La variante Omicron du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) qui a été identifiée pour la première fois en Afrique du Sud et au Botswana en novembre 2021 a été signalée comme ayant une évasion immunitaire considérable mais incomplète de l’immunité neutralisante qui s’est développée soit par la vaccination, soit par des infections antérieures . Les individus vaccinés, cependant, auraient une meilleure neutralisation.
Les infections à Omicron se sont avérées associées à une incidence plus faible d’infections graves par rapport à d’autres variantes en Afrique du Sud. La première sous-lignée Omicron à émerger était BA.1, suivie par l’émergence de BA.2 dans plusieurs pays. Cependant, il n’est toujours pas clair si l’infection par Omicron/BA.1 interagira avec la vaccination pour protéger contre la variante Delta, qui était auparavant prédominante, la variante BA.2 ou d’autres variantes.
Une nouvelle étude publiée dans la revue Nature visait à déterminer dans quelle mesure l’infection à Omicron induit une protection contre d’autres variantes du SRAS-CoV-2 chez les individus vaccinés et non vaccinés.
Étude : L’infection d’Omicron augmente l’immunité d’anticorps de delta dans les personnes vaccinées. Crédit d’image : NIAID
À propos de l’étude
L’étude a impliqué l’isolement des virus vivants Omicron/BA.1, Omicron/BA.2, ancestraux, bêta et delta ainsi que des virus neutralisés avec du plasma de 39 participants qui avaient un diagnostic confirmé de SARS-CoV-2 par qPCR. Les participants ont été échantillonnés au départ, une médiane de 6 jours après l’apparition des symptômes, et lors des visites de suivi hebdomadaires, la dernière visite étant une médiane de 23 jours après l’apparition des symptômes.
Par la suite, l’assemblage du génome, le séquençage du génome entier et l’analyse phylogénétique ont été effectués à l’aide de l’ARN viral. L’expansion du virus a eu lieu dans des cellules Vero E6 et a été suivie d’un test de neutralisation du virus vivant ainsi que du calcul de la valeur du test de neutralisation par réduction de focalisation (FRNT50).
Résultats de l’étude
Les résultats ont indiqué que 27 des 39 participants ont dû être hospitalisés en raison de symptômes du COVID-19, 7 ont eu besoin d’oxygène supplémentaire et un est décédé. Quinze participants auraient été vaccinés et auraient une percée d’infection à Omicron/BA.1. Sur les 15 participants, 8 ont reçu deux doses de Pfizer-BNT162b2 et 7 ont reçu le vaccin Johnson and Johnson Ad26.CoV2.S tandis qu’un participant a reçu un rappel avec une deuxième dose d’Ad26.CoV2.S. Le temps médian pris après la vaccination pour le déclin de l’immunité a été signalé comme étant d’environ 139 jours. De plus, la durée du séjour à l’hôpital était plus courte chez les participants vaccinés que chez les participants non vaccinés.
Les résultats ont rapporté une augmentation de 13,6 fois de la neutralisation d’Omicron/BA.1 lors de la dernière visite de suivi par rapport à la valeur initiale chez les personnes vaccinées, tandis qu’une augmentation de 6 fois a été observée chez les personnes non vaccinées. Une augmentation de 5,7 fois de la capacité de neutralisation contre le virus Delta a été observée au dernier suivi par rapport au départ chez les participants vaccinés, tandis qu’une augmentation de 3,2 fois a été observée chez les participants non vaccinés.
La neutralisation à Omicron/BA.2 s’est avérée comparable à Omicron/BA.1 chez les individus vaccinés et non vaccinés, tandis que pour les autres variantes et le virus ancestral, la neutralisation était supérieure à Omicron/BA.1 pour les participants vaccinés et inférieure à Omicron/BA.1 pour les participants non vaccinés. De plus, la neutralisation croisée a été signalée comme étant 2,2 fois plus élevée pour Omicron/BA.1, 4,8 fois pour Omicron/BA.2, 17,9 fois pour le virus ancestral, 12,0 fois pour Delta et 9,6 fois pour Beta. . De plus, une diminution de 22,5 fois de la neutralisation Omicron/BA.1 a été observée par rapport à la neutralisation du virus Delta pour tous les échantillons.
L’étude actuelle démontre que l’immunité hybride due à l’infection par Omicron ainsi que la vaccination peuvent protéger contre la réinfection avec les variantes actuelles, tandis que pour les individus non vaccinés, l’immunité neutralisante s’est avérée assez faible. Par conséquent, les personnes non vaccinées sont moins susceptibles d’avoir une protection croisée contre les variantes existantes et émergentes du SRAS-CoV-2, car l’immunité diminue avec le temps. Cela suggère que l’infection par Omicron seule n’est pas suffisante pour la protection. Par conséquent, la vaccination doit être mise en œuvre dans les zones à taux élevés d’infection à Omicron pour se protéger contre les autres variantes.
Limites
L’étude comporte certaines limites. Premièrement, l’étude implique l’hétérogénéité des antécédents immunitaires des participants. Deuxièmement, la plupart des participants ont été hospitalisés, ce qui n’est pas typique d’une infection à Omicron. Troisièmement, la dynamique temporelle de l’immunité neutralisante n’était pas claire.
