Dans une étude récente publiée dans Médecine BMCles chercheurs explorent la relation causale entre l’infection virale et le gliome, la tumeur neurologique la plus courante.
À cette fin, ils ont mené une analyse de randomisation mendélienne (MR) bidirectionnelle à l’aide des données d’une étude d’association pangénomique (GWAS).
Étude: Association entre les infections virales et le risque de gliome : une analyse de randomisation mendélienne bidirectionnelle à deux échantillons. Crédit d’image : Lightspring/Shutterstock.com
Sommaire
Arrière-plan
Les gliomes de bas grade (LGG) appartiennent aux grades I à III de l’Organisation mondiale de la santé (OMS) ; cependant, les glioblastomes (GBM) sont agressifs et tombent dans le grade IV de l’OMS.
En fait, les GBM constituent 49 % de toutes les tumeurs cérébrales malignes dont le pronostic et les taux de survie sont médiocres. Ils provoquent un immense inconfort physique et émotionnel pour les patients atteints de cancer et leurs familles ainsi que des dépenses financières, les coûts annuels moyens pour les soignants pouvant atteindre 5 581,49 €.
Des études antérieures ont recherché les causes du gliome mais n’ont pas réussi à trouver son étiologie. Récemment, les chercheurs se sont concentrés sur l’exploration des infections virales antérieures en tant que facteur de risque de gliome.
Comme le cytomégalovirus humain (HCMV), le zona, l’agent causal du virus varicelle-zona (VZV) est resté systématiquement associé au risque de glioblastome. Cependant, alors que le HCMV augmente le risque d’incidence du gliome, le virus de l’herpès protège contre le glioblastome.
Les chercheurs ont également étudié le rôle d’autres virus dans ce contexte ; par exemple, Vidone et al. L’infection signalée par le virus du papillome humain (VPH) a un mauvais pronostic pour le gliome.
En outre, il serait très intéressant de savoir si les séquelles de l’infection par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) ont conduit à un gliome.
Les biais méthodologiques sont inhérents aux études observationnelles, et il est contraire à l’éthique de mener des essais contrôlés randomisés (ECR) pour déduire un lien de causalité entre l’infection virale et le gliome.
Par conséquent, les relations entre certaines infections virales invasives, par exemple le virus de l’hépatite B (VHB) et les gliomes, restent mal comprises.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs se sont concentrés sur 12 virus différents, à savoir le VZV, le virus de l’herpès simplex (HSV), le poliovirus, le virus de l’immunodéficience humaine (VIH), le SRAS-CoV-2, le virus des oreillons (MuV), le VHB et le virus de la rougeole (MeV). , le virus de la rubéole (RuV), le HPV, le HCMV et l’EBV et leur association causale avec différents sous-types de gliomes.
Ils ont utilisé l’approche MR à deux échantillons qui utilise la variation génétique comme variable instrumentale pour évaluer l’association causale entre l’infection virale et le gliome avec une confusion minimale et une causalité inverse.
Dans la conception de l’IRM, les chercheurs ont suivi des prémisses fondamentales et des hypothèses supplémentaires pour garantir la fiabilité des résultats.
Il s’agissait du fait que les variations génétiques sont fortement liées à l’exposition virale et indépendantes de tout facteur de confusion et résultat potentiel, à l’exception de l’exposition.
Dans les analyses statistiques, ils ont sélectionné des polymorphismes mononucléotidiques (SNP) avec des valeurs p significatives (P.<5 × 10–6) comme variables instrumentales (IV) et appliqué un processus d'agrégation pour identifier les SNP indépendants à analyser.
Premièrement, ils ont évalué la causalité du SNP à l’aide du rapport de Wald, et lorsque > 1 SNP fonctionnait comme un outil IV, ils ont utilisé la méthode de pondération de la variance inverse (IVW) pour leur méta-analyse.
De plus, ils ont utilisé les méthodes MR-Egger et médiane pondérée pour compléter la méthode IVW car, contrairement à la méthode IVW qui considère que toutes les IV sont efficaces, elle produit des estimations causales cohérentes considérant 50 % des SNP comme efficaces.
L’équipe a présenté les résultats de l’IRM en utilisant des rapports de cotes (OR) et des intervalles de confiance (IC) pour l’exposition non binaire et des OR convertis pour l’exposition à une infection virale binaire. Une correction du taux de fausses découvertes (FDR) expliquait les biais résultant de comparaisons multiples.
Résultats
L’équipe a utilisé les données de 19 GWAS, dont 18 provenaient d’infections virales, un de gliome et 12 488 étaient des cas de gliome. Les SNP variaient de quatre à 48, et le F les statistiques de chaque SNP indiquaient qu’ils étaient robustes.
Les paires de SNP et les estimations des résultats MR variaient de trois à 22 dans l’analyse principale, où huit caractéristiques d’association causale avaient P.<0,05.
L’association entre l’infection génétiquement prédite par le HSV et le risque de LGG ne variait pas d’une cohorte à l’autre. Après le contrôle du FDR, une infection génétiquement prédite par le VZV et le HSV pourrait modifier le risque de LGG.
Le premier a réduit, tandis que le second a augmenté le risque de LGG, avec des OR respectifs = 0,85, 1,17 ; P. = 0,01 ; FDR = 0,04.
Les OR pour les symptômes génétiquement prédits causés par les infections à MuV, EBV, HCMV, SARS-CoV-2, HPV, HBV, RuV ou MeV ne suggèrent aucune relation causale avec le risque de LGG.
Curieusement, la rougeole génétiquement prédite avait une association causale nominale et le zona avait une association causale évocatrice avec le GBM et tous les gliomes, respectivement, avec la IVW. P.<0,05 et FDR>0,05. La direction de cette causalité était constante d’une cohorte à l’autre.
Les chercheurs n’ont trouvé aucune preuve d’hétérogénéité parmi les IV sélectionnés, de valeurs aberrantes ou de pléiotropie horizontale.
De plus, le GBM génétiquement prédit avait une causalité évocatrice avec un risque plus faible d’oreillons et de poliomyélite aiguë (OR = 0,78 ; 0,69, P. = 0,02;0,01, FDR = 0,13).
Conclusion
Cette étude a montré des preuves démontrant que le zona génétiquement prédit causé par une infection par le VZV peut réduire le risque de LGG. En fait, les associations causales pour GBM et LGG étaient étonnamment opposées.
En conséquence, le zona augmentait le risque de GBM mais diminuait celui de LGG. Ces résultats confirment et renforcent encore la perspective précédente.
Cependant, des recherches supplémentaires validant le lien de causalité entre l’infection par le VZV et le gliome sont nécessaires pour élucider le mécanisme sous-jacent. Néanmoins, le VZV pourrait s’avérer être un candidat idéal pour le traitement du virus des gliomes.
