Dans une étude récente publiée dans le Journal international des maladies infectieusesles chercheurs ont évalué la corrélation entre la détection du virus monkeypox (MPV) dans les eaux usées et les hospitalisations associées au MPV en Pologne.
Étude : détection du virus Mpox dans les eaux usées et nombre de patients hospitalisés dans la région métropolitaine de Poznan, en Pologne. Crédit d’image : CI Photos / Shutterstock
Arrière-plan
L’épidémiologie basée sur les eaux usées (WBE) est une approche précieuse pour estimer l’étendue d’une épidémie et la diversité génomique des agents pathogènes responsables. WBE peut être utilisé pour compléter les données obtenues via le suivi clinique et augmenter la précision des estimations et des rapports de surveillance. WBE est basé sur la détection qualitative et quantitative des agents pathogènes basée sur la réaction en chaîne par polymérase (PCR).
WBE permet de surveiller la transmission d’agents pathogènes parmi les populations lorsque les techniques épidémiologiques conventionnelles peuvent ne pas être facilement disponibles en raison d’un accès inadéquat aux établissements de santé et aux diagnostics, d’une capacité de laboratoire de diagnostic écrasante, de l’hésitation de la société à subir des tests de diagnostic et de la disponibilité accrue de kits d’auto-test. WBE permet également le suivi des cas asymptomatiques et de la transmission d’agents pathogènes énigmatiques.
Des acides nucléiques MV ont été identifiés dans les systèmes de drainage de cinq districts néerlandais, huit usines de traitement des eaux usées (WTP) situées en Californie, cinq WTP en Floride, des WTP en France et des infrastructures aéroportuaires en Italie. Cependant, les données sur la corrélation entre la détection de MPV dans les eaux usées et les hospitalisations associées sont limitées.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont surveillé le MPV dans les eaux usées des stations d’épuration de la région métropolitaine de Poznan en Pologne et l’ont corrélé avec le nombre d’hospitalisations.
Des échantillons hebdomadaires ont été prélevés sur deux stations d’épuration, la station d’épuration de la rive gauche et la station d’épuration centrale en Pologne, entre juillet et décembre 2022 (semaine 27 à semaine 48). Les acides nucléiques ont été extraits des échantillons d’eaux usées concentrées pour la détection de l’ADN de l’acide désoxyribonucléique MPV à l’aide de la PCR en temps réel.
L’équipe a analysé les niveaux du virus de la marbrure légère du poivre (PMMoV, virus indicateur des eaux usées) et du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) dans les eaux usées à l’aide de la transcription inverse quantitative-PCR (RT-qPCR). Les échantillons avec des valeurs de seuil de cycle (Ct) <40 ont été considérés comme MPV-positifs. De plus, le rapport des valeurs Ct obtenues pour le MPV et le PMMoV a été calculé pour évaluer la transmission du MPV chez les individus de Poznan.
Plus le rapport est faible, plus la quantité d’ADN de MPV détectable dans les eaux usées est élevée. Le département des sciences médicales de l’Université de Poznan et la clinique des maladies infectieuses, d’hépatologie et des immunodéficiences acquises (DCIDHA) ont fourni un décompte hebdomadaire des hospitalisations associées au MPV.
Résultats
L’ADN du MPV a été identifié au cours des semaines 29.0, 43.0 et 47.0 au WTP central et entre les semaines 37.0 et 38.0 et les semaines 40.0 et 43.0 au WTP de la rive gauche (c’est-à-dire principalement entre la mi-septembre et la fin octobre au WTP gauche -Bank WTP) à 38 cycles en moyenne. Les ratios MPV/PMMoV variaient entre 1,5 (au cours de la semaine 42,0 au WTP Rive Gauche) et 1,8 (à la semaine 43 au WTP Rive Gauche).
Il y a eu une certaine réduction de l’ADN du MPV entre les semaines 37 et 40, suivie d’une élévation rapide au cours de la semaine 41,0 et la semaine suivante au WTP de la rive gauche. Les autorités de santé de la population ont documenté 22 cas de monospace entre juillet et décembre 2022, et la plupart des admissions à l’hôpital ont été signalées entre la mi-juillet et la mi-août.
La détection de MPV n’était pas corrélée avec le nombre d’hospitalisations en Pologne. Il convient de noter que la chloration a été effectuée sur les eaux usées inactives du DCIDHA avant leur rejet dans les systèmes de drainage publics. Ainsi, les hospitalisations associées au MPV n’ont montré aucun impact significatif sur la détection de l’ADN du MPV dans le WTP central. Tous les échantillons positifs au MPV étaient associés à des cas de MPC non hospitalisés parmi le public, selon l’auteur. De plus, la détection de MPV au WTP de la rive gauche entre la mi-septembre et la mi-octobre n’a montré aucune corrélation avec le nombre de cas de MPV signalés, indiquant plusieurs infections à MPV non détectées chez les individus de Poznan.
L’épidémie actuelle de MPV, causée par un MPV d’origine ouest-africaine, se présente dans la plupart des cas avec des infections bénignes avec des symptômes tels qu’une éruption cutanée, de la fièvre et une hypertrophie des ganglions lymphatiques, ou des symptômes inhabituels comprenant aucune ou quelques lésions virales, limitées aux organes génitaux et périanaux. Régions. Par conséquent, les personnes infectées par le MPV peuvent ne pas demander de soins et l’infection peut ne pas être documentée. Quelques patients peuvent également éviter de demander de l’aide en raison de la stigmatisation sociale qui entoure le MPV, ce qui entraîne une sous-déclaration des infections par le MPV et des rapports biaisés par les responsables de la santé concernant l’étendue de l’épidémie de MPV.
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont mis en évidence la détection de l’ADN du MPV dans les eaux usées lorsqu’aucun cas d’infection par le MPV n’a été documenté. Cependant, la détection du MPV dans les eaux usées n’était pas corrélée aux hospitalisations associées au MPV. Les résultats ont étayé l’idée que WBE pourrait déterminer l’ampleur d’une épidémie. Cependant, l’épidémie de MPV est sous-estimée car les autorités de santé publique n’ont pas identifié de nombreux individus infectés par le MPV.
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