Une nouvelle étude, « Sensitive poliovirus detection using nested PCR and nanopore sequencing: a prospective validation study », publiée aujourd’hui (17 août 2023) dans Nature Microbiology, prouve que l’utilisation du DDNS pour détecter les épidémies de poliomyélite peut faire économiser aux autorités de santé publique un temps et de l’argent cruciaux.
Cette recherche a été menée conjointement par des chercheurs de l’Institut National de Recherche Biomédicale de Kinshasa qui ont mis en place le DDNS en République Démocratique du Congo (RDC) pour la détection des épidémies de poliomyélite en collaboration avec le MHRA, l’Imperial College de Londres, l’Université d’Edimbourg et divers laboratoires du Réseau mondial de laboratoires pour la poliomyélite (GPLN) de l’Organisation mondiale de la santé (OMS), avec le soutien de la Fondation Bill et Melinda Gates.
C’est la première fois que ce type de technique scientifique est utilisé pour détecter la poliomyélite. Des techniques similaires ont déjà été utilisées pour détecter le COVID-19, Ebola, la rougeole et la variole du singe.
En permettant aux échantillons d’être testés dans le pays d’origine de l’épidémie plutôt que d’être envoyés à des laboratoires spécialisés à l’étranger, les coûts et les délais de transport et de test peuvent être réduits d’une moyenne de 42 jours à une moyenne de 19 jours.
Actuellement, des échantillons de selles provenant de pays connaissant des épidémies actives de polio, comme la RDC, doivent être expédiés dans le monde entier pour des tests de laboratoire longs et complexes afin de confirmer un cas de poliomyélite. Une détection plus rapide de la poliomyélite dans les régions où des épidémies se produisent encore permet une réponse plus rapide des autorités grâce à des campagnes de vaccination ciblées et localisées, minimisant ainsi les possibilités de propagation du virus.
Javier Martin, chercheur principal en virologie à la MHRA, a déclaré :
Nous nous trouvons à un moment délicat et crucial pour l’éradication de la poliomyélite. Alors que les programmes de vaccination ont vu la poliomyélite disparaître dans de nombreux pays, la détection tardive des épidémies constitue une menace majeure pour ces efforts.
En mettant en œuvre des méthodes de détection telles que le DDNS, nous pouvons identifier beaucoup plus rapidement où se trouvent les épidémies et quelle souche de poliomyélite est présente, ce qui nous permet d’agir le plus tôt possible.
C’est le résultat d’années de travail, en collaboration avec nos partenaires. Ensemble, nous continuerons à nous appuyer sur cette recherche et à aider les pays à risque d’épidémies à mettre en œuvre des tests DDNS pour aider à faire de la poliomyélite une maladie du passé. »
Cette recherche a montré que les tests DDNS effectués localement en RDC sur une période de six mois étaient en moyenne 23 jours plus rapides que la méthode standard, avec une précision de plus de 99 %.
Les chercheurs ont également testé cette technique au Royaume-Uni et détecté le poliovirus à Londres en 2022, ce qui a conduit à la récente campagne visant à garantir que les enfants de moins de 12 ans soient vaccinés dans le cadre de la campagne de rattrapage contre la poliomyélite de Londres 2023.
Le professeur Placide Mbala-Kingebeni, docteur en médecine et virologue à l’Institut National de Recherche Biomédicale a déclaré :
C’est l’exemple parfait de la collaboration, où la combinaison et le partage des connaissances avec tous nos partenaires ont soutenu le travail vital de l’INRB en RDC où la poliomyélite reste un grave problème de santé publique.
La collaboration et la formation avec nos partenaires ont permis à l’équipe locale non seulement de maîtriser et d’appliquer en toute confiance cette nouvelle technique, mais aussi de transférer les connaissances et les compétences à d’autres pays africains où des épidémies de poliovirus sont régulièrement signalées.
Le soutien et les conseils de la Fondation Bill et Melinda Gates et du GPLN, qui rendent ces collaborations possibles, permettent l’application et l’expansion du DDNS à travers l’Afrique pour la détection rapide du poliovirus et la réponse aux épidémies, nous aidant à nous rapprocher de l’éradication de la poliomyélite.
Le Dr Alex Shaw, chercheur à l’École de santé publique de l’Imperial College de Londres, a déclaré :
Cette méthode permet la confirmation rapide des souches de poliomyélite, facilitant des réponses vaccinales plus rapides qui peuvent réduire le nombre de cas de poliomyélite résultant d’une épidémie. Le développement et la validation de la méthode ont été le résultat d’une collaboration fructueuse entre un consortium de nombreux partenaires.
En tant que consortium, nous attendons avec impatience la formation de laboratoires nationaux supplémentaires à cette méthode, les anciens stagiaires, y compris les membres de l’INRB, assumant désormais le rôle de formateurs.
La technologie de séquençage utilisée dans cette méthode est facilement adaptée pour la détection et le typage d’autres organismes. Ce déploiement fournira donc une base de compétences et d’expérience qui pourra être réorientée vers la surveillance génomique d’autres agents pathogènes selon les besoins. »
La poliomyélite est une maladie infectieuse causée par le poliovirus, le plus souvent transmise par contact avec des matières fécales infectées via des aliments et de l’eau contaminés.
Bien que de nombreuses personnes ne présentent jamais de symptômes, dans les cas extrêmes, en particulier chez les bébés et les enfants de moins de cinq ans, la poliomyélite peut entraîner une paralysie permanente ou la mort.
L’OMS a identifié les retards de détection comme l’un des principaux défis auxquels est confrontée sa stratégie d’éradication de la poliomyélite 2022-2026.
Bien que les méthodes de détection plus rapides telles que le DDNS ne puissent pas éradiquer la poliomyélite à elles seules, elles jouent un rôle essentiel dans la gestion des épidémies.
Les scientifiques de la MHRA continueront à soutenir les tests et la validation du DDNS en tant que technique de détection de la poliomyélite et à former les laboratoires de l’OMS du monde entier à son utilisation.
