Dans une récente étude cas-témoins publiée dans Rapports scientifiques, les chercheurs ont comparé les polymorphismes mononucléotidiques (SNP) du gène du récepteur de la vitamine D (VDR) entre les patients atteints de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) légère et grave.
Ils ont constaté que le génotype TT du SNP rs11568820 était significativement moins fréquent chez les patients hospitalisés pour le COVID-19, ce qui suggère son rôle protecteur contre les maladies graves et l'hospitalisation.
Étude: Comparaison des polymorphismes du gène du récepteur de la vitamine D dans rs11568820, rs7970314, rs4334089 entre des patients COVID-19 présentant des symptômes légers et sévères : une étude cas-témoins. Crédit d’image : Milliards de photos/Shutterstock.com
Sommaire
Arrière-plan
Le spectre clinique du COVID-19 s’étend de symptômes bénins à une pneumonie grave ou au décès. Bien que les taux sériques de vitamine D n’affectent pas la susceptibilité au COVID-19, la carence est plus fréquente parmi les cas graves. La vitamine D, produite dans les poumons, module les réponses immunitaires et peut avoir un impact sur la gravité du COVID-19.
Les polymorphismes du gène VDR affectant la fonction VDR sont associés à des réponses immunitaires. Chez les patients atteints de COVID-19, divers polymorphismes VDR sont en corrélation avec différents symptômes, tels que l’essoufflement, la maladie rénale et l’hypertension. Les variations génétiques de la voie de la vitamine D influencent la susceptibilité aux infections respiratoires.
Comprendre ces facteurs génétiques pourrait faciliter les stratégies de traitement, identifier les personnes à risque et éclairer les recherches futures pour gérer le COVID-19.
Par conséquent, les chercheurs de la présente étude ont cherché à évaluer et à comparer les polymorphismes VDR chez les patients présentant des cas légers et graves de COVID-19.
À propos de l'étude
La présente étude a recruté des participants de l’étude de 5 ans de la cohorte COVID d’Ispahan (ICC). Au total, 176 patients COVID-19 ont été inclus, dont 85 patients hospitalisés (âge moyen 59,04 ans, 37 % d’hommes) et 91 patients non hospitalisés (âge moyen 47,77 ans, 44 % d’hommes).
Les patients éligibles âgés de 19 ans et plus avec des résultats positifs de RT-PCR (abréviation de réaction en chaîne par polymérase à transcription inverse) ont été sélectionnés à l'aide d'un échantillonnage de commodité à partir des ensembles de données des centres de santé provinciaux.
Alors que les critères d'hospitalisation étaient basés sur les définitions des cas modérés ou graves de l'Organisation mondiale de la santé (OMS), les patients non hospitalisés n'étaient pas symptomatiques.
Un consentement éclairé écrit a été obtenu de tous les participants et les Instituts nationaux pour le développement de la recherche médicale (NIMAD) ont approuvé le protocole de l'étude à Téhéran, en Iran.
La collecte des données a été réalisée par des enquêteurs des centres de santé formés à l'administration des questionnaires et aux procédures de mesure. Des données démographiques, socio-économiques et de style de vie ont été collectées.
Les antécédents médicaux des patients, y compris les maladies non transmissibles telles que les maladies cardiovasculaires, l'hypertension, le diabète sucré, les maladies respiratoires chroniques, les maladies rénales chroniques et les antécédents médicamenteux, ont été obtenus.
Des échantillons de sang ont été prélevés pour l'isolement de l'acide désoxyribonucléique (ADN). La qualité de l'ADN a ensuite été évaluée à l'aide de Nanodrop et de gel d'agarose, suivi d'un génotypage des polymorphismes du gène VDR à l'aide de la PCR du système de mutation réfractaire par amplification (ARMS) et du séquençage de Sanger.
Analyse statistique impliquant le test du chi carré, le test exact de Fisher, le test de Student t-test, test de Mann-Whitney, correction de Bonferroni, rapports de cotes (OR) et régression logistique.
Résultats et discussion
Dans le groupe hospitalisé, l’âge moyen et le tour de taille étaient plus élevés, tandis que les niveaux d’activité physique étaient inférieurs à ceux du groupe non hospitalisé. De plus, le groupe hospitalisé présentait une fréquence plus faible de fumeurs actuels mais des taux plus élevés d’hypertension et de diabète sucré par rapport au groupe non hospitalisé.
Parmi les SNP étudiés, le génotype TT de rs11568820 s'est avéré significativement rare dans le groupe hospitalisé (3,5 %) par rapport au groupe non hospitalisé (17,6 % ; P = 0,018).
Une signification statistique a également été observée dans le modèle récessif (P = 0,003). Cependant, aucune différence significative n'a été trouvée dans les génotypes ou les fréquences alléliques des SNP rs7970314 et rs4334089 entre les deux groupes.
De plus, le génotype rs11568820 SNP a présenté une association inverse significative avec l’hospitalisation pour COVID-19, même après ajustement pour tenir compte des comorbidités telles que les maladies coronariennes, le tabagisme actuel et l’indice de masse corporelle. Plus précisément, ce génotype était associé à une réduction de 82 % du risque d’hospitalisation (OR 0,18).
À l’inverse, aucune relation significative n’a été observée entre les génotypes des SNP rs7970314 et rs4334089 et l’hospitalisation pour COVID-19. Notamment, le modèle récessif pour rs11568820 a montré une association significative avec l'hospitalisation (OR 0,14), alors que d'autres SNP n'ont pas démontré d'association significative.
L’un des points forts de l’étude réside dans son exploration de la distribution du VDR SNP à travers différentes sévérités de COVID-19, une perspective moins explorée dans les recherches précédentes se concentrant principalement sur les taux sériques de vitamine D et la sensibilité.
Cependant, l’étude est limitée par sa nature descriptive, empêchant l’établissement de relations causales entre les polymorphismes du VDR et la gravité du COVID-19.
De plus, le manque de mesures du taux sérique de vitamine D et de données sur les facteurs immunologiques limite l’interprétation globale des résultats. Cela nécessite des investigations plus vastes et plus détaillées sur divers sous-groupes de patients.
Conclusion
En conclusion, la présente étude a identifié le génotype TT de rs11568820 comme facteur de protection contre le COVID-19 sévère. Néanmoins, la confirmation de ces résultats nécessite des études à plus grande échelle tenant compte de divers facteurs de confusion.
À l’avenir, la compréhension des prédispositions génétiques pourra améliorer les approches thérapeutiques personnalisées contre le COVID-19.
