La stabilité des variants du SARS-CoV-2 dans les aérosols et sur le polyéthylène haute densité

Dans une récente étude publiée sur bioRxiv*, les chercheurs ont montré que certaines variantes préoccupantes (COV) du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) présentent une plus grande stabilité de surface et d’aérosol que la souche ancestrale (WA1).

Arrière plan

Plusieurs nouvelles lignées et variantes du SRAS-CoV-2 sont apparues depuis l’émergence de la souche de la lignée A. Le SRAS-CoV-2 se propage principalement par voie aérienne ; Les voies de transmission par fomite et par contact ont également été impliquées. L’Organisation mondiale de la santé (OMS) a classé cinq variantes du SARS-CoV-2 (Alpha, Beta Gamma, Delta et Omicron) comme COV, qui présentent une transmissibilité plus élevée que le SARS-CoV-2 ancestral.

À propos de l’étude

Dans la présente étude, les chercheurs ont évalué si la transmissibilité accrue des COV du SRAS-CoV-2 s’est produite en raison de changements dans la stabilité de la surface et des aérosols. La stabilité du variant SARS-CoV-2 a été évaluée dans les aérosols et sur les surfaces en polyéthylène. Aérosols (taille inférieure à 5 μm) de variantes du SRAS-CoV-2 de 10^5,75 à 10⁶ dose infectieuse médiane en culture tissulaire (TCID₅₀)/ml ont été produits à l’aide d’un nébuliseur Collison.

L’inoculum a été introduit dans un tambour Goldberg rotatif pour générer l’environnement aérosolisé. La stabilité de surface sur polyéthylène a été mesurée en appliquant une solution de 50 μl contenant environ 10⁵ TCID₅₀ du virus. Les taux de décroissance exponentielle du SRAS-CoV-2 ont été comparés à zéro, trois et huit heures.

Des expériences à cycle unique (zéro à trois heures et zéro à huit heures) ont été réalisées en triple, et des échantillons viraux ont été collectés au début et à la fin. Des tests de réaction en chaîne par polymérase à transcription inverse (RT-PCR) ont été effectués sur des échantillons d’air contre le gène de l’enveloppe (E) du SRAS-CoV-2. Les échantillons d’air ont été titrés sur des cellules Vero E6 pour déterminer la concentration des virions SARS-CoV-2 viables restants.

Résultats

Des virions viables de tous les COV du SRAS-CoV-2 ont été récupérés du tambour Goldberg. Le nombre de virions viables a diminué de façon exponentielle avec le temps. La demi-vie de la souche SARS-CoV-2 WA1 dans les aérosols était de 3,24 heures. Les variantes B.1, Alpha et Beta avaient des demi-vies plus longues que la souche ancestrale : 4,01, 6,06 et 5,03 heures pour les variantes B.1, Alpha et Beta, respectivement.

En revanche, la variante Delta avait une demi-vie similaire (3,16 heures) à WA1, mais la variante Omicron (2,11 heures) avait une demi-vie plus courte que WA1. Ensuite, les chercheurs ont calculé le rapport a posteriori entre la variante et les demi-vies WA1 pour chaque COV. Les estimations de ratio ont indiqué que la divergence évolutive précoce de la protéine de pointe par rapport à la pointe ancestrale a apparemment augmenté la stabilité relative.

Cependant, une divergence supplémentaire des pics a inversé la stabilité aux niveaux WA1 ou même l’a réduite à des niveaux inférieurs. Ensuite, la stabilité des COV par rapport à la souche ancestrale a été mesurée sur des surfaces en polyéthylène. Toutes les variantes ont montré une décroissance exponentielle au fil du temps sur les surfaces en polyéthylène, comme observé avec les aérosols.

La demi-vie de la souche WA1 était de 4,83 heures. Les variantes B.1, Alpha et Beta avaient des demi-vies légèrement plus longues de 5,19, 5,13 et 5,66 heures, respectivement, que WA1. Comme dans les aérosols, la variante Delta (4,36 heures) a présenté une demi-vie comparable à WA1, tandis que la variante Omicron (3,59 heures) avait une demi-vie plus courte.

conclusion

En résumé, les chercheurs ont observé une légère augmentation de la stabilité du SRAS-CoV-2 dans les aérosols de la souche ancestrale à la variante bêta. Néanmoins, la stabilité des aérosols du SARS-CoV-2 Delta était similaire à la souche ancestrale, mais la variante Omicron avait une stabilité réduite. Les mesures de stabilité de surface ont donné un schéma similaire, ce qui implique que des facteurs similaires régissent la stabilité du SRAS-CoV-2 sur les surfaces et dans les aérosols.

De plus, les résultats suggèrent que la stabilité des aérosols n’est peut-être pas le facteur déterminant de la transmissibilité accrue des COV du SRAS-CoV-2. L’augmentation de la stabilité de la lignée B.1 et de ses descendants pourrait être due à la sélection de traits favorisant une transmission accrue. Dans l’ensemble, il est peu probable que l’hétérogénéité de la stabilité des COV du SRAS-CoV-2 sur les surfaces ou les aérosols détermine l’épidémiologie au niveau de la population des variantes du SRAS-CoV-2.

*Avis important

bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies