Des chercheurs aux États-Unis ont mené une étude suggérant que les personnes qui se sont rétablies ou ont été vaccinées contre le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) devraient maintenir des réponses efficaces des lymphocytes T CD8 + contre les principales variantes qui ont récemment émergé.
Le nouveau virus SRAS-CoV-2 est l’agent responsable de la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) qui continue de balayer le monde et a maintenant fait plus de 2,42 millions de morts.
Pour l’étude, l’équipe a évalué 45 mutations trouvées dans les variantes B.1.1.7, B.1.351 et B.1.1.248 qui ont émergé respectivement au Royaume-Uni, en Afrique du Sud et au Brésil.
Une seule mutation du variant B.1.351 chevauchait l’un des 52 épitopes uniques précédemment identifiés comme induisant une large réponse des lymphocytes T CD8 + chez les patients qui s’étaient rétablis d’une infection par la souche originale de SRAS-CoV-2.
Andrew Redd des National Institutes of Health de Bethesda et ses collègues affirment que les résultats suggèrent que pratiquement toutes les réponses des lymphocytes T anti-SRAS-CoV-2 CD8 + devraient reconnaître ces variantes nouvellement décrites.
Les données mettent également en évidence le rôle potentiellement significatif d’une réponse des lymphocytes T multi-épitopes dans la limitation de la fuite virale et la médiation de la protection contre les variants émergents du SRAS-CoV-2.
L’équipe affirme qu’il est essentiel que la vaccination génère de fortes réponses de cellules T multivalentes en plus des réponses humorales (anticorps) pour assurer une efficacité optimale contre le SRAS-CoV-2.
Une version pré-imprimée du document de recherche est disponible sur le bioRxiv* serveur, tandis que l’article est soumis à un examen par les pairs.
Sommaire
En savoir plus sur les variantes récemment apparues
À la fin de 2020, trois variantes distinctes du SRAS-CoV-2 ont émergé au Royaume-Uni (B.1.1.7), en Afrique du Sud (B.1.351) et au Brésil (B.1.1.248) qui portent toutes la mutation N501Y dans le récepteur -domaine de liaison (RBD) de la protéine de pointe virale.
La protéine de pointe est la structure principale utilisée par le SARS-CoV-2 pour se lier aux cellules et les infecter. La RBD du pic est la principale cible des anticorps neutralisants (NAb) suite à une infection naturelle ou à une vaccination.
Les trois variantes contiennent également toutes des mutations uniques supplémentaires dans tout le génome qui ne sont pas liées phylogénétiquement, ce qui suggère qu’elles ont évolué indépendamment, explique l’équipe.
SARS-CoV-2 Variante de Wuhan Séquence d’acides aminés de la protéine Spike avec des épitopes de lymphocytes T CD8 + surlignés en vert, et tous les sites de mutation et de suppression (barre oblique) indiqués en orange gras.
Etudes de l’activité neutralisante contre les variantes
Des études préliminaires analysant les réponses des anticorps neutralisants contre ces variants ont donné des résultats incohérents.
Alors que le variant B.1.1.7 s’est avéré ne présenter que des réductions mineures de la sensibilité au plasma de convalescence et post-vaccination, le variant B.1.351 était significativement moins sensible aux deux.
Bien que les corrélats de protection chez les convalescents et les personnes vaccinées soient inconnus, on suppose qu’une large réponse immunitaire humorale et à médiation cellulaire est nécessaire pour se protéger complètement contre le COVID-19.
« Les NAb servent presque certainement de première ligne de défense contre l’infection, mais la réponse des lymphocytes T CD8 + est également importante pour la prévention d’une nouvelle progression de la maladie », ont déclaré les chercheurs. «Comprendre l’étendue de l’immunité des individus précédemment infectés contre toute nouvelle variante est d’une importance cruciale pour estimer correctement l’effet que ces variantes peuvent avoir dans la pandémie mondiale.»
L’étude précédente de l’équipe
Auparavant, Redd et ses collègues ont mené une analyse complète des réponses des lymphocytes T CD8 + à la souche originale de SRAS-CoV-2 parmi 30 personnes en convalescence qui avaient connu différents niveaux de maladie.
Cette étude a identifié une large réponse des lymphocytes T CD8 + parmi les participants, dont la quasi-totalité présentait des réponses détectables à 52 des 408 épitopes candidats pour la reconnaissance des lymphocytes T CD8 +.
Ces réponses épitopiques uniques étaient dirigées contre plusieurs protéines virales structurales et non structurales.
Qu’en est-il de l’étude actuelle?
Red et ses collègues ont identifié des polymorphismes d’acides aminés dans les variantes B.1.1.7, B.1.351 et B.1.1.248 et les ont mappés sur le génome du SRAS-CoV-2. Ils ont ensuite examiné les variantes pour le chevauchement avec les épitopes CD8 + identifiés dans l’étude précédente.
Dans l’ensemble, 132 réponses de cellules T CD8 + spécifiques du SRAS-CoV-2 se sont produites, correspondant à 52 réactivités épitopiques uniques ciblant plusieurs épitopes structurels et non structuraux à travers le protéome viral.
Parmi les 45 mutations, insertions et délétions cartographiées, une seule mutation trouvée dans la protéine de pointe de B.1.351 s’est avérée chevaucher l’un des 52 épitopes uniques identifiés dans l’étude précédente.
Que concluent les auteurs?
Les chercheurs disent que les résultats suggèrent que pratiquement toutes les réponses des lymphocytes T anti-SRAS-CoV-2 CD8 + devraient reconnaître les trois variantes nouvellement décrites.
«Il est important que les vaccins utilisés pour des campagnes à grande échelle génèrent de fortes réponses de lymphocytes T multivalents en plus de NAb et d’autres réponses humorales afin d’optimiser l’efficacité contre le SARS-CoV-2 actuel et les souches émergentes», écrivent Redd et ses collègues.
«Il sera également important de continuer à surveiller l’étendue, l’ampleur et la durabilité des réponses des lymphocytes T anti-SRAS-CoV-2 chez les individus récupérés et vaccinés dans le cadre de toute évaluation visant à déterminer si des vaccinations de rappel sont nécessaires», concluent-ils. .
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique / les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
