KIPA semble prometteur pour prédire la réponse à la chimiothérapie dans le cancer du sein triple négatif

Des chercheurs du Baylor College of Medicine et des institutions collaboratrices développent une stratégie pour prédire la réponse du cancer du sein triple négatif (TNBC) à la chimiothérapie, ce qui serait un outil précieux pour les médecins décidant du traitement avec une meilleure probabilité de succès sur une base individuelle. L’étude paraît dans Communications sur la recherche sur le cancer, un journal de l’Association américaine pour la recherche sur le cancer.

« De multiples innovations de recherche dans le diagnostic du cancer sont exposées dans ce travail », a déclaré le co-auteur correspondant, le Dr Matthew Ellis, membre du Lester and Sue Smith Breast Center et du Dan L Duncan Comprehensive Cancer chez Baylor et également vice-président principal de l’oncologie précoce et de la R&D en oncologie chez AstraZeneca.

Les chercheurs ont utilisé un test de laboratoire appelé Kinase Inhibitor Pulldown Assay, ou KIPA, pour rechercher des protéines qu’ils pourraient cibler pour contrôler la croissance tumorale. Ils ont recherché ces protéines dans 43 biopsies tumorales congelées qui faisaient partie de l’étude précédente du Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC)-TNBC.

Notre objectif initial était de trouver de nouvelles façons de contrôler la croissance des TNBC, en particulier en identifiant puis en inhibant des enzymes appelées kinases produites par la tumeur pour aider à sa croissance. Bien que notre recherche de telles kinases n’ait pas produit de candidats valables, elle a révélé de manière inattendue une opportunité d’améliorer le succès de la chimiothérapie. »

Dr Meenakshi Anurag, auteur co-correspondant, professeur adjoint de médecine au Lester and Sue Smith Breast Center à Baylor

KIPA agit en enrobant de minuscules billes d’inhibiteurs sélectifs de kinases, puis en décomposant les cellules des échantillons de biopsie et en les mélangeant avec les billes. Chaque kinase se lie à son inhibiteur spécifique, le séparant efficacement des autres composants cellulaires, bien que certaines kinases puissent se lier à plusieurs inhibiteurs. Ensuite, les chercheurs collectent et lavent les billes, obtiennent les kinases et utilisent la spectrométrie de masse pour identifier chacune d’entre elles.

« Cette approche n’a pas révélé de kinases que nous pourrions potentiellement cibler pour contrôler la croissance de ces tumeurs ; cependant, le test a capturé sept protéines non kinases, en particulier des protéines de liaison aux purines, qui ont été enrichies en tumeurs qui ont complètement répondu au traitement », a déclaré le premier auteur Junkai Wang, un étudiant diplômé travaillant dans le laboratoire Ellis. « Des analyses plus poussées ont montré que cette signature de protéine de liaison à sept purines prédisait la sensibilité à la chimiothérapie et des résultats cliniques favorables. »

« La signature de liaison des purines pourrait aider à identifier un sous-ensemble de patients TNBC qui devraient recevoir une thérapie expérimentale dès le départ plutôt qu’une approche de chimiothérapie standard inefficace », a déclaré Ellis.

« Bien qu’à l’origine KIPA ait été développé pour la quantification précise des kinases médicamenteuses, cet article démontre que son utilité clinique s’étend au-delà de la quantification des kinases. Avec plus d’analyses d’échantillons cliniques, il y a une grande possibilité que nous soyons en mesure d’identifier des signatures supplémentaires pour de nombreuses stratégies thérapeutiques », a déclaré l’auteur co-correspondant, le Dr. Beom-Jun Kim, membre du Lester and Sue Smith Breast Center et du Dan L Duncan Comprehensive Cancer à Baylor et également directeur associé de la protéomique diagnostique à AstraZeneca.