La pandémie de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) s’est propagée dans le monde en 2019, provoquant une crise sanitaire et économique mondiale. La transmission rapide de la maladie combinée aux taux de mortalité élevés dans les groupes à risque ont entraîné des millions de décès et de nombreux pays ont introduit des mesures de distanciation sociale, des blocages et d’autres restrictions.
Étude : L’impact de la vaccination contre le SRAS-CoV-2 sur la transmission des variantes Alpha et Delta. Crédit d’image : BaLL LunLa/Shutterstock
Récemment, avec l’aide de programmes de vaccination de masse, de programmes de réorientation des médicaments et d’anticorps monoclonaux, la pandémie a commencé à être maîtrisée. Cependant, des inquiétudes grandissent au sujet de variantes préoccupantes, telles que la variante Delta, connue pour éviter à la fois l’immunité induite par le vaccin et l’immunité naturelle.
En raison de la menace accrue posée par la variante, des chercheurs de l’Université d’Oxford ont examiné l’impact de la vaccination sur la propagation des variantes Alpha et Delta dans la population.
Une version préimprimée de l’étude est disponible sur le site medRxiv* serveur pendant que l’article est soumis à une évaluation par les pairs.
L’étude
Les chercheurs ont utilisé les données nationales des tests de contact d’Angleterre pour examiner le taux de transmission des variantes. Ils ont réalisé une étude de cohorte observationnelle rétrospective des contacts d’individus convalescents symptomatiques et asymptomatiques. Les scientifiques n’ont inclus que les résultats de ceux qui ont été en contact avec une personne infectée – prouvés par un test PCR – qui ont ensuite passé eux-mêmes un test PCR dans un délai de 1 à 10 jours. Ils n’ont également inclus que des cas de trois laboratoires, car ils ont tous utilisé la même procédure standardisée pour rechercher le gène S codant pour la protéine de pointe, le gène N codant pour la nucléocapside ou la cible ORF1ab.
Les détails sur la vaccination des personnes répondant à ces critères ont ensuite été obtenus à partir de la base de données nationale sur la vaccination. Les résultats de ces tests ont estimé la souche spécifique – la souche Alpha montrera un résultat négatif pour le gène S mais des résultats positifs pour le reste. Tout ensemble complet de résultats avant le 10 mai 2021 a été considéré comme étant pour la souche d’origine. Néanmoins, étant donné la prévalence des souches Alpha et Delta après cette date, tout test positif non Alpha était supposé être Delta.
Une régression logistique multivariée a été utilisée pour examiner la transmission du test positif initial – le cas index – à d’autres contacts. Cette technique est souvent utilisée pour examiner une série de variables prédictives, qui dans ce cas étaient le statut vaccinal, le type de vaccin, le type d’événement de contact, l’âge, le sexe, les symptômes, la prévalence locale de COVID-19 et la privation locale, pour renvoyer un résultat dichotomique. résultat. Les splines cubiques naturelles et la transformation logarithmique ont aidé à tenir compte de la non-linéarité.
Au total, près de 100 000 cas index avec un test PCR positif ont été identifiés, et plus de 150 000 contacts positifs. Douze mille six cent cinquante-sept de ces contacts ont dû être exclus en raison d’informations incomplètes. Cinquante et un mille sept cent quatre-vingt-dix-huit des contacts restants ont été testés positifs. Les âges allaient de 26 à 50 ans et étaient à peu près répartis entre les hommes (44 %) et les femmes (56 %). 70 % des événements de contact ont eu lieu au sein du même ménage, le reste étant réparti également entre les visiteurs, les événements et le travail/l’éducation.
La grande majorité des contacts positifs provenaient de personnes non vaccinées (49 %). Environ 27% ont été partiellement vaccinés et les 23% restants ont été partiellement vaccinés. Ces chiffres concernent les individus vaccinés contre ChADOx1 ; Les cas BNT162b2 ont montré de petites différences mais ont suivi à peu près le même schéma.
Des modèles multivariés ont montré que la double vaccination pour l’un ou l’autre des vaccins réduisait considérablement les risques d’infection pour la souche Alpha, le BNT162b2 offrant potentiellement une petite protection supplémentaire après une ou deux doses.
La variante Delta a montré une transmission accrue du cas index par rapport à Alpha pour les individus asymptomatiques et symptomatiques. En dehors du statut vaccinal, d’autres facteurs qui étaient positivement associés à un test positif étaient le type d’événement de contact, l’âge, le cas index et le contact étant des sexes différents, un indice de privation plus élevé et un syndrome respiratoire aigu sévère local coronavirus 2 (SRAS-CoV- 2) incidence.
Ces résultats sont corroborés par des études antérieures montrant un risque plus élevé pour les individus les plus démunis, ainsi qu’une réponse en anticorps jusqu’à 12 fois inférieure des individus vaccinés à la souche Delta par rapport à la souche d’origine trouvée à Wuhan.
Les auteurs soulignent l’importance de leurs résultats pour montrer le danger accru des variantes préoccupantes, en particulier compte tenu des cas relativement élevés de personnes doublement vaccinées qui ont encore été testées positives pour COVID-19. Ces résultats pourraient être très importants pour éclairer les politiques de santé publique.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.
