écouvillons et des tissus pulmonaires provenant d’études sur la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) et des échantillons de sang provenant d’études sur le système immunitaire.
Les échantillons collectés sont ensuite traités sous une surveillance scientifique stricte, garantissant ainsi un minimum de déchets. Le HCA soutient également les laboratoires locaux pour l’analyse des échantillons et forme les scientifiques locaux à des techniques telles que la génomique unicellulaire. Dans la mesure du possible, ces laboratoires sont encouragés à ouvrir leurs installations aux visites communautaires afin de favoriser la transparence et la confiance. De plus, les participants à l’étude et les membres de la communauté sont encouragés à visiter les laboratoires par souci de transparence.
Les données des études HCA sont stockées dans des bases de données codées après la suppression des identifiants personnels, et elles sont mises à disposition dans des référentiels mondiaux. De plus, le HCA propose une formation aux scientifiques locaux en matière d’analyse des données et partage les résultats des études avec les participants et les communautés.
La HCA donne également la priorité à la responsabilité par le biais de son groupe de travail sur l'équité (EqWG), qui promeut la représentation et la participation mondiales à ses initiatives. L'EqWG a défendu une approche « d'équité en action » à travers la sensibilisation, l'éducation et la formation à l'éthique, garantissant que le HCA reflète les priorités et les perspectives de diverses communautés mondiales.
Les auteurs ont déclaré que la HCA s’oppose strictement à l’utilisation abusive des données biologiques à des fins de discrimination ou de profilage racial et préconise l’utilisation éthique de l’information génétique. Les chercheurs ont discuté de quelques exemples historiques d'utilisation abusive des données de recherche et ont déclaré que le HCA reconnaît les abus passés dans la recherche génétique et met l'accent sur les pratiques responsables pour prévenir la stigmatisation ou l'exclusion.
Implications futures et impact plus large
Les chercheurs ont également discuté des implications du HCA pour l’avenir de la recherche médicale. Ils croient que les cartes de référence complètes du HCA ont un potentiel transformateur pour la science biomédicale et les soins de santé, et que la diversité cellulaire du projet constitue une base pour la médecine personnalisée.
L'atlas permet aux chercheurs d'identifier les changements cellulaires dans diverses maladies, ouvrant la voie à des thérapies ciblées et à des traitements plus efficaces. De plus, en démocratisant l’accès aux outils et connaissances scientifiques de pointe, le HCA veille à ce que ses découvertes profitent à toutes les populations, quel que soit leur situation géographique ou leur statut socio-économique.
L'étude a mis en évidence le cadre d'inclusivité, de transparence et de coopération mondiale du HCA et a suggéré qu'il pourrait servir de modèle pour d'autres efforts scientifiques à grande échelle. L'approche de HCA reflète les principes de projets antérieurs tels que le projet Génome humain et le projet 1000 Génomes, mettant l'accent sur l'accès aux données ouvertes et les pratiques de recherche éthiques.
Les auteurs croient fermement que l'accent mis par HCA sur l'équité et l'accès aux données ouvertes a le potentiel d'inspirer des approches similaires dans d'autres domaines.
