Des scientifiques de l'Université du Texas Medical Branch (UTMB), aux États-Unis, ont détecté le virus hautement pathogène de la grippe aviaire H5N1 (HPAIV) dans des échantillons de bétail et de lait prélevés dans deux fermes laitières du Texas.
L'étude, actuellement disponible sur le medRxiv serveur de pré-impression*, souligne la nécessité de développer interventions efficaces contre le virus H5N1 HPAIV pour prévenir la propagation du pathogène.
Crédit photo : McKenzie Kizer / Shutterstock
Sommaire
Arrière-plan
*Avis important: medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et qui, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.
Les virus hautement pathogènes de la grippe aviaire de type A (HPAIV) H5N1 ont causé des millions de décès chez les oiseaux sauvages et les volailles dans le monde entier. Récemment, ces virus ont été identifiés chez de nombreuses espèces animales, le clade 2.3.3.4b du HPAIV H5N1 HA étant le type le plus prédominant dans ces événements de contagion.
Le ministère américain de l'Agriculture a récemment détecté une infection par le virus H5N1 HPAIV dans 172 élevages bovins répartis dans 13 États. Quatre employés d'exploitations laitières et neuf employés d'exploitations avicoles sont également soupçonnés d'être infectés par ce virus.
Compte tenu de la gravité de la situation, l’étude actuelle a été conçue pour enquêter sur la présence de nouveaux virus respiratoires dans deux fermes laitières du Texas.
Étudier le design
L'étude a été menée dans deux fermes laitières du Texas, où une infection par le virus H5N1 HPAIV a récemment été détectée chez des bovins. Les propriétaires de la ferme ont invité les scientifiques à mener l'enquête, car ils avaient un projet de recherche visant à étudier de nouveaux virus respiratoires dans les fermes d'élevage aux États-Unis et au Mexique.
Au total, 17 travailleurs agricoles ont été recrutés pour l'étude. Ils ont fourni des échantillons nasopharyngés et sériques pour l'analyse. Cinq des 17 travailleurs ont déclaré souffrir de maladies respiratoires et utiliser différents médicaments pour traiter cette affection.
Dans les deux fermes, un total de 39 échantillons d'écouvillons nasaux de bovins et 14 échantillons de lait ont été prélevés pour des analyses moléculaires, des cultures cellulaires et d'œufs, ainsi que pour le séquençage Sanger et de nouvelle génération afin d'isoler et de caractériser les virus respiratoires.
Des échantillons de bioaérosols de trois heures ont également été collectés dans différentes régions agricoles pour étudier la présence de nouveaux virus dans l’environnement.
Observations importantes
L'étude a détecté le virus H5N1 HPAIV dans neuf des 14 échantillons de lait et dans un des 39 échantillons de prélèvement nasal de bovins. Cependant, aucun des prélèvements nasopharyngés prélevés auprès des ouvriers agricoles n'a été positif aux virus de la grippe A et aux coronavirus.
Un prélèvement nasal prélevé sur une vache malade a montré la présence du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2).
Parmi 14 échantillons de sérum prélevés auprès d’ouvriers agricoles, deux ont montré des niveaux élevés d’anticorps neutralisants contre un virus recombinant de la grippe A H5N1.
Parmi les 24 échantillons de bioaérosols collectés dans les deux fermes, aucun n’a montré de preuve moléculaire de grippe A et de coronavirus.
Des échantillons de lait positifs au virus H5N1 ont été analysés plus en détail à l'aide du séquençage Sanger et du séquençage de nouvelle génération pour la caractérisation virale. Les résultats ont révélé que les virus sont étroitement liés à d'autres souches récentes de virus H5N1 épizootiques du Texas appartenant au clade 2.3.4.4b.
L'analyse mutationnelle a révélé la présence de multiples mutations communes dans les génomes viraux isolés. Ces mutations sont associées à la virulence et à la propagation virales, au changement de spécificité de l'hôte et à la résistance aux médicaments.
Importance de l'étude
L'étude met en évidence la présence d'infections par le virus H5N1 HPAIV chez les bovins de deux fermes laitières du Texas. Bien que le virus n'ait été détecté que dans un seul échantillon de prélèvement nasal de bovin, environ 64 % des échantillons de lait se sont révélés positifs au virus H5N1 HPAIV.
Ces résultats indiquent que même si le virus est rapidement éliminé des tissus nasaux, les bovins infectés peuvent excréter le virus H5N1 HPAIV dans le lait pendant une période prolongée.
Plus important encore, la détection d’anticorps neutralisants anti-HPAIV chez les ouvriers agricoles met en évidence la possibilité d’infections antérieures restées non détectées pendant la phase d’infection aiguë.
Cela met en évidence la possibilité d’une sous-déclaration des infections par le virus HPAIV chez les travailleurs agricoles, ce qui peut ensuite conduire à de grandes épidémies même en dehors des communautés de travailleurs agricoles.
« Je suis convaincu qu'il y a plus de personnes infectées que ce que nous savons », a déclaré à NPR l'auteur principal Gregory Gray, docteur en médecine, titulaire d'un master en santé publique et chercheur en maladies infectieuses à l'UTMB. « C'est en grande partie dû au fait que notre surveillance est très médiocre. »
Les Centres américains pour le contrôle et la prévention des maladies (CDC) décident de vacciner ou non les travailleurs agricoles contre le virus HPAIV en fonction des données de surveillance, qui indiquent une faible prévalence de l'infection par le virus HPAIV.
Cette faible prévalence est due au faible taux de dépistage chez les travailleurs agricoles. De nombreuses infections peuvent rester non diagnostiquées chez les personnes qui ont été exposées à des vaches laitières malades.
« Ce que nous voyons n'est peut-être pas exactement la pointe de l'iceberg, mais ce n'est certainement pas toute l'histoire », a déclaré Richard Webby, directeur du Centre collaborateur de l'Organisation mondiale de la santé pour la grippe à l'hôpital de recherche pour enfants St. Jude à Memphis, dans le Tennessee.
Les études visant à identifier de nouveaux virus respiratoires sont rarement menées dans les fermes laitières par crainte de pertes commerciales. Comme l’a mentionné Gregory Gray, sans efforts de collaboration entre le gouvernement et l’industrie de l’élevage, les risques liés à ce virus aux États-Unis resteront inconnus.
Cela souligne la nécessité de collecter des données épidémiologiques plus complètes, nécessaires à la conception de futures interventions contre le virus H5N1 HPAIV dans les élevages bovins.
*Avis important: medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et qui, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.
