Dans une revue récente publiée dans la revue Maladies infectieuses émergentes, les chercheurs ont étudié la littérature relative aux infections par le virus de la grippe aviaire A (H5N1) chez les mammifères au cours des deux dernières décennies. Leur examen a couvert deux périodes panzootiques principales – de 2003 à 2019 et de 2020 à 2023 – et élucide les tendances des infections par le virus H5N1 au cours de ces périodes. Leurs résultats suggèrent que même si la principale source de transmission virale reste le contact avec des oiseaux infectés, les transmissions de mammifère à mammifère sont en augmentation. Ces résultats alarmants mettent en évidence les mutations récentes des souches H5N1, soulignant la nécessité d’une surveillance continue pour atténuer une éventuelle pandémie mondiale.
Synopsis : Changements récents dans les modèles d’infection des mammifères par le virus de la grippe aviaire hautement pathogène A(H5N1) dans le monde. Crédit d’image : Jeremy Richards/Shutterstock
La grippe aviaire chez les mammifères ?
L’influenza aviaire hautement pathogène (IAHP) est une maladie virale grave causée par les sous-types (H5 et H7) du type A. Au cours du siècle dernier, ces virus ont provoqué des vagues endémiques répétées, se propageant rapidement et causant des pertes substantielles de faune aviaire dans un large éventail de régions. d’espèces, en particulier les volailles élevées par l’homme.
Depuis 2003, cependant, on a observé que l’IAHP A (H5N1) franchissait les barrières entre les royaumes et passait de ses hôtes aviaires aux mammifères, entraînant deux événements panzootiques sans précédent – de 2003 à 2019 et la période en cours de 2020 à 2023. Ces événements ont déclenché l’alarme au sein de la communauté scientifique en raison des souches mutantes H1N5 affectant la faune sauvage en voie de disparition, des pertes économiques associées à l’infection du bétail et de leur potentiel de transmission humaine.
Des rapports limités sur la période panzootique en cours suggèrent qu’elle est nettement plus grave que celle de 2003. Il devrait s’agir de l’un des pires événements panzootiques de l’histoire enregistrée, en termes de couverture économique, géographique et d’échelle de morbidité et de mortalité animale. Au cours des trois années qui ont suivi l’apparition de la panzootie, le virus s’est propagé sur quatre continents et dans un nombre record de 26 pays, infectant notamment les visons, les renards, les furets, les phoques et les chats domestiques, qui présentent tous un potentiel de transmission humaine.
Malheureusement, les recherches sur le H1N5 et la panzootie en cours restent rares et limitées à la « littérature grise » (dossiers non évalués par des pairs et rapports provenant de bases de données et de sites Web gouvernementaux). Comprendre l’évolution du virus H5N1 et les mutations permettant aux souches émergentes de surpasser de loin leur virus ancestral en termes d’infectiosité et de propagation des espèces permettrait de mieux fournir aux décideurs politiques et aux scientifiques les informations nécessaires pour atténuer la panzootie en cours avant qu’elle n’explose en une véritable pandémie.
Caractéristiques des espèces de mammifères touchées dans le monde entier par le virus grippal hautement pathogène A (H5N1), la panzootie actuelle (2020-2023). A) Habitat des espèces de mammifères affectées par le H5N1. B) Phylogénie des espèces de mammifères affectées (arbre construit à l’aide d’iTOL version 5 d’après Letunic et Bork, à partir des données de séquence d’ADN disponibles dans Upham et al.). C) Niveau trophique (charognard facultatif, carnivore, omnivore ou herbivore) des espèces de mammifères touchées dans le monde entier par le H5N1. Certains des mammifères omnivores et carnivores inclus dans la pyramide (n = 13) consomment également des charognes ; ainsi, ils sont également considérés comme des charognards facultatifs et sont incorporés dans la partie supérieure de la pyramide.
À propos de l’étude
Dans la présente revue, les chercheurs ont compilé et analysé la littérature scientifique sur les infections naturelles par le virus H5N1 chez les mammifères (y compris les humains) et ont comparé les résultats de la panzootie actuelle à ceux des vagues précédentes de virus H5N1. L’examen se concentre sur le nombre et les habitats des espèces infectées, leur phylogénie, les sources d’infection et les résultats de l’autopsie. Ils étudient en outre les mutations virales qui permettent la transmission entre espèces et élucident les risques potentiels pour la biodiversité et la santé humaine.
Les données ont été collectées à partir des bases de données en ligne Scopus et Google Scholar, avec des recherches divisées en deux périodes : 1996 à 2019 et 2020 à 2023. Les études basées sur des preuves sérologiques ont été exclues des analyses en raison de l’incertitude sur le moment de l’infection, ce qui peut biaiser les résultats du diagnostic. . En outre, l’Organisation mondiale de la santé animale, l’Agence de la santé animale et végétale du Royaume-Uni et le Service de santé animale et végétale du Département de l’agriculture des États-Unis d’Amérique ont été interrogés pour obtenir des informations à jour sur la panzootie actuelle.
