- Les facteurs de risque du diabète de type 2 sont à la fois environnementaux et génétiques, et les chercheurs ont identifié jusqu’à présent de nombreux facteurs de risque génétiques.
- Aujourd’hui, cependant, la plus grande étude d’association à l’échelle du génome jamais réalisée sur des personnes atteintes de diabète de type 2 a découvert encore plus d’emplacements de variantes à risque qu’auparavant.
- Elle a également identifié différents groupes de variantes qui contribuent au risque de développer la maladie, révélant ainsi davantage les différents mécanismes qui sous-tendent la maladie.
Les études d'association à l'échelle du génome sont possibles depuis le premier séquençage du génome humain en 2003. Elles nous permettent de comprendre quelles régions du génome et quelles variantes génétiques sont associées à un risque accru de certaines maladies.
Couplé à l’avènement des cartes cellulaires et des bibliothèques génomiques, il est désormais possible pour les chercheurs d’identifier non seulement les variantes qui pourraient avoir un impact sur le risque, mais également de comprendre ce qu’elles contrôlent et les mécanismes cellulaires dans lesquels elles jouent un rôle.
Alors, que peuvent nous apprendre les marqueurs génétiques sur des maladies répandues, comme le diabète de type 2 ? C'est ce que pensent les chercheurs qui mènent une nouvelle étude — dont les résultats apparaissent désormais dans
Ce que la génétique nous apprend sur le diabète de type 2
Le diabète de type 2 se caractérise par une sensibilité réduite à l’insuline des cellules, ce qui signifie qu’elles sont moins capables d’absorber le glucose dans le sang.
Cela conduit à des taux de glucose sanguin (sucre) chroniquement élevés, ce qui peut augmenter le risque de complications, telles que des maladies cardiovasculaires et des lésions nerveuses.
Il existe de nombreux facteurs de risque connus pour le diabète de type 2, notamment les membres de la famille qui en sont atteints, le fait d'être d'origine africaine ou asiatique, l'hypertension artérielle, l'obésité et le syndrome des ovaires polykystiques (SOPK), entre autres.
Des études d'association à l'échelle du génome ont révélé d'autres liens intéressants entre le diabète de type 2 et d'autres pathologies. Par exemple, une étude réalisée en 2023 a montré qu’un certain nombre de variantes de risque génétique étaient communes au diabète de type 2 et aux symptômes dépressifs.
Le professeur Inga Prokopenko, qui étudie l'impact de la génétique sur le diabète et le contrôle glycémique à l'Université de Surrey, a déclaré : Actualités médicales aujourd'hui que la façon dont nous envisageons le diabète de type 2 a changé ces dernières années :
« Un dernier point très important est que de nombreux GWAS à grande échelle antérieurs [genome-wide association studies] les méta-analyses sur le diabète de type 2 se sont concentrées sur [type 2 diabetes] comme résultat, mais il était clair qu'en tant que [type 2 diabetes]en tant que maladie, progresse, il existe de nombreuses complications de cette maladie. Ces complications majeures sont très importantes, comme la néphropathie diabétique, la rétinopathie, etc.
Nouvelles variantes génétiques liées aux complications du diabète
L'étude récemment publiée dans Nature est la plus grande étude d'association pangénomique sur le diabète de type 2 à ce jour, et elle comprenait des données génomiques de 2 535 601 individus, dont 428 452 souffraient de diabète de type 2.
De nombreuses études d'association à l'échelle du génome présentent des données provenant d'un ensemble de données européens à prédominance blanche, mais cette étude a présenté des données provenant de six groupes ancestraux, à savoir : européens, asiatiques de l'est, afro-américains, sud-asiatiques, sud-africains et hispaniques avec les américains, les africains de l'ouest et les européens. ascendance.
Cependant, la majorité des participants étaient toujours d’ascendance majoritairement européenne, 60 % de la cohorte étant composée de ce groupe.
Un consortium mondial de chercheurs a découvert 1 289 variantes génétiques, dans 611 zones du génome appelées loci, dont 145 étaient de nouvelles découvertes.
Ils ont ensuite cartographié ces variantes sur 37 phénotypes cardiométaboliques, notamment le rapport taille-hauteur, le pourcentage de graisse hépatique, le cholestérol LDL et HDL, la tension artérielle, l'insuline à jeun et autres, pour découvrir si certaines variantes étaient associées à certains phénotypes ou traits.
Ils ont ensuite identifié huit « groupes » non chevauchants caractérisés par des sous-ensembles de variantes associées à certains traits cardiométaboliques.
Ces groupes comprenaient, entre autres, le dysfonctionnement des cellules bêta, l'obésité et le métabolisme hépatique et lipidique (graisse), et ont également caractérisé si les personnes atteintes de ces groupes présentaient une sécrétion d'insuline accrue ou diminuée, ou une sensibilité à l'insuline augmentée ou diminuée.
L'un des auteurs correspondants, le Dr Benjamin F. Voight, de la faculté de médecine Perelman de l'Université de Pennsylvanie, a déclaré : MNT que « [i]Il s'avère que les variantes génétiques qui ont contribué à nos clusters ne se chevauchent pas [with] les uns les autres – de sorte que le risque de maladie des patients est influencé à des degrés divers par ces groupes.
La génétique peut-elle prédire les conséquences cardiovasculaires du diabète ?
Ensuite, les chercheurs ont examiné si les huit groupes qu'ils avaient déterminés pouvaient être utilisés pour prédire l'évolution des maladies cardiovasculaires chez ces participants.
Ils ont développé des scores polygéniques chez 279 552 autres individus pour lesquels ils disposaient de données génomiques, dont 30 288 atteints de diabète de type 2, et ont étudié s’il existait une association avec des résultats cardiovasculaires et des groupes de variantes génétiques.
Les associations les plus significatives découvertes ont montré que le risque d’hospitalisation pour insuffisance cardiaque était augmenté de 15 % chez les personnes positives pour le groupe de variantes génétiques de l’obésité.
Ils ont également constaté que le fait d'avoir un groupe de variantes génétiques positives à la proinsuline dans les cellules bêta réduisait de 10 % le risque d'hospitalisation pour insuffisance cardiaque. Ce groupe était également associé à un risque inférieur de 10 % de décès d’origine cardiovasculaire et à un risque inférieur de 6 % d’événements cardiovasculaires majeurs et de crise cardiaque.
Le Dr Voight a déclaré :
« Je pense que la porte potentielle qu'ouvre ce type de travail est celle où l'on peut commencer à analyser comment différents « sous-types » génétiques du diabète de type 2 pourraient moduler le risque de complications du diabète – soit un peu, soit beaucoup. De plus, le sous-typage génétique pourrait également nous donner de meilleurs indices sur les gènes sous-jacents et la biologie qui contribuent le plus à ces complications.
Le professeur Prokopenko, qui n'a pas participé à cette recherche, a déclaré qu'elle représentait un progrès significatif dans l'analyse de grands ensembles de données et augmentait d'un quart le nombre de variantes de risque dont nous avons connaissance.
« Pour nous, scientifiques, il s'agit d'une ressource importante, qui permettra de nombreuses études de suivi, expériences, etc., ainsi que de nouvelles découvertes de médicaments », a-t-elle déclaré. MNT.
« Les résultats de cette étude et les informations générées nous permettront d'améliorer la vie des personnes atteintes de diabète grâce à de nouveaux traitements, de nouvelles méthodes de soins, de nouvelles façons de [treating] à l'avenir, grâce à la prédiction de la susceptibilité individuelle ou à la capacité de distinguer les sous-types potentiels de diabète », a noté le professeur Prokopenko.
