Une équipe de scientifiques basés aux États-Unis a récemment révélé les changements dans les profils d’expression génique associés aux conséquences à long terme de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). Comme observé dans l’étude, la signature génétique du COVID-19 post-aigu (COV long) peut être détectée dans les cellules immunitaires innées et adaptatives déjà pendant la phase aiguë de l’infection par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2).
Étude : Les profils d’expression génique aiguë du COVID-19 montrent de multiples étiologies de séquelles à long terme. Crédit d’image : Jom_Ariya/Shutterstock
Une version préimprimée de l’étude est disponible sur le site medRxiv* serveur pendant que l’article est soumis à une évaluation par les pairs.
Sommaire
Fond
La présentation clinique de longue durée du COVID-19, également appelée COVID-19, est caractérisée par un large éventail de symptômes qui apparaissent chez 30% des patients COVID-19 après la guérison. Les symptômes les plus courants de la longue COVID comprennent la fatigue généralisée, les maux de tête, les douleurs articulaires/musculaires, les difficultés respiratoires, les troubles du sommeil et la perte d’odorat ou de goût. Bien que de longs symptômes de COVID aient été observés chez 40% des patients hospitalisés, certaines preuves récentes ont montré que les personnes atteintes d’infections asymptomatiques ou légèrement symptomatiques au SRAS-CoV-2 sont plus susceptibles de développer des conséquences à long terme.
Les réponses immunitaires de l’hôte à l’infection aiguë par le SRAS-CoV-2 sont associées à des conséquences à long terme du COVID-19. Dans la présente étude, les scientifiques ont analysé les expressions des gènes du sang total et les niveaux d’anticorps dans un grand groupe de patients COVID-19 hospitalisés qui avaient par la suite développé de longs symptômes COVID.
Caractéristiques de la COVID longue dans la population étudiée
L’étude a été menée sur 495 patients COVID-19 hospitalisés et 72 témoins sains et hospitalisés. Après six mois de sortie, 251 patients ont été suivis pour examiner l’apparition de longs symptômes de COVID.
L’analyse des rapports fournis par les patients a révélé deux groupes distincts de conséquences post-COVID liées aux symptômes pulmonaires et neuropsychiatriques. Cependant, aucune corrélation significative n’a été observée entre la gravité de la maladie et l’apparition d’un COVID long.
Profils d’expression génique
Des échantillons de sang ont été prélevés chez 180 des 251 patients suivis pour effectuer le séquençage de l’ARN. L’analyse a identifié des associations significatives entre un niveau de plasmocytes plus élevé et un niveau de cellules T auxiliaires folliculaires plus faible avec une longue pneumonie COVID et des douleurs musculaires.
L’analyse des gènes différentiellement exprimés dans le sang total n’a révélé aucune association significative avec des symptômes. Cependant, de nombreuses signatures d’expression différentielle liées aux symptômes ont été observées dans des types cellulaires spécifiques. Plus précisément, les plasmocytes présentaient le plus grand nombre de signatures géniques liées à divers symptômes, notamment les troubles du sommeil, les complications pulmonaires, les nausées/vomissements/diarrhée, les éruptions cutanées, la perte d’odorat ou de goût et la pneumonie.
Il est important de noter qu’une régulation négative complète des gènes associés à la pneumonie a été observée chez les patients. Parmi les autres types de cellules testées, des associations significatives de lymphocytes T gamma-delta et CD8+, de lymphocytes T CD4+ au repos et de neutrophiles et de lymphocytes T activés par la mémoire CD4+ avec une moins bonne qualité de vie, des problèmes dentaires et des problèmes de mémoire ont été observées, respectivement.
Modèles partagés de signatures génétiques différentiellement exprimées
Deux tests d’expression différentielle ont été effectués pour identifier le groupe de gènes qui étaient exprimés de manière différentielle dans les deux tests et étaient associés aux mêmes symptômes (gènes exprimés de manière différentielle dans la même direction). De même, un groupe différent de gènes a été identifié qui présentait des expressions différentielles dans les deux tests mais avec des symptômes opposés (gènes différentiellement exprimés dans le sens opposé).
Dans les plasmocytes, la comparaison des symptômes par paire pour le nombre de gènes différentiellement exprimés dans la même direction a identifié deux groupes de symptômes distincts. Ces groupes ont été nommés « groupe pulmonaire » (problèmes pulmonaires et pneumonie) et « groupe divers » (troubles du sommeil, nausées/vomissements/diarrhée, éruption cutanée et perte de l’odorat ou du goût).
Dans le cluster pulmonaire, une expression régulée à la baisse des gènes associés à la production et à la fonction d’anticorps a été observée. En revanche, des expressions régulées à la hausse des mêmes gènes ont été observées dans le groupe divers.
Association entre les gènes différentiellement exprimés et les niveaux d’anticorps
Une série distincte d’expériences a été menée pour évaluer si la réponse de l’hôte aux anticorps anti-spike peut influencer l’expression différentielle spécifique aux symptômes des gènes dans les plasmocytes.
L’analyse a révélé une corrélation significative entre la réponse des anticorps et les gènes associés à la plupart des symptômes de grappes divers, à l’exception des éruptions cutanées et de la perte de l’odorat/du goût. En revanche, aucune corrélation de ce type n’a été observée pour les gènes associés aux problèmes pulmonaires et à la pneumonie.
Importance de l’étude
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude révèlent que la réponse de l’hôte à une infection aiguë par le SRAS-CoV-2 est directement associée à l’apparition de longs symptômes de COVID. L’étude identifie deux ensembles distincts de longs symptômes COVID – l’un dépend principalement des taux sanguins d’anticorps anti-pics, et l’autre est indépendant des anticorps.
De plus, l’étude met en évidence l’importance des signatures d’expression génique en phase aiguë dans les plasmocytes pour induire de longs symptômes de COVID.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.