Les données de l’Organisation mondiale de la santé (OMS) ont été rassemblées pour obtenir des informations sur les infections humaines. Enfin, les statuts de conservation des espèces infectées ont été dérivés de la Liste rouge des espèces menacées de l’Union internationale pour la conservation de la nature (UICN), de leurs régimes alimentaires et habitats de MammalBase et des données de séquence H5N1 d’Upham et al. (2019).
Résultats de l’étude
L’analyse documentaire de la base de données a révélé 59 publications sur les infections de mammifères par le H5N1, dont 23 traitaient des vagues précédentes de H5N1 et 36 sur la panzootie en cours. L’intérêt scientifique pour le panzootie en cours est immédiatement évident : davantage de données sur les infections chez les mammifères ont été générées au cours des trois dernières années qu’au cours des 23 précédentes.
De manière alarmante, alors que les vagues précédentes combinées faisaient état de 10 pays infectés répartis sur trois continents (Asie, Europe et Afrique), la panzootie en cours s’est déjà propagée à 26 pays en Europe, en Amérique du Sud, en Amérique du Nord et en Asie. Des tests et des rapports limités provenant d’autres pays suggèrent que ces résultats sont sous-estimés.
« Notre étude suggère que le virus H5N1 étend sa zone géographique à de nouveaux continents tels que l’Amérique du Nord et l’Amérique du Sud. Ce fait est préoccupant car lorsqu’un agent pathogène émergent atteint des populations naïves, les conséquences sur la biodiversité peuvent être catastrophiques, notamment pour les espèces menacées.
Les enquêtes sur le nombre d’espèces touchées révèlent que, alors que les panzooties précédentes ont infecté neuf espèces à prédominance terrestre et semi-aquatique, la panzootie actuelle a déjà été détectée chez plus de 48 espèces de mammifères, dont 13 espèces de mammifères marins. Le Pérou, le Chili et l’Argentine ont signalé la mort de milliers d’individus de phoques et de mammifères similaires (par exemple, l’otarie américaine). [Otaria flavescens]), entraînant presque des événements d’extinction localisés.
Les coûts pour la biodiversité sont critiques : jusqu’à présent, la grippe aviaire a touché quatre espèces quasi menacées, quatre en voie de disparition, trois espèces vulnérables et une espèce en danger critique d’extinction, par rapport aux panzooties précédentes, qui ont infecté cumulativement deux espèces en voie de disparition et deux espèces vulnérables.
Des similitudes avec les pandémies précédentes existent : les mammifères les plus touchés sont des carnivores (principalement des prédateurs apex et méso) et des charognards, ce qui correspond aux sources d’infection les plus probables – contact étroit (y compris ingestion) avec des oiseaux morts ou mourants ou des charognes infectées.
…en 2004, un total de 147 tigres et 2 léopards hébergés dans des zoos en Thaïlande ont été infectés et sont morts après avoir consommé des carcasses de poulets infectés. Dans la panzootie actuelle, le premier cas d’infection par le virus H5N1 chez des visons en Espagne a probablement été provoqué par un contact avec des oiseaux infectés (peut-être des goélands).»
Au moins cinq publications ont fait état d’une tendance alarmante en matière d’adaptation virale : des souches H5N1 présentant de nouvelles mutations susceptibles de permettre une transmission de mammifère à mammifère ont été identifiées. Si ces souches se propagent, les modèles suggèrent qu’une pandémie mondiale pourrait survenir rapidement, entraînant une perte de biodiversité et économique sans précédent.
Enfin, il a été constaté que le virus H5N1 s’est propagé et a infecté au moins 878 humains et a entraîné 458 décès (mortalité de 52 %), le contact étroit avec le bétail (en particulier la volaille) étant considéré comme la principale voie de transmission.
« Jusqu’à présent, aucune preuve n’indique une transmission interhumaine, et le risque d’une pandémie semble encore faible. Cependant, l’un des virus grippaux les plus graves à avoir touché l’homme (c’est-à-dire la grippe espagnole) [1918–1919]) développé à partir d’un virus de la grippe aviaire adapté à l’homme, un fait qui doit être pris en compte lors de l’évaluation du risque de propagation. Les gouvernements doivent assumer la responsabilité de protéger la biodiversité et la santé humaine contre les maladies causées par les activités humaines. Si nous espérons conserver la biodiversité et protéger la santé humaine, nous devons changer la façon dont nous produisons notre nourriture (l’élevage de volailles, dans ce cas précis) et la manière dont nous interagissons avec la faune et l’affectons.
