Le coronavirus mute avec une deuxième souche identifiée par les scientifiques

Le coronavirus est en mutation car les scientifiques ont identifié une deuxième souche, qui est plus agressive et contagieuse.

Alors que les responsables des soins de santé se battent pour freiner l'épidémie de coronavirus, une équipe de chercheurs chinois dit qu'une nouvelle étude montre que COVID-19 est en mutation, avec au moins deux types de virus circulant à travers les pays.

Cette image au microscope électronique à transmission montre le SARS-CoV-2 – également connu sous le nom de 2019-nCoV, le virus qui cause le COVID-19 – isolé d'un patient aux États-Unis. Des particules de virus émergent de la surface des cellules cultivées en laboratoire. Les pointes sur le bord extérieur des particules virales donnent aux coronavirus leur nom, en forme de couronne. Crédits: NIAID-RML

La souche la plus agressive a infecté environ 70% des personnes testées, tandis que la souche la moins agressive est liée au reste des cas.

Les chercheurs ont nommé la souche agressive comme «type L» et le type moins agressif comme «type S». Le type L a été plus souvent observé chez les patients de Wuhan, en Chine, où le virus est apparu pour la première fois fin décembre 2019. En revanche, le type S est actuellement en train de se propager dans d'autres pays. La souche de type L a depuis décliné régulièrement depuis janvier.

« Ces résultats soutiennent fortement le besoin urgent de poursuivre des études approfondies immédiates qui combinent des données génomiques, des données épidémiologiques et des enregistrements de graphiques des symptômes cliniques des patients atteints de coronavirus 2019 (COVID-19) », ont-ils écrit dans l'article publié dans le National Science Review, le journal de l'Académie chinoise des sciences.

Dans l'étude, les chercheurs ont identifié 149 mutations dans les 103 séquences du génome du nouveau coronavirus. Les experts de la santé pensaient que ces mutations se sont produites récemment, alors que 83 des mutations sont non synonymes, ce qui signifie qu'elles peuvent affecter et modifier la séquence d'acides aminés d'une protéine, entraînant un changement biologique dans l'organisme.

« Nos résultats suggèrent que le développement de nouvelles variations des sites fonctionnels dans le domaine de liaison aux récepteurs (RBD) du pic observé dans le SRAS-CoV-2 et les virus du pangolin SARSr-CoVs sont probablement causés par des mutations et la sélection naturelle en plus de la recombinaison, « Les chercheurs ont écrit dans l'étude.

Des études complémentaires sont nécessaires

L'équipe de l'École des sciences de la vie de l'Université de Pékin et de l'Institut Pasteur de Shanghai, partie de l'Académie chinoise des sciences, a ajouté que l'intervention humaine aurait pu exercer une pression sélective plus sévère sur le type L du virus, qui peut devenir plus agressif et se propager rapidement . Pendant ce temps, l'autre type pourrait avoir augmenté en fréquence relative en raison d'une pression sélective plus faible.

En résumé, nos analyses de 103 génomes séquencés du SRAS-CoV-2 suggèrent que le type L est plus agressif que le type S et que l'interférence humaine a pu déplacer l'abondance relative des types L et S peu après l'épidémie de SRAS-CoV-2. .

Les scientifiques ont averti que la base de données de l'étude est minime.

Comme indiqué précédemment, les données examinées dans cette étude sont encore très limitées et des analyses de suivi d'un ensemble de données plus important sont nécessaires pour mieux comprendre l'évolution et l'épidémiologie du SRAS-CoV-2.

Il y a un besoin urgent d'études immédiates et complètes qui combineront des données génomiques, des dossiers et des informations épidémiologiques sur les symptômes cliniques des patients infectés par le coronavirus.

A. Analyse haplotype des virus du SRAS-CoV-2. A. Les réseaux d'haplotypes de virus SARS-CoV-2. Le bleu représente le type L et le rouge le type S. La flèche orange indique que le type L a évolué à partir du type S. B. Evolution des types L et S des virus SARS-CoV-2. Les alignements de séquence du génome avec les sept virus les plus étroitement apparentés ont indiqué que le type S était très probablement la version ancienne de SARS-CoV-2.

Coronavirus en chiffres

Les cas de coronavirus ont augmenté au cours des dernières semaines, avec la Corée du Sud, l'Italie et l'Iran sous les projecteurs sur la propagation rapide du virus. Le virus s'est propagé dans plus de 60 pays, infectant près de 98 000 personnes et tuant 3 348 personnes, dont la plupart sont originaires de la ville de Wuhan dans la province du Hubei, en Chine.

L'Organisation mondiale de la santé (OMS) signale une baisse de l'offre d'équipements de protection individuelle (EPI) pour les travailleurs de la santé. Il exhorte les fournisseurs et les fabricants à augmenter leurs approvisionnements pour aider les médecins et les infirmières qui travaillent en première ligne de la crise sanitaire.

L'Italie et l'Iran ont signalé une soudaine augmentation des décès liés au COVID-19. L'Italie compte 3 858 cas et 148 décès, tandis que l'Iran compte 3 513 cas et 107 décès. La Corée du Sud compte le plus grand nombre de cas en dehors de la Chine continentale avec plus de 6 088 cas confirmés et 35 décès.

D'autres pays européens ont signalé leurs premiers cas de coronavirus, suggérant une large propagation du virus. L'OMS n'a pas encore déclaré l'épidémie de coronavirus une pandémie, bien qu'elle ait déclaré que l'augmentation de la transmission et des infections est alarmante.