Dans une récente étude publiée sur Prépublications avec The Lancet*, les chercheurs ont évalué la prévalence des réinfections par le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) dans la province de Modène, en Italie. Ils ont également réalisé un aperçu des revues systématiques (RS) pour résumer les connaissances existantes.
Sommaire
Contexte
Des réinfections ont été signalées chez des patients diagnostiqués avec la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) après leur sortie de l’hôpital ou même après plusieurs semaines de rétablissement clinique. Des facteurs tels que la diminution des anticorps et l’émergence de variants mutants du SRAS-CoV-2 contribuent au développement de réinfections. L’évaluation de la prévalence des réinfections pourrait guider les décisions et les politiques de santé publique pour atténuer le COVID-19.
À propos de l’étude
Dans la présente étude observationnelle, les chercheurs ont utilisé l’approche d’analyse des mégadonnées pour évaluer les taux de réinfection par le SRAS-CoV-2 chez les résidents de la province de Modène. Ils ont également examiné les revues systématiques existantes qui ont signalé une réinfection par le SRAS-CoV-2, afin de fournir un résumé des résultats existants de la réinfection par le SRAS-CoV-2.
L’équipe a analysé rétrospectivement les rapports des tests d’écouvillonnage oropharyngés ou nasopharyngés qui ont été effectués au Département de médecine de laboratoire de l’USL de Modène pour la recherche moléculaire sur l’acide ribonucléique (ARN) du SRAS-CoV-2 entre le 1er janvier 2021 et le 30 juin. , 2021. Dans les études, l’ARN des écouvillons nasopharyngés et oropharyngés a d’abord été extrait et soumis à des tests qualitatifs de transcription inverse-réaction en chaîne par polymérase (qRT-PCR) pour générer des copies amplifiées d’acide désoxyribonucléique complémentaire (ADNc).
Les auteurs ont choisi des personnes qui avaient des rapports RT-PCR positifs initiaux, négatifs ultérieurs et seconds positifs. Ils ont considéré qu’une réinfection se produisait si le deuxième rapport RT-PCR était positif trois mois après le premier rapport chez des personnes considérées comme guéries ou un test RT-PCR positif effectué > 45 jours après le premier test positif, accompagné d’une exposition épidémiologique ou symptômes associés.
L’analyse des données a été effectuée jusqu’au 22 février 2022. Des données sur l’état de la vaccination des individus positivement réinfectés par le SRAS-CoV-2 ont également été obtenues. Les personnes ont été regroupées dans les tranches d’âge suivantes : moins de 14 ans, 15 à 29 ans, 30 à 49 ans, 50 à 69 ans et >70 ans.
De plus, des données ont été recherchées dans la base de données Medline à l’aide de mots-clés tels que « COVID-19, « SARS-CoV-2 » et « réinfection » pour les SR publiés entre 2020 et 2022. L’équipe a également examiné les listes de référence des SR potentiellement éligibles. Les SR inclus ont rapporté le taux de réinfections, mentionné la stratégie de recherche et rapporté des informations adéquates, y compris les définitions de la réinfection et les estimations regroupées du nombre total de réinfections. Il n’y avait aucune restriction d’âge, de cadre d’étude ou de langue. Les SR ont été exclus s’ils étaient de type narratif, utilisaient des modèles animaux ou des spécimens évalués.
Des données ont été obtenues à partir des SR sélectionnés sur les éléments suivants : caractéristiques des SR (année, pays, auteurs) ; définition de la réinfection ; conception de l’étude (cohorte, rapport de cas); caractéristiques des participants (symptômes, taille de l’échantillon, sexe, âge); résultats (nombre de réinfections, période entre l’infection initiale et l’infection suivante).
La qualité de chaque SR a été déterminée à l’aide de l’outil A MeaSurement Tool to Assess Systematic Reviews (AMSTAR). La fréquence des réinfections par le SRAS-CoV-2 a été évaluée et les données ont été stratifiées en sous-groupes en fonction du statut vaccinal des individus. Le taux de réinfection a été calculé comme la proportion d’individus réinfectés par rapport au nombre d’individus positifs au premier test. L’aperçu était basé sur les méthodes Cochrane et les résultats ont été rapportés à l’aide de la liste de contrôle PRISMA (Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses).
Résultats
Au cours de la période d’étude de 18 mois, 178 948 personnes ont subi une RT-PCR, dont 20 % avaient reçu au moins une dose de vaccin COVID-19 avant le 30 juin, en particulier les personnes âgées de plus de 70 ans.
Vingt pour cent des individus avaient des rapports PCR positifs, dont cinq étaient vaccinés, et la charge virale la plus élevée a été observée chez les individus âgés de 50 à 69 ans (23%). Parmi les individus vaccinés, 5% d’entre eux avaient un rapport PCR positif.
Lors du premier test, plus de 35 000 (20 %) personnes étaient positives pour le SRAS-CoV-2. Cependant, des réinfections ont été signalées chez seulement 1 258 patients (3,5 %) ; la majorité étaient des enfants de moins de 14 ans non vaccinés et des individus âgés de 30 à 49 ans (33%), dont 66% étaient vaccinés. Les réinfections étaient significativement plus élevées chez les personnes non vaccinées (1,1 %) que chez les personnes vaccinées (0,6 %).
Les intervalles de temps entre les rapports RT-PCR positifs initiaux et ultérieurs étaient de 248 jours pour les adultes âgés de plus de 70 ans et de 313 jours pour les enfants de moins de 14 ans, indiquant que la population âgée était la plus vulnérable aux réinfections par le SRAS-CoV-2.
Un total de 22 SR ont été identifiés dans la recherche de données, dont trois ont été exclus en raison de leur inéligibilité. De plus, 10 SR ont été exclus et, par conséquent, seuls neuf SR ont été pris en compte pour l’aperçu. Parmi les SR sélectionnés, cinq SR, trois SR et un SR étaient respectivement de qualité moyenne, faible et très faible. Les neuf SR sélectionnés ont confirmé que les réinfections par le SRAS-CoV-2 étaient rares.
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont montré que bien qu’une infection et une vaccination antérieures par le SRAS-CoV-2 confèrent une protection contre les réinfections, le risque de réinfection est réel, bien que rare.
*Avis important
Les prépublications avec The Lancet publient des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
