Le microbiome pourrait aider à identifier le risque précancéreux chez les femmes atteintes du VPH

Une nouvelle étude publiée dans la revue en libre accès Pathogènes PLOS en mars 2020 signale l'utilisation possible de la bactérie Gardnerella trouvé dans le col de l'utérus et le vagin des femmes infectées par le virus du papillome humain (VPH), comme marqueur de changement précancéreux. Les résultats pourraient aider à trouver de nouvelles méthodes de traitement qui consistent à induire des changements dans le microbiome pour arrêter le cours de la maladie.

Diagnostic microscopique de la vaginose bactérienne. Les sécrétions vaginales contiennent des cellules épithéliales, appelées cellules d'indice recouvertes de bactéries Gardnerella vaginalis, illustration 3D. Crédit d'image: Kateryna Kon

Infection au papillomavirus humain

L'infection par le VPH fait partie des infections sexuellement transmissibles les plus courantes et provoque le cancer du col de l'utérus dans une petite proportion des cas. Cependant, on ne sait pas pourquoi seul un petit pourcentage des cas évoluent vers le cancer. La présente étude était motivée par la nécessité de comprendre comment le microbiome cervico-vaginal affecte la progression de l'infection par le VPH vers un état précancéreux.

Le microbiome cervico-vaginal

Certains des facteurs associés à la variation des résultats des infections à HPV à haut risque comprennent le tabagisme, l'utilisation de contraceptifs oraux et la parité. Cependant, la réponse immunitaire est également essentielle, ainsi que les gènes immunitaires liés à la réponse immunitaire, tels que le système d'antigène leucocytaire humain (HLA).

De plus, l'environnement chimique et microbien du col de l'utérus et du vagin peut également affecter la progression de l'infection par le VPH. En général, le col de l'utérus et le vagin sont caractérisés par une abondance de lactobacilles de certaines espèces (Lactobacillus crispatus, Iners de Lactobacillus, Lactobacillus gasseri ou Lactobacillus jensenii), ou de multiples microbes. Le premier est associé à de bons résultats de santé, à un risque plus faible d'infections sexuellement transmissibles et à des naissances prématurées.

De nombreuses études ont montré qu'une flore microbienne plus diversifiée est associée à une augmentation des anomalies du col de l'utérus ainsi qu'à une prévalence plus élevée d'infections à HPV à haut risque.

Modèle d'interactions HPV et microbiome. Crédit d'image: PLOS Pathogens

L'étude

L'étude actuelle a une conception longitudinale, avec des échantillons de microbiome cervico-vaginal d'une cohorte prospective suivis pour détecter tout lien entre le microbiome et la progression de la lésion du VPH vers des conditions précancéreuses du col de l'utérus.

Les chercheurs ont examiné 273 femmes âgées de 18 à 25 ans atteintes d'une infection à HPV à haut risque qui participaient à l'essai de vaccin contre le HPV au Costa Rica. Les échantillons cervicaux ont été testés pour obtenir une image du microbiome et comment il affecte la progression vers le précancer, la persistance virale et la clairance virale.

Les résultats

les chercheurs ont trouvé quatre types différents de communautés bactériennes, chacune dominée par l'espèce bactérienne Iners de Lactobacillus dans 27%, L. crispatus dans 15% des échantillons, et Gardnerella vaginalis dans 17%. Dans environ 41% des cas, le microbiome était extrêmement diversifié.

L'étude a montré que les infections à HPV à haut risque étaient éliminées plus rapidement et plus complètement lorsqu'il y avait une abondance de Iners de Lactobacillus. En revanche, la progression du VPH à haut risque est marquée par la prédominance de Gardnerella vaginalis les bactéries. Apparemment, Gardnerella provoque une infection persistante par le VPH de procéder au précancéreux en induisant une diversité accrue du spectre bactérien cervico-vaginal. Cela pourrait être en induisant une immunosuppression locale, ou alternativement un microenvironnement avec un profil bactérien distinct. Ceci est soutenu par des études plus anciennes montrant des différences dans le microenvironnement immunitaire entre les lésions précancéreuses qui progressent et celles qui disparaissent complètement.

D'autres espèces associées à la progression sont celles qui sont isolées d'échantillons prélevés sur des femmes atteintes de vaginose bactérienne, comme Prevotella amnii et Anaerococcus prevotii. Environ 3,8% des espèces fongiques étaient également associées à une progression vers le précancer.

Implications

Ces résultats suggèrent que la présence de Gardnerella, ainsi que la diversité des espèces bactériennes cervico-vaginales qui en résulte, peuvent être utilisées comme biomarqueurs pour détecter celles parmi les femmes infectées par des souches de VPH à haut risque qui peuvent évoluer vers des états précancéreux. Selon l'étude, «les enquêteurs démontrent de façon prospective que la progression d'une infection persistante à haut risque par le VPH vers un précancéreux cervical s'explique en partie par les caractéristiques uniques du microbiote cervico-vaginal.»

L'article poursuit en expliquant: «Nous avons identifié des biomarqueurs microbiens distincts qui protègent ou favorisent la progression d'une infection par HR-HPV vers des lésions CIN2 +. Ces facteurs (pourraient) agir pour supprimer (en cas de progression) ou activer (en cas de clairance) une réponse immunitaire localisée, qui à son tour influence l'histoire naturelle de l'infection par le HR-HPV. »

De plus, si de futures études montrent que le microbiome du col de l'utérus et du vagin joue un rôle causal dans la progression de l'infection persistante par le VPH vers le précancéreux, cela peut conduire à l'induction thérapeutique d'altérations du microbiome cervico-vaginal de manière à produire une immunité locale et à maintenir la maladie de progresser.