Dans un récent Rapport hebdomadaire sur la morbidité et la mortalité (MMWR) publiés sur le site Web du Centre américain de contrôle et de prévention des maladies (US-CDC), les chercheurs ont analysé les données de l’augmentation de l’accès communautaire aux tests (ICATT), un programme national de pharmacie géré aux États-Unis pour le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS- CoV-2).
Ils ont fait des estimations préliminaires de l’efficacité (VE) du vaccin bivalent (mis à jour) de l’acide ribonucléique messager (ARNm) contre la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) contre l’infection symptomatique par les sous-variants liés à Omicron BA.5 et XBB. La durée de l’étude était le 1er décembre 2022 et le 13 janvier 2023.
Étude : Premières estimations de l’efficacité du vaccin bivalent à dose de rappel d’ARNm dans la prévention de l’infection symptomatique par le SRAS-CoV-2 attribuable aux sous-lignées liées à Omicron BA.5 et XBB/XBB.1.5 chez les adultes immunocompétents – Accroître l’accès communautaire au programme de dépistage, États-Unis, Décembre 2022-janvier 2023. Crédit d’image : cryptographe / Shutterstock
Sommaire
Arrière-plan
Les mutants XBB et XBB.1.5 dérivés du SARS-CoV-2 Omicron BA.2 se propagent rapidement aux États-Unis. Des études ont montré que les rappels d’ARNm bivalents offrent une protection supplémentaire contre l’infection XBB/XBB.1.5 symptomatique pendant au moins les trois premiers mois chez les receveurs de deux à quatre vaccins monovalents. Cependant, les études n’ont pas fait les estimations VE des vaccins COVID-19 bivalents basés sur la technologie de l’ARNm. Notamment, les boosters bivalents contiennent de l’ARNm codant pour le gène de pointe (S) de deux souches de SRAS-CoV-2, la souche ancestrale et les sous-lignées Omicron BA.4/BA.5.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont recruté des personnes recevant le test SARS-CoV-2 sur les sites ICATT entre le 1er décembre 2022 et le 13 janvier 2023, suspectant un ou plusieurs COVID-19 et des maladies similaires. Ils ont fourni des informations détaillées sur les antécédents de vaccination, les symptômes actuels, les résultats des tests SARS-CoV-2 précédents et les problèmes de santé préexistants, le cas échéant.
Les chercheurs ont utilisé l’échec de l’amplification du gène S (SGTF) dans la transcription inverse en temps réel – réaction en chaîne par polymérase (RT-PCR) comme indicateur indirect de l’infection par les sous-lignées liées à BA.5 (par exemple, BQ.1.1, BQ.1 , BF.7) et la présence cible du gène S (SGTP) comme indicateur de l’infection par XBB, y compris les infections par BN.1 et d’autres sous-lignées BA.2.
Ils ont rapporté des résultats quantitatifs sous forme de valeurs de seuil de cycle (CT) pour trois gènes du SRAS-CoV-2, S, la nucléocapside (N) et le cadre de lecture ouvert (ORF1ab). Un CT pour le gène S supérieur à quatre cycles au-dessus de la moyenne de N et ORF1ab indiquait SGTF, et les échantillons positifs pour le SRAS-CoV-2 sans SGTF étaient donc considérés comme SGTP.
L’équipe a également calculé l’EV relative d’un rappel bivalent et les rapports de cotes (OR) à l’aide de modèles de régression logistique multivariés. Pour les calculs de VE basés sur le statut SGTF/SGTP, ils ont utilisé la formule (1 – OR) x 100.
Résultats de l’étude
À la fin de la première semaine de décembre 2022, environ 13 % des échantillons séquencés sur les sites ICATT appartenaient aux sous-lignées Omicron BA.2, les mutants XBB.1.5 et XBB contribuant respectivement à 2,4 % et 5 % des cas.
À la fin de la durée de l’étude, le nombre de cas est passé à environ 41 %, avec 37,2 % et 4 % de cas dus à XBB.1.5 et XBB, respectivement. Au 16 janvier 2023, la prévalence de XBB.1.5 a augmenté de manière continue à l’échelle nationale, telle qu’évaluée par le séquençage génomique complet (WGS), bien que les résultats du WGS pour tous les échantillons collectés au cours de la période d’étude n’étaient pas disponibles.
Parmi les résultats de 29 175 tests d’amplification d’acide nucléique (TAAN), 10 596 (78 %) et 3 052 (22 %) étaient respectivement SGTF et SGTP. Entre le 1er décembre 2022 et le 2 janvier 2023, XBB.1.5 constituait 33% des échantillons présentant SGTP, XBB.1.5 représentant 38% d’entre eux, et ce chiffre est passé à 43% entre le 18 décembre 2022 et le 2 janvier. 2023.
L’EV relative d’une dose de rappel bivalente chez les personnes âgées de 18 à 49 ans était de 52 % et de 48 % contre les infections symptomatiques BA.5 et XBB/XBB.1.5, respectivement. De même, il était de 43% et 37% chez les personnes âgées de 50 à 64 ans et ≥65 ans contre une infection symptomatique liée à BA.5, respectivement. Cependant, l’EV est restée similaire contre les infections liées à BA.5 et les infections liées à XBB/XBB.1.5 dans tous les groupes d’âge. Tous ces individus avaient reçu les injections de rappel deux à trois mois plus tôt, tandis que les témoins n’avaient pas reçu de rappel bivalent.
Curieusement, parmi les témoins, plus de patients testés négatifs pour le SRAS-CoV-2 ont déclaré avoir reçu un rappel bivalent que ceux avec des résultats positifs. En outre, 45 % des receveurs de vaccins monovalents uniquement ont signalé un résultat positif au SRAS-CoV-2 par rapport aux receveurs de doses bivalentes (45 % contre 34 %). Le temps moyen écoulé depuis la dernière dose chez les receveurs du vaccin monovalent était de 13 mois pour les patients cas et les témoins.
conclusion
Les mutants XBB, en particulier XBB.1.5, semblaient gagner en prédominance car ils représentaient plus de 50 % des séquences d’échantillons dans les études écologiques évaluant VE. En conséquence, l’étude a souligné la nécessité d’une surveillance continue du VE au milieu de l’émergence de nouvelles variantes du SRAS-CoV-2, telles que XBB.1.5, présentant des mutations supplémentaires dans le domaine de liaison au récepteur de son S par rapport à XBB. On ignore actuellement comment cette seule mutation pourrait affecter VE.
Néanmoins, étant donné que les vaccins bivalents confèrent une protection supplémentaire contre les infections symptomatiques liées à BA.5 et XBB chez les personnes précédemment vaccinées, toutes les personnes devraient recevoir une dose de rappel bivalent dès qu’elles deviennent éligibles.
