Dans un nouvel article, des scientifiques de l’Institut La Jolla pour l’immunologie (LJI) rassemblent les résultats de recherche de chercheurs COVID-19 du monde entier. Les résultats sont frappants: les cellules T humaines peuvent cibler plus de 1 400 sites sur le virus SARS-CoV-2.
«Notre laboratoire et de nombreux autres ont montré cette réponse très large et diversifiée des cellules T», déclare Daniela Weiskopf, professeur adjoint de recherche au LJI, Ph.D., co-auteur du Hôte de cellule et microbe revoir.
Ce type de revue de recherche, appelé «méta-analyse», regroupe les résultats de plusieurs études et les chercheurs examinent attentivement la manière dont les études ont été menées.
Dans le cas du COVID-19, une méta-analyse globale des études de réponse des lymphocytes T est particulièrement utile car différentes populations de patients peuvent avoir des réponses immunitaires très différentes, en fonction de leurs différences génétiques et de leurs antécédents de maladie.
«Cela montre vraiment à quel point l’étude du SRAS-CoV-2 a été une entreprise mondiale», déclare le professeur LJI Alessandro Sette, Dr Biol.Sci, auteur principal de la revue et membre du LJI Center for Infectious Disease and Vaccine Research. « Combiner les informations de tous les différents laboratoires est une chose puissante. »
Points clés:
- Les chercheurs ont évalué les 25 études sur la réponse des cellules T humaines connues menées entre le début de la pandémie de COVID-19 et le 15 mars 2021.
- Les études montrent des réponses des lymphocytes T humains contre 1 434 épitopes CD4 et CD8. Les épitopes sont des sites sur le SRAS-CoV-2 que les cellules T peuvent reconnaître.
- Le regroupement de ces études pour cette analyse plus large a révélé plusieurs sites «immunodominants» sur le virus. Ces sites sont les endroits où les lymphocytes T sont les plus enclins à se loger.
- Cette large réponse des lymphocytes T rend difficile pour les variants du SRAS-CoV-2 d’acquérir suffisamment de mutations pour «échapper» à la réponse du corps contre le virus.
Sette ajoute que cette analyse peut aider les chercheurs à surveiller si les cellules T développent des réponses efficaces lorsqu’elles rencontrent des variants viraux et des vaccins.
Savoir quels sont les sites clés de la protéine de pointe du SRAS-CoV-2 sont particulièrement importants pour surveiller les réponses immunitaires aux vaccins COVID-19. «
Alessandro Sette, Professeur, Institut La Jolla d’immunologie
Malgré ces résultats encourageants, l’examen est limité. Les chercheurs soulignent que les études actuelles tendent à inclure principalement des participants caucasiens. En élargissant cette recherche pour inclure de nombreux groupes ethniques, les chercheurs peuvent mieux comprendre les disparités dans la mortalité par COVID-19.
Plus précisément, les chercheurs veulent comprendre comment les variations du système d’antigène leucocytaire humain (HLA) affectent les réponses des lymphocytes T. Les molécules HLA du système immunitaire contrôlent quels épitopes une cellule T peut « voir ». La fréquence des différents types de molécules HLA varie selon les groupes ethniques, de sorte que la recherche doit examiner comment ces différences affectent les réponses des cellules T et potentiellement la gravité des cas de COVID-19.
«Il s’agit d’une pandémie mondiale, il est donc important que nous élargissions nos études», déclare Alba Grifoni, professeur au LJI, qui a été le premier auteur de la revue.
La nouvelle revue met également en évidence la valeur de la base de données sur les épitopes immunitaires (IEDB), une ressource gratuite gérée par LJI et financée par l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses (NIAID). En ajoutant les données d’épitopes connues à l’IEDB, les chercheurs ont pu voir les différents résultats de l’étude côte à côte.
«Nous savons qu’il existe une forte réponse des lymphocytes T au SRAS-CoV-2», déclare Grifoni. « Maintenant, nous essayons d’identifier où nous avons des lacunes dans les connaissances. »
La source:
Institut La Jolla d’immunologie
Référence du journal:
Grifoni, A., et al. (2021) Épitopes de cellules T humaines du SRAS-CoV-2: réponse immunitaire adaptative contre COVID-19. Hôte de cellule et microbe. doi.org/10.1016/j.chom.2021.05.010.