Dans une étude récente en Natureles chercheurs rapportent des changements significatifs dans l’écologie et l’évolution des virus H5 de l’influenza aviaire hautement pathogène (IAHP) en utilisant une combinaison d’approches spatiales, épidémiologiques et génomiques.
Étude: La résurgence épisodique du virus hautement pathogène de la grippe aviaire H5. Crédit d’image : Jeannette Katzir Photog/Shutterstock.com
Arrière-plan
Les virus de la grippe A sont des virus à acide ribonucléique (ARN) de sens négatif, simple brin et segmentés. Typiquement, ces virus sont caractérisés par l’antigénicité de leur hémagglutinine (HA) et la neuraminidase (N / A) protéines de surface.
Les sous-types H5 et H7 des virus de l’IAHP ont évolué à partir des virus de la grippe aviaire faiblement pathogènes (LPAI), la plupart de ces épidémies virales étant contenues grâce à des événements d’abattage ou de mortalité. Bien que ces virus se propagent généralement parmi les volailles, leur propagation chez les oiseaux aquatiques sauvages, en particulier le clade 2 du virus H5 HA souche, a été régulièrement signalée depuis 2005. Cela a conduit à la transmission épisodique de l’IAHP dans toute l’Asie, l’Europe, l’Afrique et, plus récemment, l’Amérique du Nord et du Sud.
Plusieurs H5 HA virus du clade 2.3.4.4 avec N / A des sous-types tels que H5N2, H5N6 et H5N8 ont contribué aux épidémies virales dans toute l’Asie depuis 2014. Ces virus semblaient présenter une adaptation accrue et une virulence réduite chez les canards sauvages par rapport aux souches H5N1 antérieures ; cependant, les virus du clade 2.3.4.4b H5N8 identifiés depuis 2016 en Chine ont été associés à une virulence accrue chez les canards.
Plus récemment, le H5N1 a été responsable de nombreuses épidémies chez diverses espèces d’oiseaux sauvages sur plusieurs continents. En fait, il a été démontré que ces virus se propagent aux carnivores sauvages, aux élevages de visons et aux animaux marins, augmentant ainsi le risque de zoonose continue et de futures pandémies.
Résultats de l’étude
Les chercheurs ont utilisé les données sur les épidémies signalées à l’Organisation des Nations Unies pour l’alimentation et l’agriculture (FAO) et à l’Organisation mondiale de la santé animale (WOAH), ainsi que des données obtenues à partir de 10 000 génomes entiers, pour mieux comprendre l’écologie et les tendances évolutives de l’IAHP. Les données de la FAO et de la WOAH ont indiqué que les virus H5N8 étaient principalement responsables de plusieurs foyers signalés en 2004-2005, 2016-2017 et 2020-2021, tandis que le H5N6 était responsable d’un foyer d’oiseaux sauvages en 2016-2017.
Le H5N1 a remplacé presque tous les virus IAHP H5 depuis 2021, avec plus de 400 foyers signalés chaque mois au cours de la saison 2021-2022. Alors que ces épidémies se poursuivent jusqu’en 2023, le nombre d’espèces d’oiseaux sauvages infectées par ces virus a également augmenté dans toutes les régions touchées.
La vitesse de dispersion des clades HPAI H5 chez les oiseaux sauvages était supérieure à celle des oiseaux domestiques, ce qui indique que ces oiseaux sont souvent responsables d’une dissémination plus rapide sur de longues distances des virus HPAI H5. En 2020, la vitesse de diffusion du 2.3.4.4b chez les oiseaux sauvages était près de trois fois supérieure à celle des oiseaux domestiques. Cette vitesse de dispersion accrue a été attribuée à la transmission généralisée de l’IAHP H5N8 à travers l’Europe et l’Asie et, par la suite, à l’émergence de l’IAHP H5N1.
Il est important de noter que la vitesse de dispersion des virus chez les oiseaux domestiques est directement liée au commerce de la volaille et à l’activité humaine qui y est associée. En comparaison, la transmission des virus de l’IAHP dans les populations d’oiseaux migrateurs est influencée par des facteurs écologiques tels que les changements climatiques et saisonniers. Le changement climatique contribuera probablement à la transmission des virus IAHP H5 chez les oiseaux sauvages ; par conséquent, de futures études sont nécessaires pour évaluer les schémas de migration actuels et la composition des espèces afin de mieux comprendre le risque de ces événements.
Conclusions
Comparés aux virus de la grippe qui infectent les mammifères, les virus LPAI chez les oiseaux aquatiques migrateurs évoluent continuellement. Cette tendance a été observée avec les virus LPAI adaptés à la volaille, ce qui a conduit à une augmentation significative des infections de mammifères par l’IAHP H5, ce qui a accru les préoccupations de santé publique.
Les résultats de l’étude indiquent que 2.3.4.4b continue de se propager de l’Asie vers l’Afrique, soulignant ainsi l’importance d’étendre les efforts actuels de surveillance génomique, qui restent limités à ce jour. En fait, malgré le nombre croissant d’épidémies d’IAHP H5 signalées au cours des dernières années, seulement environ 50 % de ces épidémies et 0,2 % des cas ont été séquencés.
Comprendre les changements dans les caractéristiques écologiques et évolutives des virus IAHP H5Nx, qui, à leur tour, renforcent et maintiennent leur transmission chez les oiseaux sauvages, ainsi que les conséquences de diverses pratiques de vaccination des volailles avec une absorption variable, sera essentiel pour atténuer les futures épidémies d’IAHP. , qui soulèvent des risques zoonotiques, épizootiques et pandémiques imprévus.
