Des différences régionales dans la propagation des deux principaux groupes ancestraux du Japon ont été révélées grâce à de nouvelles recherches à l’Université de Tokyo. On pense généralement que les Japonais descendent de deux groupes principaux : les chasseurs-cueilleurs Jomon et les agriculteurs immigrés de l’Asie de l’Est continentale. Un outil d’analyse statistique nouvellement développé, appelé l’indice de marqueur d’ascendance (AMI), a été utilisé pour découvrir la distribution et le mélange de ces groupes à travers le Japon.
Les chercheurs ont également découvert que les Jomon avaient des traits génétiques qui les rendaient plus résistants à la famine mais plus sujets à l’obésité, tandis que les agriculteurs d’Asie de l’Est étaient plus protégés contre les maladies infectieuses mais plus sujets à des réponses inflammatoires exacerbées, telles que l’asthme. En plus de fournir une compréhension plus approfondie de l’histoire de la population du Japon, ces résultats pourraient aider à identifier les problèmes de santé susceptibles d’être plus répandus dans chaque région du Japon, ce qui pourrait contribuer à une offre médicale plus adaptée à l’avenir.
Demandez à quelqu’un du Japon à propos des Japonais, et ils vous diront peut-être qu’ils ont une société très homogène. Mais bien sûr, il est entendu que partout est composé d’un mélange de personnes, que cette diversité se soit produite historiquement ou plus récemment. On pense que les Japonais modernes descendent principalement d’un mélange de deux populations : les chasseurs-cueilleurs Jomon (qui sont arrivés vers 14 000 avant J.-C.) et les agriculteurs d’Asie de l’Est continentale (qui ont commencé à migrer vers 800 avant J.-C.). Bien que les preuves archéologiques aient fourni un aperçu de ces deux communautés et de leur histoire, les détails de leur propagation régionale et de leur mélange n’ont pas été entièrement compris.
Je voulais découvrir les origines des peuples de l’archipel japonais afin d’explorer mes propres racines. J’ai donc co-développé une méthode statistique pour détecter spécifiquement les variantes génétiques de l’ascendance Jomon, par rapport aux variantes provenant des Asiatiques de l’Est continentaux ou d’autres nouvelles variantes. Nous l’avons appelé l’indice des marqueurs d’ascendance (AMI). En anthropologie, les statistiques sommaires sont couramment utilisées pour détecter les composants génétiques résultant du mélange (appelé mélange) de populations précédemment isolées. Le plus largement utilisé est appelé « S* », qui est utile pour identifier l’ascendance archaïque dérivée des hominines, c’est-à-dire les Néandertaliens et les Dénisoviens, dont le temps de divergence avec les humains modernes remonte à des centaines de milliers d’années. Mais cet outil n’a pas fonctionné pour l’histoire de la population du Japon. En comparaison, notre statistique AMI peut détecter des variantes génétiques dérivées de l’ascendance à partir du mélange de deux populations plus récemment divergentes (se produisant il y a seulement des milliers d’années), comme nous l’avons fait au Japon. »
Yusuke Watanabe, professeur adjoint de projet, Graduate School of Science, Université de Tokyo
En utilisant AMI et un marqueur génétique d’ascendance Jomon appelé le score d’allèle Jomon (JAS), l’équipe a étudié les données génétiques de 10 842 personnes à travers le Japon. Leurs scores génétiques indiquaient la proportion d’ascendance Jomon, et par rapport aux indicateurs de taille de population de l’archéologie, les chercheurs ont trouvé une corrélation. Des études antérieures avaient montré que la riziculture avait commencé dans la partie nord de Kyushu, la plus méridionale des îles principales du pays, puis s’était étendue à la région de Kinki, dans le centre-ouest du Japon (qui comprend aujourd’hui Osaka et Kyoto) et à l’île principale de Shikoku. dans le sud-ouest. Les scores de ces régions étaient relativement faibles, indiquant un Jomon inférieur et une population immigrée plus élevée. En comparaison, les scores étaient les plus élevés pour l’île méridionale d’Okinawa, suivie de la région de Tohoku au nord-est et de la région de Kanto au centre du Japon (contenant Tokyo), où les anthropologues considèrent que les gens possèdent plus d’ascendance Jomon.
De plus, tout en étudiant les variantes génétiques dérivées de Jomon dans le japonais moderne, l’équipe a également trouvé des différences importantes. Alors que les chasseurs-cueilleurs Jomon avaient des traits qui les rendaient plus résistants à la famine (en raison d’une glycémie plus élevée et de taux de triglycérides gras), les agriculteurs continentaux d’Asie de l’Est étaient généralement mieux protégés contre les maladies (grâce à une teneur plus élevée en protéine C-réactive [CRP] et le nombre de globules blancs éosinophiles, qui sont impliqués dans la réponse immunitaire). Ils ont ensuite examiné les différences régionales dans les taux d’obésité chez les enfants de 5 ans et l’incidence de l’asthme. Les personnes des régions avec une proportion plus élevée d’ascendance Jomon semblaient avoir une prédisposition génétique à l’obésité, tandis que celles des régions avec une ascendance continentale plus élevée en Asie de l’Est ont un asthme plus exacerbé (car les mêmes éosinophiles qui protègent contre la maladie peuvent contribuer aux réponses inflammatoires).
« Nous avons découvert que la proportion d’ascendance Jomon est significativement liée aux différences régionales modernes en matière d’obésité et d’asthme chez les Japonais », a déclaré Watanabe. « Étant donné que les variations de l’ascendance Jomon semblent jouer un rôle dans les variations régionales de la maladie au Japon, il est possible qu’à l’avenir, la médecine personnalisée doive prendre en compte ces différences régionales ancestrales.
« Maintenant, j’explore les utilisations potentielles des données sur les variantes génétiques dérivées de Jomon pour de nouvelles recherches, ce qui pourrait nous aider à mieux comprendre les caractéristiques physiologiques de nos ancêtres », a expliqué Watanabe. « Cependant, l’AMI n’est pas seulement applicable aux Japonais, mais aussi à d’autres populations humaines mixtes telles que les océaniens éloignés (indigènes des îles de la région de l’océan Pacifique à l’est de la Nouvelle-Guinée et des îles Salomon), les malgaches (du pays insulaire de Madagascar dans l’océan Indien, au large de la côte sud-est de l’Afrique) et plus encore. J’espère donc que AMI sera utilisé par d’autres pour approfondir la recherche sur la diversité et leurs propres racines.
