seqWell, un fournisseur mondial de technologies de bibliothèque de séquençage de nouvelle génération (NGS) basées sur sa plateforme de multiplexage exclusive plexWell™, a annoncé aujourd’hui un partenariat avec California Conservation Genomics Project (CCGP). CCGP, une initiative financée par l’État et dirigée par l’Université de Californie visant à produire l’ensemble de données génomiques multi-espèces le plus complet jamais assemblé pour aider à gérer la biodiversité régionale, a sélectionné les technologies de préparation de bibliothèque NGS de seqWell pour faire évoluer et accélérer sa recherche en génomique, tout en réalisant des économies dans le temps, le coût et l’utilisation du plastique. Les deux partenaires décriront l’initiative et ses progrès à ce jour, actuellement en phase 2 (génération de données) dans un prochain webinaire le 11e Mai, 12h00 HAP, ‘Conserver la Californie : appliquer le séquençage du génome entier au CCGP ».
À partir de 2019, le CCGP a réuni un consortium de plus de 100 experts travaillant à l’interface de la génomique et de la science de la conservation pour produire un ensemble complet de données génomiques pour aider à gérer la biodiversité régionale. Les données seront utilisées pour développer des cartes génomiques de la Californie visualisant des caractéristiques telles que la variation génomique et les points chauds résistants au climat. En fin de compte, les informations influenceront la gestion de l’utilisation des terres et les actions de conservation, soutenant la création de plans de conservation stratégiques pour garantir que la population, les environnements et la faune sont résilients au changement climatique.
Le protocole de préparation de bibliothèque plexWell de seqWell permet le regroupement d’échantillons après la première étape enzymatique, minimisant les étapes de pipetage et réduisant le nombre de tubes manipulés, tout en créant des pools de bibliothèques équilibrés. Dans le cadre de la collaboration, des protocoles personnalisés ont été développés pour garantir que l’entrée est accessible à travers l’étendue des groupes taxonomiques et des âges des échantillons séquencés. De plus, les optimisations du protocole permettent à l’équipe d’accélérer et d’automatiser la préparation de la bibliothèque, d’augmenter le débit d’échantillons et de réduire les erreurs.
Nous sommes heureux de collaborer avec le CCGP sur leur projet d’utilisation de la technologie de séquençage du génome entier pour séquencer 22 000 plantes et animaux individuels. La sélection de notre technologie plexWell par une institution académique aussi prestigieuse démontre la valeur que la technologie que nous avons développée peut apporter en accélérant les flux de travail sur un projet aussi important.
Dan Calvo, président et chef de la direction, seqWell
Le Dr Erin Toffelmier, directrice associée, CCGP, Université de Californie, a déclaré : «Les technologies innovantes de préparation de bibliothèques NGS de seqWell sont essentielles à nos progrès et jouent déjà un rôle majeur dans l’accélération des efforts de séquençage. Le protocole personnalisé et la configuration du kit fournis par seqWell nous permettent d’accélérer considérablement le nombre d’échantillons que nous traitons, ce qui nous aide à atteindre notre objectif de créer l’ensemble de données génomiques le plus complet jamais assemblé pour la science de la conservation. Pour aider davantage cela, nous recrutons actuellement un technicien de laboratoire pour rejoindre le CCGP Mini-Core.
